Протеомика
Характеристики
●Качествена протеомика: Използва LC-MS/MS за идентифициране на протеиновия състав в сложни проби (SDS-PAGE гел ленти, IP, Co-IP, Pull-down). Предимства: Няма ограничение за брой проби, бързо откриване, проста обработка на пробите, висока производителност и възможност за откриване на протеини с ниско съдържание на протеини.
● Количествена протеомика без етикети: Немаркирана технология с индивидуално откриване на проби. Определя количествено протеините чрез сравняване на интензитета на пептидните сигнали в данни от масспектрометрия. Предимства: Лесна работа, висока производителност (без ограничение за брой проби) и широка приложимост (подходяща за диференциално сравнение на протеини „наличие/отсъствие“ между видовете).
● DIA Количествена протеомика: Използва режим на независимо от данни събиране на данни (DIA), сканирайки всички йони в сегментирани прозорци, за да улови пълна информация за йоните. Предимства: По-добра повторяемост, по-високо протеиново покритие и по-точно количествено определяне от режима DDA (TMT/без етикети), идеален за изследвания с големи извадки.
● 4D-Label Free Quantitative Proteomics/4D-DIA Quantitative Proteomics: Базирана на Bruker timsTOF масспектрометър, добавяща йонна мобилност (напречно сечение на сблъсък) към традиционното 3D разделяне. Предимства: Подобрено използване и точност на йоните, цялостно подобрение в дълбочината на покритие, чувствителността и производителността; по-висока дълбочина на идентификация в сравнение с традиционния 3D метод.
● Astral Label Free Quantitative Proteomics/Astral DIA Quantitative Proteomics: Базирана на Orbitrap™ Astral™ масспектрометър с висока резолюция. Предимства: По-висока производителност (100+ проби/ден с 8-минутен градиент), по-дълбоко покритие (8000+ протеина, открити в HeLa клетки за 8 минути) и по-висока чувствителност (необходима е по-малко проба).
● TMT Количествена протеомика: Използва 18 изотопни маркера за маркиране на пептиди за едновременно откриване на 18 проби. Предимства: Висока стабилност (минимална интерференция със стабилността на инструмента, малка системна грешка) и висока чувствителност (фракционирането намалява сложността на пробите, подобрявайки откриването на протеини с ниско съдържание на протеини).
● PRM Таргетирана протеомика: Таргетирана технология с висока резолюция за селективно откриване на целеви протеини/пептиди. Предимства: Позволява относително/абсолютно количествено определяне и проверка на резултатите от количествената протеомика; без ограничение на антителата, по-широка приложимост от Western Blot и ELISA.
Предимства
● Съвременно оборудване: Оборудване както с конвенционални протеомни платформи, така и с усъвършенствани масспектрометри с висока дълбочина (напр. 4D, Astral).
● Стабилно откриване: Строгите системи за контрол на качеството осигуряват последователни и стабилни процеси на тестване.
● Надеждни резултати: Едновременният качествен и количествен анализ предоставя относителна експресия, молекулно тегло, изобилие и други ключови данни за всяка група.
● Висока автоматизация: Автоматизираните LC-MS системи позволяват бърз анализ и отлична разделителна способност.
Спецификации на услугата
| Сравнение на нецелевите протеомични техники | ||||
| Без етикети | ДИА | ТМТ | ||
| Етикетиране | NO | NO | ДА | |
| Режим на сканиране на данни | ДДА | ДДА | ДИА | ДДА |
| Възпроизводимост | Долна | Високо | Високо | |
| Чувствителност | Долна | Високо | Високо | |
| Мултиплексиране | NO | ДА | NO | ДА |
| Приложение | Сравняване на наличието/отсъствието на протеин | Мащабни проби | Анализ на различни партиди проби | Сравняване на диференциалната протеинова експресия в същия вид и тъкан |
| Точност | ★ | ★★(4D/Astral DlA ★★★) | ★★ | |
| Брой на откриванията | ★ | ★★(4D/Astral D|A★★★) | ★★ | |
Примерни изисквания
Чудите се дали вашите мостри отговарят на нашите критерии? Кликнете тук, за да получите нашитенай-новите изисквания за примерни материали.
Работен поток на услугата
Събиране на проби
Екстракция на протеини
Ензимно смилане
Разделяне
Събиране на данни
Анализ на данни
Доставка на данни
Качествена протеомика
1. Протеинов разтвор/гел: таблица с качествени резултати
2. Резултати от търсенето в базата данни
2.1 Списък на пептидните сегменти, съответстващи на търсенето в базата данни
2.2 Списък на протеини, съответстващи на търсенето в базата данни
2.3 Списък с модификации, намерени при търсенето в базата данни (фосфорилиране, убиквитиниране и др.)
3. Сурови данни
Количествена протеомика(Без етикетиране/DIA/TMT)
1. Предварителна обработка на данни
1.1 Търсене в базата данни за протеини
2. Анализ на протеиновата експресия
2.1 Анализ на главните компоненти (PCA)
2.2 Относително стандартно отклонение (RSD)
2.3 Разпределение на тренда по K-средни стойности
2.4 Оценка на възпроизводимостта
2.5 Топлинна карта на експресията на протеини
3. Функционална анотация
3.1 Функционална анотация на GO
3.2 Функционална анотация на KEGG
3.3 Функционална анотация на COG
3.4 Функционална анотация на GOslim
3.5 Анотация на домейна на протеиновата структура Pfam
4. Анализ на протеини с диференциална проба (биологични повторения ≥ 3)
4.1 Резултати от диференциалния анализ на протеини
4.2 Разпределение на диференциалните промени в протеиновата гънка (FC)
4.3 Статистически анализ на диференциалното количество протеини
4.4 Диференциална диаграма на протеиновия вулкан
4.5 Диференциална топлинна карта на клъстериране на протеини
4.6 Функционална анотация и анализ на обогатяването на диференциални протеини GO
4.7 Функционална анотация и анализ на обогатяването на диференциални протеини KEGG
4.8 Функционална анотация на диференциалния протеинов COG
4.9 Анализ на анотация и обогатяване на диференциални протеини GOslim
4.10 Анализ на анотация и обогатяване на диференциални протеинови структури
5. Анализ на взаимодействието на протеиновите мрежи
6. Анотация на пътя на протеиновия реактом
7. Предсказване на сигнални пептиди
8. Субклетъчна локализация на протеини
Количествена протеомика(PRM)
1. Резултати от количествено определяне на PRM протеини
1.1 Преглед на резултатите от количественото определяне
1.2 Разпределение на площите на пиковете на фрагментните йони за пептидните сегменти
Количествена протеомика
1.Анализ на протеиновата експресия
↑Анализ на главните компоненти (PCA)↑Относително стандартно отклонение (RSD)
↑K-средни стойности Разпределение на тренда ↑КорелацияAанализ наPпротеинEизразLнива
↑ Топлинна карта на експресията на протеини
2. Функционална анотация
↑GO Функционална анотация↑Функционална анотация на KEGG
↑ Функционална анотация на COG ↑ Функционална анотация на GOslim
↑ Анотация на домейна на протеиновата структура Pfam
3.Анализ на взаимодействието на протеинови мрежи
↑ Анализ на взаимодействието на протеинови мрежи
4.Предсказване на сигнални пептиди
↑ Предсказване на сигнални пептиди
5. Субклетъчна локализация на протеини
↑Субклетъчна локализация на протеини
| 2025 г. | Апоптотични везикули, получени от мезенхимни стволови клетки, облекчават реакциите на свръхчувствителност чрез индуциране на апоптоза на CD8+ Т-клетки с калциево претоварване и митохондриална дисфункция | Висша наука |
| 2024 г. | Интегрираната мулти-омика демонстрира повишена противотуморна ефикасност | Транслационна онкология |
| 2024 г. | Мулти-омикс анализът разкрива отличителните характеристики на метаболитните пътища, поддържащи Размер на плодовете и цветови вариации на гигантската тиква | Международен журнал по мол. науки. |
| 2024 г. | Профилирането на транскриптоми и метаболоми предоставя нови прозрения за атрофията на мускулите, причинени от неизползване в Пилешко: Потенциалната роля на бързосъкращаващите се мускулни влакна | Международен журнал по мол. науки. |
| 2023 г. | Мулти-омикс анализът разкрива влиянието на тетрациклина върху растежа на корена на райграс. | Списание за опасни материали |
