Абмежаваная па часе акцыя: універсальнае рашэнне для зборкі геному T2T
Дзякуючы хуткаму развіццю тэхналогіі геномнага секвенавання і алгарытмаў зборкі, зборка геному «ад тэламеры да тэламеры» (T2T) стала залатым стандартам для высакаякасных даследаванняў геному, вырашаючы даўнюю праблему разрываў у традыцыйнай зборцы геному (рэгіёны з высокай колькасцю паўтораў і высокім утрыманнем GC, такія як тэламеры і цэнтрамеры, патрабуюць звышдоўгіх дадзеных секвенавання для паспяховага ахопу іх). Каб спрыяць папулярызацыі тэхналогіі T2T у акадэмічных даследаваннях, атрымаць больш поўныя паслядоўнасці геному і дазволіць выявіць раней нераспазнаныя гены і структурныя варыяцыі, мы запускаем гэтую абмежаваную па часе акцыю, прапаноўваючы эканамічна эфектыўнае універсальнае рашэнне для зборкі геному T2T для вашага віду, даючы вашым даследаванням поўную і дакладную інфармацыю.
Падрабязнасці пакета паслуг
●Секвенаванне
● Кароткія звесткі Illumina для Survey: 50X
● Паказчыкі PacBio HiFi для чарнавіка зборкі: 50X
● Hi-C для будаўнічых рыштаванняў: 100X
● Звышдоўгія чытанні з нанапорамі для запаўнення прабелаў: 2 ячэйкі
● Паслядоўнасць мРНК Illumina для анатацыі геному: 12 Гб / 1 пул
●Іерархічны аналіз
● Апытанне для ацэнкі асаблівасцей геному
● Зборка геному на ўзроўні кантыгаў
● Каркас для геному на ўзроўні храмасом
● Запаўненне прабелаў і ідэнтыфікацыя тэламер для геному T2T
● Ацэнка якасці геному T2T
● Геномная анатацыя для прагназавання генаў і геномных элементаў
● Падрабязная аналітычная справаздача з прафесійнай тэхнічнай інтэрпрэтацыяй
Вынік дэманстрацыі
Каб лепш зразумець якасць нашай паслугі па зборцы геному T2T, мы прадстаўляем дэманстрацыйны вынік тыповага праекта:
•Канчатковы геном T2T складаецца з 19 храмасом агульнай даўжынёй 491,39 Мб і кантыга N50 даўжынёй 26,04 Мб. Усяго было ідэнтыфікавана 38 тэламер і 19 цэнтрамер. 19 храмасом — гэта храмасомы без прабелаў, якія злучаюць тэламеры.
•Вынікі ацэнкі зборкі сведчаць аб высокай паўнаце і дакладнасці сабранага геному: ацэнка BUSCO з выкарыстаннем базы дадзеных эмбрыяфіт OrthoDB 10 паказала паўнату геному 97,09%; значэнне QV геному складае 52,36. Значэнне LAI геному складае 18,93.
Прыдатнасць
•Прыдатныя вобласці даследаванняўБазавыя геномныя даследаванні, генетычнае ўдасканаленне сельскагаспадарчых культур, селекцыя жывёл, усе галіны раслін і жывёл, якія патрабуюць высакаякаснай зборкі геному.
•Прыдатныя відыПамер геному ≤ 1; млекакормячыя, звычайныя культуры, распаўсюджаныя садавіна і дыні, распаўсюджаныя лясныя дрэвы, прэснаводныя рыбы і г.д. Для атрымання падрабязнай інфармацыі аб іншых відах, калі ласка, звярніцеся да гл.
•Акцыя дзейнічае: кантракты падпісаны да 30 чэрвеня.
•Дадатковыя інструкцыіДля спецыяльных узораў (напрыклад, з высокай колькасцю паўторных паслядоўнасцей або нізкай якасцю ДНК) або індывідуальных патрэб у аналізе наша тэхнічная каманда прапануе персаналізаванае рашэнне з карэкціроўкай цаны ў залежнасці ад рэальных патрабаванняў праекта.
Пачніце зараз
Скарыстайцеся гэтай абмежаванай па часе прапановай і атрымайце высакаякасную паслугу па зборцы геному T2T па льготнай цане! Звяжыцеся з нашай тэхнічнай камандай, каб атрымаць падрабязную інфармацыю, адправіць інфармацыю аб узорах і атрымаць індывідуальную прапанову.
