Готови библиотеки на Illumina
Характеристики
●Платформи:Illumina NovaSeq 6000 и NovaSeq X Plus
●Режими на секвениране:PE150 и PE250
●Контрол на качеството на библиотеките преди секвениране
●Контрол на качеството на секвенирането и доставка:предоставяне на QC отчет и сурови данни във fastq формат след демултиплексиране и филтриране на Q30 показания
Предимства на услугата
●Универсалност на услугите за секвениране:Клиентът може да избере да секвенира по лента, проточна клетка или по количество необходими данни (частично секвениране по лента).
●Обширен опит с платформата за секвениране Illumina:с хиляди затворени проекти с различни видове.
●Предоставяне на отчет за контрол на качеството на секвенирането:с показатели за качество, точност на данните и цялостна производителност на проекта за секвениране.
●Процес на зряло секвениране:с кратко време за изпълнение.
●Строг контрол на качествотоНие прилагаме строги изисквания за контрол на качеството, за да гарантираме предоставянето на постоянно висококачествени резултати.
Примерни платформи
| Платформа | Проточна клетка | Режим на секвениране | Единица | Очаквана продукция |
| NovaSeq X | 10B (8 ленти) | ПЕ150 | Единична лента Частична лента | 375Gb / линия |
| 25B (8 ленти) | ПЕ150 | Единична лента Частична лента | 1000 Gb/лента | |
| NovaSeq 6000 | SP Проточна клетка (2 ленти) | ПЕ250 | Проточна клетка Единична лента Частична лента | 325-400 милиона прочитания / лента |
| S4 Проточна клетка (4 ленти) | ПЕ150 | Проточна клетка Единична лента Частична лента | ~800 Gb / линия |
Примерни изисквания
| Количество данни (X) | Концентрация (qPCR/nM) | Обем | |
| Частично последователно управление на лентите
| X ≤ 10 Гб | ≥ 1 nM | ≥ 25 μl |
| 10 Гб < X ≤ 50 Гб | ≥ 2 nM | ≥ 25 μl | |
| 50 Гб < X ≤ 100 Гб | ≥ 3 nM | ≥ 25 μl | |
| X > 100 Гб | ≥ 4 nM | ≥ 25 μl | |
| Последователност на лентите | Пер Лейн | ≥ 1,5 nM / библиотечен пул | ≥ 25 μl / библиотечен пул |
В допълнение към концентрацията и общото количество, е необходим и подходящ пиков модел.
Забележка: Секвенирането на ленти на библиотеки с ниско разнообразие изисква PhiX spike-in, за да се осигури надеждно извикване на бази.
Препоръчваме да изпращате предварително обединени библиотеки като образци. Ако е необходимо BMKGENE да извършва обединяване на библиотеки, моля, вижте
изискванията на библиотеката за частично подреждане на лентите.
Размер на библиотеката (карта на пиковете)
Основният пик трябва да е в рамките на 300-450 bp.
Библиотеките трябва да имат един основен пик, без замърсяване с адаптери и без димери на праймери.
Моля, свържете се с нас, ако вашите проби не отговарят на изискванията за изходен материал.
Работен процес на услугата
Контрол на качеството в библиотеката
Секвениране
Контрол на качеството на данните
Изпълнение на проекта
Доклад за контрол на качеството в библиотеката
Преди секвениране, оценка на количеството на библиотеката и фрагментацията се предоставя доклад за качеството ѝ.
Доклад за контрол на качеството на секвенирането
Таблица 1. Статистика за данните от секвенирането.
| Идентификационен номер на пробата | БМКИД | Сурови четения | Сурови данни (б.п.) | Чисти отчети (%) | Q20(%) | Q30(%) | GC(%) |
| C_01 | БМК_01 | 22 870 120 | 6 861 036 000 | 96,48 | 99.14 | 94.85 | 36.67 |
| C_02 | БМК_02 | 14 717 867 | 4 415 360 100 | 96,00 | 98,95 | 93.89 | 37.08 |
Фигура 1. Разпределение на качеството по прочитаните данни във всяка извадка
Фигура 2. Разпределение на базовото съдържание
Фигура 3. Разпределение на прочетеното съдържание в данните за секвениране
