Pacbio транскриптом с пълна дължина

PacBio секвенирането на транскриптоми с пълна дължина, Isoseq, позволява точна идентификация на изоформите на транскриптите, хвърляйки светлина върху алтернативното полиаденилиране и сплайсинг и водещо до по-точен анализ на генната експресия. Конвейерът за транскриптоми с пълна дължина на PacBio е проектиран да анализира кДНК библиотеки, секвенирани в режим на кръгово консенсусно секвениране (CCS), и идентифицира нехимерни последователности с пълна дължина (FLNC), които след това се групират в нередундантни транскрипти. Последващ BUSCO анализ оценява пълнотата на сглобения транскриптом. От сглобения транскриптом се извършват множество анализи: алтернативен сплайсинг, просто повторение на последователността (SSR), прогнозиране на lncRNA и съответните целеви гени, прогнозиране на нови гени, анализ на генни семейства, анализ на транскрипционни фактори и функционална анотация на транскриптите.