-
Метагенамнае секвенаванне (NGS)
Метагеном адносіцца да сукупнасці агульнага генетычнага матэрыялу змешанага супольнасці арганізмаў, такога як метагеном навакольнага асяроддзя, метагеном чалавека і г. д. Ён змяшчае геномы мікраарганізмаў, якія можна культываваць, і некультурных.Метагеномнае секвенаванне - гэта малекулярны інструмент, які выкарыстоўваецца для аналізу змешаных геномных матэрыялаў, вынятых з узораў навакольнага асяроддзя, які дае падрабязную інфармацыю аб разнастайнасці і колькасці відаў, структуры папуляцыі, філагенетычных адносінах, функцыянальных генах і карэляцыйнай сетцы з фактарамі навакольнага асяроддзя.
Платформа:Illumina NovaSeq6000
-
Метагеномнае секвенаванне-Нанопор
Метагеноміка - гэта малекулярны інструмент, які выкарыстоўваецца для аналізу змешаных геномных матэрыялаў, вынятых з узораў навакольнага асяроддзя, які дае падрабязную інфармацыю аб разнастайнасці і колькасці відаў, структуры папуляцыі, філагенетычных сувязях, функцыянальных генах і карэляцыйнай сетцы з фактарамі навакольнага асяроддзя і г.д. Нядаўна была прадстаўлена платформа для секвенавання нанапор. да метагеномных даследаванняў.Яго выбітная прадукцыйнасць у даўжыні чытання значна палепшыла метагеномны аналіз ніжэй па плыні, асабліва зборку метагенома.Выкарыстоўваючы перавагі даўжыні чытання, метагенамічнае даследаванне на аснове Nanopore дазваляе дасягнуць больш бесперапыннай зборкі ў параўнанні з метагеномікай стрэльбы.Было апублікавана, што метагеноміка на аснове Nanopore паспяхова генеравала поўныя і закрытыя бактэрыяльныя геномы з мікрабіомаў (Moss, EL, et. al.,Прырода Біятэхн, 2020)
Платформа:Nanopore PromethION P48
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-PacBio
Субадзінак на 16S і 18S рРНК, які змяшчае як высокакансерваваныя, так і гіперваріабельныя вобласці, з'яўляецца ідэальным малекулярным адбіткам пальца для ідэнтыфікацыі пракарыётаў і эукарыётаў.Выкарыстоўваючы перавагі секвенавання, гэтыя амплікёны могуць быць арыентаваны на захаваныя часткі, а гіпер-зменныя вобласці могуць быць цалкам ахарактарызаваны для ідэнтыфікацыі мікробаў, што спрыяе даследаванням, якія ахопліваюць аналіз разнастайнасці мікробаў, сістэматыку, філагенію і г.д. Аднамолекулярная ў рэжыме рэальнага часу (SMRT ) секвеніраванне платформы PacBio дазваляе атрымліваць высокадакладныя доўгія чытанні, якія могуць ахопліваць поўнаметражныя ампліконы (прыкладна 1,5 Кб).Пашырэнне ўяўлення аб генетычным полі значна палепшыла разрозненне ў анатацыі відаў у супольнасці бактэрый і грыбоў.
Платформа:PacBio Sequel II
-
16S/18S/ITS ампліконнае секвенаванне-NGS
Секвенаванне ампліконаў 16S/18S/ITS накіравана на выяўленне філагенезу, таксанаміі і колькасці відаў у мікробным супольнасці шляхам даследавання ПЦР-прадуктаў генетычных маркераў хатняй гаспадаркі, якія ўтрымліваюць як вельмі размоўныя, так і гипервариабельныя часткі.Увядзенне гэтых дасканалых малекулярных адбіткаў пальцаў Woeses і соавт. (1977) дае магчымасць прафілявання мікрабіома без ізаляцыі.Секвенаванне 16S (бактэрыі), 18S (грыбы) і ўнутранага транскрыбаванага спейсера (ITS, грыбы) дазваляе ідэнтыфікаваць як віды ў вялікай колькасці, так і рэдкія і неідэнтыфікаваныя віды.Гэтая тэхналогія стала шырока ўжывальным і асноўным інструментам для ідэнтыфікацыі дыферэнцыяльнага мікробнага складу ў розных асяроддзях, такіх як рот чалавека, кішачнік, фекаліі і г.д.
Платформа:Illumina NovaSeq6000
-
Паўторнае секвенаванне ўсяго геному бактэрый і грыбоў
Паўторнае секвенаванне цэлага геному бактэрый і грыбоў з'яўляецца важным інструментам для завяршэння геномаў вядомых бактэрый і грыбоў, а таксама для параўнання некалькіх геномаў або для картаграфавання геномаў новых арганізмаў.Вельмі важна секвенаваць цэлыя геномы бактэрый і грыбоў, каб стварыць дакладныя эталонныя геномы, правесці ідэнтыфікацыю мікробаў і іншыя параўнальныя даследаванні геному.
Платформа: Illumina NovaSeq 6000
-
Геном грыбоў
Biomarker Technologies забяспечвае абследаванне геному, тонкі геном і поўны геном грыбоў у залежнасці ад канкрэтнай мэты даследавання.Секвенаванне, зборка і функцыянальная анатацыя геному могуць быць дасягнуты шляхам камбінавання паслядоўнасці наступнага пакалення + секвенавання трэцяга пакалення для дасягнення высокаўзроўневай зборкі геному.Тэхналогія Hi-C таксама можа быць выкарыстана для палягчэння зборкі геному на ўзроўні храмасом.
Платформа:PacBio Sequel II
Nanopore PromethION P48
Illumina NovaSeq 6000
-
Поўны геном бактэрый
Biomarker Technologies прадастаўляе паслугу секвенавання па пабудове поўнага геному бактэрый з нулявым разрывам.Асноўны працоўны працэс пабудовы поўнага геному бактэрый уключае секвенаванне трэцяга пакалення, зборку, функцыянальную анатацыю і пашыраны біяінфарматычны аналіз, які выконвае канкрэтныя даследчыя мэты.Больш поўнае прафіляванне геному бактэрый дае магчымасць раскрыць фундаментальныя механізмы, якія ляжаць у іх біялагічных працэсах, што таксама можа стаць каштоўным арыенцірам для геномных даследаванняў вышэйшых эўкарыётаў.
Платформа:Nanopore PromethION P48 + Illumina NovaSeq 6000
PacBio Sequel II
