Поўнаметражная стэнаграма Pacbio

Поўнаметражная транскрыптавая паслядоўнасць Pacbio, ISOSEQ, дазваляе дакладна ідэнтыфікаваць ізаформы стэнаграмы, праліваючы святло на альтэрнатыўнае полиаденилирование і сплайсинг, а таксама прыводзіць да больш дакладнага аналізу экспрэсіі генаў. Поўнаметражны трубаправод BMKCloud Pacbio прызначаны для аналізу бібліятэк кДНК у рэжыме кругавой паслядоўнасці кансенсусу (CCS) і ідэнтыфікуе паўнавартасныя нехімерныя (FLNC) паслядоўнасці, якія потым кластаюцца ў непрадукцыйныя стэнаграмы. Наступны аналіз BUSCO ацэньвае паўнату стэнаграмы. З сабранага стэнаграмы праводзіцца некалькі аналізаў: альтэрнатыўнае сплайсинг, простая паўтарэнне паслядоўнасці (SSR), прагназаванне lncRNA і адпаведныя мэтавыя гены, прагназаванне новых генаў, аналіз сямейства генаў, аналіз фактару транскрыпцыі і функцыянальную анатацыю стэнаграмаў.