Дълго некодиращо секвениране-Illumina
Предимства на услугата
●Съвместен анализ на mRNA и lncRNA: чрез комбиниране на количественото определяне на mRNA транскрипти с изследване на lncRNA и техните мишени е възможно да се получи задълбочен преглед на регулаторния механизъм, който е в основата на клетъчния отговор.
●Обширен експертен опит: Нашият екип внася богат опит във всеки проект, с опит в обработката на над 23 000 проби в BMK, обхващащи различни типове проби и lncRNA проекти.
●Строг контрол на качеството: Ние внедряваме основни контролни точки на всички етапи, от подготовка на проби и библиотека до секвениране и биоинформатика. Този щателен мониторинг гарантира предоставянето на постоянно висококачествени резултати.
●Поддръжка след продажбата: Нашият ангажимент се простира отвъд завършването на проекта с 3-месечен период на следпродажбено обслужване. През това време ние предлагаме проследяване на проекта, помощ при отстраняване на проблеми и сесии с въпроси и отговори, за да отговорим на всякакви въпроси, свързани с резултатите.
Примерни изисквания и доставка
| Библиотека | Платформа | Препоръчителни данни | Данни QC |
| рРНК изчерпана насочена библиотека | Ilumina PE150 | 10-16 Gb | Q30≥85% |
Нуклеотиди:
| Конц. (ng/μl) | Количество (μg) | Чистота | Почтеност |
| ≥ 80 | ≥ 0,8 | OD260/280=1,7-2,5 OD260/230=0,5-2,5 Ограничено или никакво протеиново или ДНК замърсяване, показано на гела. | RIN≥6.0; 5.0≥28S/18S≥1.0; ограничено или никакво повишение на базовата линия |
● Растения:
Корен, стъбло или венчелистче: 450 mg
Листа или семена: 300 mg
Плодове: 1,2 g
● Животно:
Сърце или черва: 450 mg
Вътрешни органи или мозък: 240 mg
Мускули: 600 мг
Кости, коса или кожа: 1,5 g
● Членестоноги:
Насекоми: 9гр
Ракообразни: 450 мг
● Цяла кръв:2 тръби
● Клетки: 106 клетки
● Серум и плазма: 6 мл
Препоръчителна доставка на мостри
Контейнер: центрофужна епруветка от 2 ml (не се препоръчва калаено фолио)
Примерно етикетиране: Групиране+репликат напр. A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Пратка:
1. Сух лед: Пробите трябва да бъдат опаковани в торби и заровени в сух лед.
2. РНК стабилни епруветки: РНК пробите могат да бъдат изсушени в РНК стабилизираща епруветка (напр. RNAstable®) и изпратени при стайна температура.
Работен поток на услугата
Дизайн на експеримента
Доставка на мостри
Екстракция на РНК
Изграждане на библиотека
Секвениране
Анализ на данни
Следпродажбени услуги
Биоинформатика
Анализ на диференциална генна експресия (DEGs).
Количествено определяне на експресията на lncRNA – групиране
Обогатяване на lncRNA целеви гени
Съвместен анализ на позицията на mRNA и lncRNA – графика на Circos (средният кръг е mRNA, а вътрешният кръг е lncRNA)
Разгледайте напредъка, улеснен от услугите за приравняване на lncRNA на BMKGene чрез подбрана колекция от публикации.
Ji, H. et al. (2020) „Идентифициране, функционално предсказване и ключова lncRNA проверка на lncRNA, свързани със студов стрес в черния дроб на плъхове“, Научни доклади 2020 10:1, 10(1), стр. 1–14. doi: 10.1038/s41598-020-57451-7.
Jia, Z. et al. (2021) „Интегративен транскриптомичен анализ разкрива имунния механизъм за резистентен на CyHV-3 щам на обикновен шаран“, Frontiers in Immunology, 12, p. 687151. doi: 10.3389/FIMMU.2021.687151/BIBTEX.
Wang, XJ и др. (2022) „Приоритетизиране, основано на интеграция на Multi-Omics, на конкурентни ендогенни мрежи за регулиране на РНК при дребноклетъчен рак на белия дроб: Молекулярни характеристики и кандидати за лекарства“, Frontiers in Oncology, 12, p. 904865. doi: 10.3389/FONC.2022.904865/BIBTEX.
Xiao, L. et al. (2020) „Генетична дисекция на мрежата за коекспресия на ген, лежаща в основата на фотосинтезата в Populus“, Plant Biotechnology Journal, 18 (4), стр. 1015–1026. doi: 10.1111/PBI.13270.
Zheng, H. et al. (2022) „Глобална регулаторна мрежа за нерегулирана генна експресия и анормално метаболитно сигнализиране в имунните клетки в микросредата на болестта на Грейвс и тиреоидит на Хашимото“, Frontiers in Immunology, 13, p. 879824. doi: 10.3389/FIMMU.2022.879824/BIBTEX.
