мРНК-секвенаванне (NGS) – De novo

Секвенаванне мРНК дазваляе прафіляваць усе транскрыпты мРНК у клетках пры пэўных умовах і з'яўляецца шырока выкарыстоўванай тэхналогіяй у розных галінах даследаванняў. Канвеер BMKCloud De novo мРНК-секвенавання прызначаны для аналізу бібліятэк секвенавання, узбагачаных полі-А, калі эталонны геном недаступны. Канвеер пачынаецца з кантролю якасці, а затым...дэ-новазборка транскрыптаў і адбор набору ўнігенаў. Аналіз структуры ўнігенаў прадказвае кадуючую паслядоўнасць (CDS) і простыя паўторы паслядоўнасці (SSR). Пасля гэтага аналіз дыферэнцыяльнай экспрэсіі знаходзіць дыферэнцыяльна экспрэсаваныя гены (DEG) сярод правераных умоў, а затым выконвае функцыянальную анатацыю і ўзбагачэнне DEG для атрымання біялагічнай інфармацыі.