Секвенаванне малых РНК - Illumina
Асаблівасці
● Падрыхтоўка бібліятэкі для выбару памеру.
● Біяінфарматычны аналіз, сканцэнтраваны на прагназаванні міРНК і мішэняў.
Перавагі абслугоўвання
●Шырокі вопытМы апрацавалі больш за 300 узораў розных тыпаў. У кожны праект мы ўкладваем свой багаты вопыт.
●Строгі кантроль якасціМы ўкараняем асноўныя кантрольныя пункты на ўсіх этапах, ад падрыхтоўкі ўзораў да падрыхтоўкі бібліятэкі, секвенавання і біяінфарматыкі. Наш старанны маніторынг гарантуе атрыманне пастаянна высакаякасных вынікаў.
●Комплексны біяінфарматычны аналіз:Гэта дазваляе ідэнтыфікаваць як вядомыя, так і новыя міРНК, ідэнтыфікаваць мішэні міРНК, а таксама адпаведную функцыянальную анатацыю і ўзбагачэнне з дапамогай некалькіх баз дадзеных (KEGG, GO).
●Пасляпродажная падтрымкаМы разумеем, наколькі важна быць прысутным на праекце, таму нашы абавязацельствы распаўсюджваюцца і на завяршэнне праекта, бо мы прапануем 3-месячны пасляпродажны перыяд. На працягу гэтага часу мы прапануем суправаджэнне праекта, дапамогу ў ліквідацыі непаладак і сесіі пытанняў і адказаў, каб адказаць на любыя пытанні, звязаныя з вынікамі.
Патрабаванні да ўзораў і дастаўка
| Бібліятэка | Платформа | Рэкамендаваныя дадзеныя | Кантроль якасці дадзеных |
| Выбраны памер | Ілюміна SE50 | 10–20 мільёнаў праглядаў | Q30≥85% |
Патрабаванні да ўзораў:
Нуклеатыды:
| Канцэнтрацыя (нг/мкл) | Колькасць (мкг) | Чысціня | Цэласнасць |
| ≥ 80 | ≥ 0,8 | АД260/280=1,7-2,5 АД260/230=0,5-2,5 Абмежаванае або адсутнае забруджванне бялком або ДНК на гелі. | RIN≥6,0; 5,0≥28S/18S≥1,0; абмежаванае або адсутнае ўзвышэнне базавай лініі |
● Расліны:
Корань, сцябло або пялёстак: 450 мг
Ліст або насенне: 300 мг
Фрукты: 1,2 г
● Жывёла:
Сэрца або кішачнік: 450 мг
Вантробы або мозг: 240 мг
Мышцы: 600 мг
Косці, валасы або скура: 1,5 г
● Членістаногія:
Насякомыя: 9 г
Ракападобныя: 450 мг
● Цэльная кроў2 трубкі
● Клеткі: 106 клеткі
● Сыроватка і плазма:6 мл
Рэкамендаваная дастаўка ўзораў
Ёмістасць: цэнтрыфужная прабірка аб'ёмам 2 мл (не рэкамендуецца выкарыстоўваць алавяную фальгу)
Прыклад маркіроўкі: Група + паўтараць, напрыклад, A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Адгрузка:
1. Сухі лёд: Узоры неабходна спакаваць у пакеты і закапаць у сухі лёд.
2. Прабіркі для стабілізацыі РНК: узоры РНК можна высушыць у прабірцы для стабілізацыі РНК (напрыклад, RNAstable®) і перавозіць пры пакаёвай тэмпературы.
Працоўны працэс абслугоўвання
Дызайн эксперыменту
Дастаўка ўзораў
Экстракцыя РНК
Будаўніцтва бібліятэкі
Секвенаванне
Аналіз дадзеных
Пасляпродажнае абслугоўванне
Біяінфарматыка
● Кантроль якасці неапрацаваных дадзеных
● Класіфікацыя малых РНК
● Аналіз экспрэсіі міРНК і дыферэнцыяльнай экспрэсіі
● Ген-мішэнь міРНК і анатацыя дыферэнцыяльна экспрэсаванага гена-мішэні міРНК
● Анатацыя генаў-мішэняў і ўзбагачэнне функцыі генаў міРНК з дыферэнцыяльнай экспрэсіяй
Ідэнтыфікацыя міРНК: структура і глыбіня
Дыферэнцыяльная экспрэсія міРНК — іерархічная кластэрызацыя
Функцыянальная анатацыя мішэні дыферэнцыяльна экспрэсаваных міРНК
Азнаёмцеся з дасягненнямі ў даследаваннях, якія праводзяцца дзякуючы паслугам секвенавання sRNA ад BMKGene, з дапамогай спецыяльна адабранай калекцыі публікацый.
Чэнь, Х. і інш. (2023) «Вірусныя інфекцыі інгібіруюць біясінтэз сапанінаў і фотасінтэз у Panax notoginseng».Фізіялогія і біяхімія раслін, 203, с. 108038. doi: 10.1016/J.PLAPHY.2023.108038.
Лі, Х. і інш. (2023) «Раслінны бялок FREE1, які змяшчае дамен FYVE, асацыюецца з кампанентамі мікрапрацэсара для падаўлення біягенезу міРНК».Справаздачы EMBO, 24 (1). doi: 10.15252/EMBR.202255037/SUPPL_FILE/EMBR202255037-SUP-0004-SDATAFIG4.TIF.
Ю, Дж. і інш. (2023) «МікраРНК Ame-Bantam-3p кантралюе развіццё лічынак-кукалак, уздзейнічаючы на ген множных даменаў, падобных да эпідэрмальнага фактару росту 8 (megf8), у меданоснай пчалы Apis mellifera».Міжнародны часопіс малекулярных навук, 24(6), с. 5726. doi: 10.3390/IJMS24065726/S1.
Zhang, M. et al. (2018) «Інтэграваны аналіз міРНК і генаў, звязаных з якасцю мяса, паказвае, што Gga-MiR-140-5p уплывае на ўнутрымышачнае адкладанне тлушчу ў курэй».Клетачная фізіялогія і біяхімія, 46 (6), стар. 2421–2433. doi: 10.1159/000489649.
