-
Пристрастие към референтния геном: Защо е важен изборът на правилния референтен геном
Отклонение в референтния геном: Защо изборът на правилния референтен геном е важен Независимо дали извършвате секвениране на целия геном (WGS), РНК секвениране (RNA-seq) или секвениране с намалено представяне, като SLAF-seq, една от първите стъпки в анализа на данните е да подравните показанията на секвенирането с референтен ген...Прочетете още -
Декодиране на скрити геномни събития: Как химерното РНК секвениране разкрива структурни вариации, двигатели на рака и свързани с черти генни сливания
Декодиране на скрити геномни събития: Как химерното РНК секвениране разкрива структурни вариации, двигатели на рака и свързани с черти генни сливания Отвъд традиционната генна експресия: Откриване на неочакваното Повечето изследвания на РНК секвенирането се фокусират върху измерването на това кои гени са включени или изключени. Докато различните...Прочетете още -
Изучаване на туморната имунна микросреда: Как мулти-омиката трансформира изследванията на рака
Изучаване на туморната имунна микросреда: Как мулти-омиката трансформира изследванията на рака Развитието и прогресията на рака се влияят не само от генетични промени в туморните клетки, но и от сложната екосистема, която ги заобикаля: туморната микросреда (TME). TME се състои...Прочетете още -
Омикс стратегии в изследванията на водните животни
Омикс стратегии в изследванията на водните животни Водните животни обхващат риби, мекотели, ракообразни, бентосни безгръбначни и морски гръбначни. Те се характеризират със забележително видово разнообразие, уникални геномни характеристики и силна фенотипна пластичност в отговор на промените в околната среда...Прочетете още -
От маркерни гени до ДНК на цялата общност: Цялостно сравнение на метагеномното секвениране на ампликон и дробовик
От маркерни гени до ДНК на цялата общност: Цялостно сравнение на метагеномното секвениране с ампликон и „shotgun“ метод. Изследванията на микробните общности предоставят фундаментална основа за разкриване на скрити взаимодействия в почвата, водата, червата и други екологични екосистеми. За да се декодира...Прочетете още -
Епигенетика в реално време: Отключване на РНК модификации с директно секвениране на нанопори
Епигенетика в реално време: Отключване на РНК модификации с директно секвениране на нанопори. За да разберем напълно клетъчната функция, развитие и прогресия на заболяването, трябва да погледнем отвъд самата ДНК последователност и да изследваме допълнителните слоеве биологична информация, които регулират генната активност...Прочетете още -
Интегриране на нецелева протеомика и mRNA секвениране за по-задълбочено биологично знание
Интегриране на нетаргетна протеомика и mRNA секвениране за по-задълбочено биологично знание. Протеомиката е мощен инструмент за систематично изследване на биологични механизми. Чрез профилиране на протеини в голям мащаб, тя предоставя представа за биологичните процеси, протичащи в клетките. Въпреки това...Прочетете още -
Отключване на скрития език на РНК: Цялостно секвениране на цели транскриптоми за откриване на многослойни регулаторни механизми
Отключване на скрития език на РНК: Цялостно секвениране на целия транскриптом за откриване на многослойни регулаторни процеси отвъд генната експресия: Пълен поглед върху транскриптома. Съвременните биологични системи се регулират от много повече от гени, кодиращи протеини. Докато традиционните транскриптоми...Прочетете още -
Свързване на таксономията, функцията и метаболизма чрез мулти-омикс интеграция
Свързване на таксономия, функция и метаболизъм чрез мулти-омикс интеграция Нарастващото използване на множество омик технологии за изучаване на болести и екологични системи създаде нарастваща нужда от интегриране на набори от данни в различни слоеве на биологията. В изследванията на микробиома тази интеграция е...Прочетете още -
Astral-DIA: Предефиниране на високопроизводителната количествена протеомика
Astral-DIA: Предефиниране на високопроизводителната количествена протеомика Протеомиката се фокусира върху мащабното профилиране на всички протеини, експресирани в клетки, тъкани и организми, служейки като критична функционална връзка между генотипа и фенотипа. Протеините управляват почти всички биологични процеси, включително...Прочетете още -
От фрагмент до пълна дължина: Значението на TGS ONT и PacBio платформите за секвениране на иРНК
От фрагмент до пълна дължина: Значението на платформите TGS ONT и PacBio за секвениране на иРНК. В продължение на години платформите за секвениране с кратък разряд, включително Illumina и MGI, се прилагат широко в секвенирането на иРНК. Те се отличават с висока точност на базата, достатъчна дълбочина на секвениране и предимство по отношение на цената...Прочетете още -
Отвъд генома: дешифриране на метаболитни заболявания чрез мулти-омикс интеграция
Отвъд генома: Дешифриране на метаболитни заболявания чрез мулти-омикс интеграция Повечето метаболитни заболявания, като диабет тип 2 (T2D) и стеатотично чернодробно заболяване, свързано с метаболитна дисфункция (MASLD, преди NAFLD), се характеризират с нарушаване на системната хомеостаза, което нито един...Прочетете още -
Характеризиране на експресията на растителните гени в клетъчен контекст: Как пространствената транскриптомика позволява открития в изследванията на растенията
Характеризиране на генната експресия на растенията в клетъчен контекст: Как пространствената транскриптомика напредва в изследванията на растенията. Разбирането на развитието на растенията с клетъчна резолюция отдавна е ограничено от ключово предизвикателство: секвенирането на РНК в насипно състояние улавя цялостната генна експресия, но...Прочетете още
