-
Секвениране на иРНК с пълна дължина-Nanopore
РНК секвенирането е безценен инструмент за цялостен анализ на транскриптома.Несъмнено традиционното секвениране на кратко четене е постигнало многобройни важни развития тук.Независимо от това, той често среща ограничения в идентификациите на изоформите с пълна дължина, количественото определяне, PCR отклонението.
Секвенирането на нанопорите се отличава от другите платформи за секвениране, тъй като нуклеотидите се четат директно без синтез на ДНК и генерира дълго четене при десетки килобази.Това дава възможност за директно четене, пресичане на транскрипти в пълен размер и справяне с предизвикателствата в проучванията на ниво изоформа.
Платформа:Nanopore PromethION
Библиотека:cDNA-PCR
-
De novo Секвениране на транскриптоми с пълна дължина -PacBio
De novoсеквениране на транскриптоми в цяла дължина, известно още катоDe novoIso-Seq се възползва от предимствата на PacBio секвенсора по отношение на дължината на четене, което позволява секвениране на молекули на cDNA с пълна дължина без никакви прекъсвания.Това напълно избягва всякакви грешки, генерирани в стъпките за сглобяване на транскрипт и конструира unigene набори с разделителна способност на ниво изоформа.Този унигенен набор предоставя мощна генетична информация като „референтен геном“ на ниво транскриптом.В допълнение, комбинирайки се с данни за секвениране от следващо поколение, тази услуга дава възможност за точно количествено определяне на експресията на ниво изоформа.
Платформа: PacBio Sequel IIБиблиотека: SMRT Bell библиотека -
Еукариотна иРНК секвенция-Illumina
Секвенирането на иРНК позволява профилиране на всички иРНК, транскрибирани от клетки при специфични условия.Това е мощна технология за разкриване на профил на генна експресия, генни структури и молекулярни механизми на определени биологични процеси.Към днешна дата секвенирането на иРНК е широко използвано във фундаментални изследвания, клинична диагностика, разработване на лекарства и др.
Платформа: Illumina NovaSeq 6000
-
Нереферентно базирано секвениране на иРНК-Illumina
Секвенирането на иРНК приема техника за секвениране от следващо поколение (NGS) за улавяне на информационната РНК (иРНК) от еукариот в определен период, в който някои специални функции се активират.Най-дългият сплайсиран транскрипт се нарича "Unigene" и се използва като референтна последователност за последващ анализ, което е ефективно средство за изследване на молекулярния механизъм и регулаторната мрежа на вида без препратка.
След сглобяване на транскриптомни данни и унигенна функционална анотация
(1) Ще бъдат извършени SNP анализ, SSR анализ, CDS прогнозиране и генна структура.
(2) Ще бъде извършено количествено определяне на унигенната експресия във всяка проба.
(3) Диференциално експресирани унигени между проби (или групи) ще бъдат открити въз основа на унигенна експресия
(4) Ще бъде извършено групиране, функционална анотация и анализ на обогатяване на диференциално експресирани унигени
-
Дълго некодиращо секвениране-Illumina
Дългите некодиращи РНК (lncRNAs) са вид РНК молекули с дължина над 200 nt, които се характеризират с изключително нисък кодиращ потенциал.LncRNA, като ключов член в некодиращите РНК, се намира главно в ядрото и плазмата.Развитието на технологията за секвениране и биоинформатиката позволява идентифициране на множество нови lncRNA и свързване на тези с биологични функции.Натрупаните доказателства предполагат, че lncRNA участва широко в епигенетичната регулация, регулирането на транскрипцията и регулацията след транскрипция.
-
Секвениране на малка РНК-Illumina
Малката РНК се отнася до клас некодиращи РНК молекули, които обикновено са с дължина по-малка от 200 nt, включително микро РНК (miRNA), малка интерферентна РНК (siRNA) и piwi-взаимодействаща РНК (piRNA).
МикроРНК (miRNA) е клас ендогенна малка РНК с дължина около 20-24nt, която играе различни важни регулаторни роли в клетките.miRNA участва в много жизнени процеси, които разкриват тъканна – специфична и стадийна – специфична експресия и силно запазена при различни видове.
-
секвениране на circRNA-Illumina
Секвенирането на целия транскриптом е предназначено да профилира всички видове РНК молекули, включително кодиращи (мРНК) и некодиращи РНК (включително lncRNA, circRNA и miRNA), които се транскрибират от специфични клетки в определено време.Цялостното секвениране на транскриптоми, известно още като „общо секвениране на РНК“, има за цел да разкрие всеобхватни регулаторни мрежи на ниво транскриптом.Възползвайки се от NGS технологията, последователности от цели транскриптомни продукти са достъпни за ceRNA анализ и съвместен RNA анализ, което осигурява първата стъпка към функционална характеристика.Разкриване на регулаторна мрежа от ceRNA, базирана на circRNA-miRNA-mRNA.
-
Цялостно секвениране на транскриптоми – Illumina
Секвенирането на целия транскриптом е предназначено да профилира всички видове РНК молекули, включително кодиращи (мРНК) и некодиращи РНК (включително lncRNA, circRNA и miRNA), които се транскрибират от специфични клетки в определено време.Цялостното секвениране на транскриптоми, известно още като „общо секвениране на РНК“, има за цел да разкрие всеобхватни регулаторни мрежи на ниво транскриптом.Възползвайки се от NGS технологията, последователности от цели транскриптомни продукти са достъпни за ceRNA анализ и съвместен RNA анализ, което осигурява първата стъпка към функционална характеристика.Разкриване на регулаторна мрежа от ceRNA, базирана на circRNA-miRNA-mRNA.
-
Прокариотна РНК последователност
Прокариотното РНК секвениране използва секвениране от следващо поколение (NGS), за да разкрие присъствието и количеството на РНК в даден момент, чрез анализиране на променящия се клетъчен транскриптом.Прокариотното РНК секвениране на нашата компания е специално насочено към прокариоти с референтни геноми, като ви предоставя профилиране на транскриптоми, анализ на генната структура и т.н. То е широко прилагано за фундаментални научни изследвания, изследвания и разработки на лекарства и др.
Платформа: Illumina NovaSeq 6000
-
Метатранскриптомно секвениране
Метатранскриптомното секвениране идентифицира генната експресия на микроби (както еукариоти, така и прокариоти) в естествена среда (т.е. почва, вода, море, изпражнения и черва). По-конкретно, тези услуги ви позволяват да получите профилиране на цялостна генна експресия на сложни микробни общности, таксономичен анализ на видовете, анализ на функционалното обогатяване на различно експресирани гени и др.
Платформа: Illumina NovaSeq 6000
