Поўнапамерны транскрыптом Pacbio

Поўнадаўжыннае секвенаванне транскрыптомаў PacBio, Isoseq, дазваляе дакладна ідэнтыфікаваць ізаформы транскрыптаў, праліваючы святло на альтэрнатыўнае поліадэніляванне і сплайсінг, а таксама прыводзіць да больш дакладнага аналізу экспрэсіі генаў. Канвеер поўнадаўжыннага транскрыптома BMKCloud PacBio прызначаны для аналізу бібліятэк кДНК, секвенаваных у рэжыме цыклічнага кансенсуснага секвенавання (CCS), і ідэнтыфікуе поўнадаўжынныя нехімерныя (FLNC) паслядоўнасці, якія затым кластарызуюцца ў нелішнія транскрыпты. Наступны аналіз BUSCO ацэньвае паўнату зборкі транскрыптома. З сабранага транскрыптома выконваецца некалькі аналізаў: альтэрнатыўны сплайсінг, просты паўтор паслядоўнасці (SSR), прагназаванне доўгай некротычнай РНК (lncRNA) і адпаведных мэтавых генаў, прагназаванне новых генаў, аналіз сямейства генаў, аналіз транскрыпцыйных фактараў і функцыянальная анатацыя транскрыптаў.