-
Імунапрэцыпітацыйнае секвенаванне храмаціну (ChIP-seq)
ChIP-Seq забяспечвае геномнае прафіляванне ДНК-мішэняў для мадыфікацыі гістонаў, фактараў транскрыпцыі і іншых бялкоў, звязаных з ДНК.Ён спалучае ў сабе селектыўнасць імунапрэцыпітацыі храмаціну (ChIP) для аднаўлення спецыфічных комплексаў бялок-ДНК з магутнасцю секвенирования наступнага пакалення (NGS) для высокапрадукцыйнага секвенирования адноўленай ДНК.Акрамя таго, паколькі комплексы бялок-ДНК здабываюцца з жывых клетак, сайты звязвання можна параўнаць у розных тыпах клетак і тканінах або ў розных умовах.Прымяненне вар'іруецца ад рэгуляцыі транскрыпцыі да шляхоў развіцця да механізмаў захворвання і не толькі.
Платформа: платформа Illumina NovaSeq
-
Бісульфітнае секвенаванне ўсяго геному
Метыляванне ДНК у пятай пазіцыі ў цытазіне (5-mC) мае фундаментальны ўплыў на экспрэсію генаў і клетачную актыўнасць.Анамальныя схемы метилирования былі звязаны з некалькімі станамі і захворваннямі, такімі як рак.WGBS стаў залатым стандартам для вывучэння агульнагеномнага метылявання пры раздзяленні адной базы.
Платформа: платформа Illumina NovaSeq
-
Аналіз храмаціну, даступнага для транспазазы, з секвенаваннем высокай прапускной здольнасці (ATAC-seq)
ATAC-seq - гэта высокапрадукцыйны метад секвенирования для аналізу агульнагеномнай даступнасці храмаціну, што важна для глабальнага эпігенетычнага кантролю экспрэсіі генаў.Адаптары секвенирования ўстаўляюцца ў адкрытыя вобласці храмаціну гіперактыўнай транспозазы Tn5.Пасля ПЦР-ампліфікацыі ствараецца бібліятэка секвенирования.Усе адкрытыя вобласці храмаціну могуць быць атрыманы ў пэўных прасторава-часавых умовах, а не толькі ў месцах звязвання фактару транскрыпцыі або пэўнай вобласці, мадыфікаванай гістонам.
-
Секвеніраванне бісульфітаў са зніжанай рэпрэзентацыяй (RRBS)
Даследаванне метылявання ДНК заўсёды было гарачай тэмай у даследаванні хвароб і цесна звязана з экспрэсіяй генаў і фенатыпічнымі прыкметамі.RRBS - гэта дакладны, эфектыўны і эканамічны метад даследавання метылявання ДНК.Узбагачэнне астраўковых абласцей промотора і CpG ферментатыўным расшчапленнем (Msp I) у спалучэнні з бісульфітным секвенированием забяспечвае выяўленне метылявання ДНК з высокім дазволам.
Платформа: платформа Illumina NovaSeq
