Метаболомика
Характеристики
●Не-целенасочена метаболомика (Discovery Metabolomics)
Базирана на технологията течна хроматография-масспектрометрия (LC-MS), нетаргетираната метаболомика позволява безпристрастно откриване на възможно най-много нискомолекулни метаболити в биологични проби, като клетки, тъкани, органи или телесни течности. Тя провежда сравнителен анализ между експериментални и контролни групи, скринирайки диференциалните метаболити чрез статистически анализ.
● Нетаргетна метаболомика за липиди
Използвайки технологията за течна хроматография-масспектрометрия (LC-MS),nЦеленасочената метаболомика за липиди постига безпристрастно откриване на възможно най-много липидни молекули в биологични проби, включително клетки, тъкани, органи или телесни течности.
● Широк-Целенасочена метаболомика
Тази услуга перфектно съчетава предимствата на високата резолюция и широкото покритие на нецелевата технология с високата чувствителност и възможностите за точно количествено определяне на целевата MRM (Multiple Reaction Monitoring) технология. Работният процес е следният: Първо, масспектрометрия с висока резолюция се използва за извършване на MS² сканиране с ултрависоко покритие върху проби, за да се получат MS² спектри на „всички“ метаболити. След това се извършва точна идентификация на метаболитите чрез комбиниране с MS² библиотека с висока резолюция (обхващаща над 25 000 метаболита, с множество стандартни MS² спектри с висока резолюция за всеки метаболит). След това, информация за йонните двойки на MRM се извлича от масспектрите, за да се създаде специфична библиотека за пробите. Накрая, тройна квадруполна масспектрометрия с MRM технология се прилага за точно количествено определяне.
● Целенасочена метаболомика
Таргетираната метаболомика се фокусира върху няколко целеви съединения или всички/частични метаболити, участващи в специфичен път. Използвайки стандартни вещества, тя установява метод за откриване със силна специфичност, висока чувствителност и добра повторяемост за количествено определяне и анализ на целевите съединения. Тя използва външен стандарт, комбиниран с вътрешен стандарт за абсолютно количествено определяне, с линейност на стандартната крива, достигаща над 0,99, и чувствителност до ниво ng/mL.
Предимства
●Разширена платформа за откриване
-Оборудван с висококачествени масспектрометри с висока резолюция и тройни квадруполни масспектрометри, позволяващи едновременно откриване и анализ на хиляди метаболити.
●Изчерпателни бази данни
- Публични бази данни: Обхващат METLIN, KEGG, HMDB, NP Atlas и Lipidmaps, обхващащи над 500 000 метаболита.
- ВътрешенБаза данни, специфична за растенията: Съдържа над 25 000 метаболита, включително първични и вторични метаболити.
- ВътрешенБаза данни, специфична за животни/медицински продукти: Включва над 12 000 метаболита.
●Строга система за контрол на качеството
-Строг контрол на качеството, обхващащ стабилността на инструмента, остатъците от веществото, QC PCA на пробата и корелационен анализ, за да се гарантира надеждно качество на данните.
●Висок капацитет за откриване на метаболити
- Не-Целенасочена метаболомика: Открива средно над 4200 метаболита на цикъл, идеално за изследване на неизвестни метаболити в проби и идентифициране на метаболити в сложни проби.
- Широк-Целенасочена метаболомика (растение): Открива средно над 2410 метаболита на цикъл, включително първични и вторични метаболити.
- Широк-Целенасочена метаболомика (животни): Открива средно над 1250 метаболита на цикъл.
- Целенасочена метаболомика: Панелизамножество категории метаболити.
●Цялостен анализ
-Предлага повече от 10 аналитични елемента и над 20 визуализиращи диаграми.
●Внимателно следпродажбено обслужване
-Предоставя консултации след продажбата и подкрепа при тълкуване на окончателния доклад.
Спецификации на услугата
| Решение | Платформа | Препоръчителни биологични реплики |
|---|---|---|
| Нецелева метаболомика | UHPLC-TOF-MS (Waters Xevo G2-XS QTof) | Растителна и микробна проба: ≥ 6 Животинска проба: ≥ 10 Клинична проба: ≥ 30 Всички биологични реплики на проби са анализирани независимо. |
| Широко насочена метаболомика | Вода Xevo G2-XS QTOF + AB Sciex QTRAP 6500+ | Растителна проба: ≥ 3 |
| Целенасочена метаболомика | UHPLC-QQQ-MS (AB Sciex QTRAP 6500+) GC-MS (Agilent 7890-5977, Agilent 7820-5977) | Растителна проба: ≥ 3 Проба от животни: ≥ 6 |
Примерни изисквания
Чудите се дали вашите мостри отговарят на нашите критерии? Кликнете тук, за да получите нашитенай-новите изисквания за примерни материали.
Работен поток на услугата
Събиране на проби
Екстракция на метаболити
Събиране на данни
Анализ на данни
Доставка на данни
1. Фонов шум и нискокачествена обработка на сурови данни
2. Оценка на качеството на данните
2.1 Анализ на главните компоненти
2.2 Оценка на възпроизводимостта
3. Анотация на метаболитите
3.1 Анотация на базата данни KEGG
3.2 Анотация на базата данни HMDB
3.3 Анотация на базата данни Lipidmaps
4. Анализ на данните от групирането на пробите (биологични повторения≥3)
4.1 Анализ на главните компоненти на групата
4.2 Ортогонален дискриминантен анализ с частични най-малки квадрати (OPLS-DA)
4.3 Групов диференциален метаболитен анализ
5. Диференциална селекция на метаболитите (биологични повторения≥3)
5.1 Анализ на диференциалната промяна в сгъването
5.2 Диаграма на диференциалния метаболит на вулкана
5.3 Диференциална топлинна карта на клъстериране на метаболити
5.4 Диаграма на диференциалната корелация на метаболитите
5.5 Диаграма на Z-скора на диференциалните метаболити
5.6 Анализ на диференциална радарна диаграма на метаболитите
5.7 Диаграма на диференциалната метаболитна цигулка
5.8 Диференциална метаболитна кутия-диаграма
5.9 Функционална анотация и анализ на обогатяване на диференциалния метаболит KEGG
5.10 Анализ на ROC кривата
5.11 Диференциално клъстериране на метаболитни k-средни стойности
5.12 Диаграма на Вен за диференциални метаболити
1. Оценка на качеството на данните
↑Cанализ на корелациите(Тестова проба/проба за контрол на качеството)
↑Анализ на главните компоненти ↑Анализ на клъстеризацията на метаболитите
2. Анотация на метаболитите
↑Анотация на базата данни KEGG↑Анотация на базата данни HMDB
↑Анотация на базата данни Lipidmaps
3. Анализ на данните от групирането на пробите (биологични повторения≥3)
↑Анализ на главните компоненти на групата(2D/3D)
↑Ортогонален дискриминантен анализ с частични най-малки квадрати (OPLS-DA)
4. Диференциална селекция на метаболитите (биологични реплики≥3)
↑Диференциален анализ на промяната в сгъването↑Диференциална метаболитна вулканична диаграма
↑Топлинна карта на диференциалното клъстериране на метаболити↑Диференциална корелационна диаграма на метаболитите
↑Z-критерий на диференциалните метаболити↑Диференциален анализ на метаболити с радарна диаграма
↑Диференциална метаболитна цигулкова диаграма↑Диференциална кутия-диаграма на метаболитите
↑Функционална анотация и анализ на обогатяване на диференциалния метаболит KEGG
↑ROC анализ на кривата↑Различно метаболитно k-средно групиране
↑ Диаграма на Venn на диференциалния метаболит
Wang X, Wang D, Liu X, Zhang H, Chen G, Xu M, Shen X, You C. BEL1-подобен хомеодомен транскрипционен фактор SAWTOOTH1 (MdSAW1) в Malus domestica повишава толерантността на трансгенна ябълка и Arabidopsis към стрес от излишък на цинк. Int J Biol Macromol. 2025 май;307(Pt 3):141948. doi: 10.1016/j.ijbiomac.2025.141948. Epub 2025 март 10. PMID: 40074134.
Ain QU, Hussain HA, Rahman L, Zhang Q, Rehman A, Hussain S, Uddin S, Imran A. Интерактивен ефект на медиирани от Moringa oleifera зелени наночастици и арбускуларни микоризни гъби върху растежа, архитектурата на кореновата система и усвояването на хранителни вещества при царевицата (Zea mays L.). Plant Physiol Biochem. 2025 септември;226:110063. doi: 10.1016/j.plaphy.2025.110063. Epub 2025 май 24. PMID: 40441096.
Wang X, Luo J, Wang Q, Zhang Q, Zhao T, Liu Y, Li T, Liu X, Jiang J. Жасмонатът активира SlJAZ2/3-SlMYC3-подобен модул, регулиращ усвояването на K+ в отговор на домати на нисък K+ стрес. J Integr Plant Biol. 2025 август;67(8):2058-2077. doi: 10.1111/jipb.13941. Epub 2025 май 28. PMID: 40432500.
