Секвеніраванне ўсяго геному раслін/жывёл
1. Перавагі абслугоўвання
Шырокі вопыт секвенирования геному для больш чым 1000 відаў.
Больш за 800 апублікаваных выпадкаў з назапашвальным імпакт-фактарам больш за 4000.
Усёабдымны аналіз біяінфарматыкі на варыяцыйны выклік і аналіз функцый.
2. Спецыфікацыі абслугоўвання
| Платформа | Бібліятэка | Рэкамендуемая глыбіня паслядоўнасці | |
| Ілюміна | PE 150 | Для SNP выклік InDel ≥ 10x Для SV, званкі ў CNY ≥ 30x
| |
| Нанапор
| 8 кб | Для SV, званкі ў CNY ≥ 20x | |
| Пакбіё | CCS | 15 кб | Для званкоў SNP, InDel, SV, CNY ≥ 10x |
3. Узор патрабаванняў
| Платформа | Канц.(нг/μL)
| Колькасць (нг)
| Чысціня
| Агарозный гель
| ||
| OD260/280 | OD260/230 | 1. Выразная асноўная паласа без або з абмежаваннемдэградацыя назіраецца на гелі. 2. Адсутнасць або абмежаванае заражэнне РНК або бялком
| ||||
| Ілюміна | ≥1 | ≥30
| - | - | ||
| Нанапор
| ≥30 | Залежыць ад выхаду даных 10 мкг / клетка | 1,7-2,2 | ≥1,5 | ||
| Пакбіё | CCS | ≥50 | 1,7-2,2 | 1,8-2,5 | ||
4. Біяінфармацыйны аналіз
5. Паток паслуг
Дастаўка ўзору
Вылучэнне ДНК
Будаўніцтва бібліятэкі
Секвеніраванне
Аналіз дадзеных
Дастаўка даных
1) Статыстыка картаграфавання геному
Табліца 1 Статыстыка вынікаў картаграфавання
Малюнак 1. Размеркаванне памеру ўстаўкі і ахопу чытанняў.
2) Варыятыўнае выяўленне
Малюнак 2 Статыстыка і анатацыя SNP/INDEL/SV сярод узораў
Малюнак 3. Размеркаванне варыяцый па ўсім геному
3) Функцыянальнае анатаванне варыяцый
| 2019 год | Сувязі з прыродай | Рэсеквенаванне поўнага геному паказвае паходжанне Brassica napus і генетычныя локусы, якія ўдзельнічаюць у яго паляпшэнні |
| 2020 год | PNAS | Эвалюцыйнае паходжанне і гісторыя прыручэння залатых рыбак (Carassius auratus) |
| 2021 год | Часопіс біятэхналогіі раслін | Эталонныя геномы двух культывуюцца відаў джуту |
| 2021 год | Часопіс біятэхналогіі раслін | Геномныя прыкметы алапаліплоідаў раслінных і алейных культур Brassicajuncea і генетычныя локусы, якія кантралююць назапашванне глюкозінолатаў |
| 2019 год | Малекулярны завод | Рэсеквеніраванне поўнага генома сусветнай калекцыі ўзораў рапсу паказвае генетычную аснову іх дывергенцыі па экатыпах |
| 2022 год | Даследаванні садаводства | Аналіз геномных асацыяцый дае малекулярнае ўяўленне аб натуральных варыяцыях памеру кавуновага насення |
| 2021 год | Часопіс эксперыментальнай батанікі | Агульнагеномнае даследаванне асацыяцый вызначае варыянты GhSAD1, якія забяспечваюць холадаўстойлівасць бавоўны |
| 2021 год | Часопіс эксперыментальнай батанікі | Агульнагеномнае даследаванне асацыяцый і параўнанне транскрыптаў выявілі новыя гены QTL і кандыдаты, якія кантралююць памер пялёсткаў у рапсу |
