条形 Банер-03

Продукти

Метагеномично секвениране -NGS

图片 62

Метагеномът е колекция от общия генетичен материал на смесена общност от организми, като метагеноми в околната среда и човека. Той съдържа геноми както на обработваеми, така и на некултурни микроорганизми. Метагеномичното секвениране на пушка с NGS дава възможност за изследване на тези сложни геномни пейзажи, вградени в проби от околната среда, като осигуряват повече от таксономично профилиране, като дават и гранулиран поглед върху разнообразието на видовете, динамиката на изобилието и сложните структури на популацията. Отвъд таксономичните изследвания, Metagenomics на Shotgun предлага и функционална перспектива на геномиката, което позволява изследването на кодирани гени и техните предполагаеми роли в екологичните процеси. И накрая, установяването на корелационни мрежи между генетичните елементи и факторите на околната среда допринася за цялостно разбиране на сложното взаимодействие между микробните общности и техния екологичен произход. В заключение, метагеномичното секвениране стои като основен инструмент за разгадаване на геномните тънкости на различни микробни общности, осветяващи многостранните връзки между генетиката и екологията в тези сложни екосистеми.

Платформи: Illumina Novaseq и DNBSEQ-T7


Подробности за услугата

Биоинформатика

Демонстрационни резултати

Препоръчани публикации

Предимства на услугата

Метод за изолация и отглеждане за профилиране на микробната общност: Разрешаване на секвениране на генетичен материал от некултивни организми.

Висока разделителна способност: Открийте видовете с ниска част в пробите за околната среда.

Изчерпателен анализ на биоинформатиката:Фокусиран не само върху таксономичното разнообразие, но и върху функционалното разнообразие на общността.

Обширен опит:С опит за успешно затваряне на множество проекти за метагеномика в различни изследователски области и обработка на над 200 000 проби, нашият екип носи богат опит на всеки проект.

Спецификации на услугата

Платформа за секвениране

Стратегия за секвениране

Препоръчва се данни

Контрол на качеството

Illumina Novaseq или DNBSEQ-T7

PE150

6-20gb

Q30≥85%

Изисквания за обслужване

Концентрация (Ng/µl)

Обща сума (NG)

Обем (µl)

≥1

≥30

≥20

● Почва/утайка: 2-3g
● Чревно съдържание-ДАНМАЛ: 0,5-2G
● Чревно съдържание-вътрешно: 0,1-0,25g
● Растителна повърхност (обогатена утайка): 0,5-1G
● Ферментационен бульон обогатен утайка): 0,2-0,5g
● Фекали (големи животни): 0,5-2g
● Фекали (мишка): 3-5 Grains
● Белодробна алвеоларна промивна течност: филтърна хартия
● Вагинален тампон: 5-6 тампони
● Кожа/генитален тампон/слюнка/перорална мека тъкан/фарингеален тампон/ректален тампон: 2-3 тампони
● Повърхностно микроорганизъм: 5-6 тампони
● Waterbody/Air/Biofilm: Филтър хартия
● Ендофити: 2-3g
● Стоматологична плака: 0,5-1G

Работен поток на сервиз

Доставка на проба

Доставка на проба

Подготовка на библиотеката

Библиотечно строителство

Секвениране

Секвениране

Анализ на данните

Анализ на данните

След услуги за продажба

Услуги след продажба


  • Предишни:
  • Следваща:

  • 流程图 贝贝第三版 -01

    Включва следния анализ:

    ● Контрол на качеството на данните

    ● Монтаж на метагеном и прогнозиране на ген

    ● Анотация на ген

    ● Анализ на разнообразието на таксономичното алфа

    ● Функционален анализ на общността: биологична функция, метаболитна, антибиотична резистентност

    ● Анализ както на функционалното, така и на таксономичното разнообразие:

    Анализ на разнообразието на бета

    Междугрупов анализ

    Анализ на корелацията: между факторите на околната среда и състава и разнообразието

    Функционален анализ: Антибиотична резистентност на картата

    图片 63

    Диференциален анализ на метаболитните пътища на KEGG: топлинна карта на значителни пътища

     

    图片 64

     Алфа разнообразие на таксономичното разпределение: АСЕ индекс

    图片 65

     

    Бета разнообразие на таксономичното разпределение: PCOA

    图片 66

    Разгледайте напредъка, улеснен от услугите за секвениране на Metagenome на BMKGene с Illumina чрез курирана колекция от публикации.

    Hai, Q. et al. (2023) „Метагеномичен и метаболомичен анализ на промените в чревното съдържание на дъговата пъстърва (Oncorhynchus mykiss), заразен с инфекциозен вирус на хематопоетична некроза при различна култура на водата на водата“,Граници в микробиологията, 14, с. 1275649. Doi: 10.3389/fmicb.2023.1275649.

    Mao, C. et al. (2023 г.) „Микробни общности, гени за съпротива и рискове за резистентност в градските езера на различни трофични състояния: вътрешни връзки и външни влияния“,Списание за напредък на опасните материали, 9, с. 100233. Doi: 10.1016/j.hazadv.2023.100233.

    Su, M. et al. (2022) „Метагеномичният анализ разкрива разлики в състава и функцията между свързани с течност и свързаните с твърда микроорганизми на овцете“,Граници в микробиологията, 13, с. 851567. Doi: 10.3389/fmicb.2022.851567.

    Yin, J. et al. (2023 г.) „Затлъстели нингсианг прасе, получени от микробиота, пренавиват метаболизма на карнитин за насърчаване на отлагането на мускулни мастни киселини при стройни прасета“,Иновацията, 4 (5), стр. 100486. Doi: 10.1016/j.xinn.2023.100486.

    Zhao, X. et al. (2023) „Метагеномична информация за потенциалните рискове от представителни био/неразградими пластмасови и непластични отломки в горния и долния път на устието на Хайх, Китай“,Наука за общата среда, 887, с. 164026. Doi: 10.1016/j.scitotenv.2023.164026.

    Вземете оферта

    Напишете съобщението си тук и ни го изпратете

    Изпратете вашето съобщение до нас: