ব্যাকটেরিয়া এবং ছত্রাকের সম্পূর্ণ জিনোম পুনঃক্রম
ব্যাকটেরিয়া ও ছত্রাকের পূর্ণাঙ্গ জিনোম পুনঃক্রমণ প্রকল্পগুলো অণুজীবের জিনোম সম্পূর্ণ করা ও তুলনা করার সুযোগ করে দিয়ে অণুজীব জিনোমিক্সের অগ্রগতিতে গুরুত্বপূর্ণ ভূমিকা পালন করে। এটি ফার্মেন্টেশন ইঞ্জিনিয়ারিং, শিল্প প্রক্রিয়ার অনুকূলীকরণ এবং সেকেন্ডারি মেটাবলিজম পথ অন্বেষণে সহায়তা করে। অধিকন্তু, ছত্রাক ও ব্যাকটেরিয়ার পুনঃক্রমণ পরিবেশগত অভিযোজন বোঝা, স্ট্রেইনের অনুকূলীকরণ এবং জিনগত বিবর্তনের গতিপ্রকৃতি উন্মোচনের জন্য অপরিহার্য, যার চিকিৎসা, কৃষি এবং পরিবেশ বিজ্ঞানে ব্যাপক প্রভাব রয়েছে।
পরিষেবার সুবিধা
●বায়োইনফরমেটিক বিশ্লেষণে ভ্যারিয়েন্ট কলিং অন্তর্ভুক্ত:পুনঃক্রমিত জিনোমগুলির কার্যকরী অন্তর্দৃষ্টি প্রদান করা।
● ব্যাপক দক্ষতাপ্রতি বছর হাজার হাজার মাইক্রোবিয়াল রি-সিকোয়েন্সিং প্রকল্প পরিচালনার মাধ্যমে আমরা এক দশকেরও বেশি অভিজ্ঞতা, একটি অত্যন্ত দক্ষ বিশ্লেষণ দল, ব্যাপক বিষয়বস্তু এবং চমৎকার বিক্রয়োত্তর সহায়তা নিয়ে এসেছি।
●বিক্রয়োত্তর সহায়তা:প্রকল্প সমাপ্তির পরেও আমাদের দায়বদ্ধতা ৩ মাসের বিক্রয়োত্তর সেবার মাধ্যমে অব্যাহত থাকে। এই সময়ে, আমরা প্রকল্পের ফলো-আপ, সমস্যা সমাধানে সহায়তা এবং ফলাফল সম্পর্কিত যেকোনো জিজ্ঞাসার সমাধানের জন্য প্রশ্নোত্তর পর্বের আয়োজন করে থাকি।
পরিষেবার স্পেসিফিকেশন
| সিকোয়েন্সিং প্ল্যাটফর্ম | ক্রমবিন্যাস কৌশল | ডেটা সুপারিশ করা হয়েছে | গুণমান নিয়ন্ত্রণ |
| ইলুমিনা নোভাসিক | PE150 | ১০০ গুণ গভীরতা | Q30≥85% |
নমুনা প্রয়োজনীয়তা
| ঘনত্ব (ng/µL) | মোট পরিমাণ (ng) | আয়তন (µL) |
| ≥১ | ≥৬০ | ≥২০ |
ব্যাকটেরিয়া: ≥১x১০7 কোষ
একককোষী ছত্রাক: ≥৫x১০6-১x১০7 কোষ
ম্যাক্রো ছত্রাক: ≥৪ গ্রাম
পরিষেবা কার্যপ্রবাহ
নমুনা সরবরাহ
গ্রন্থাগার নির্মাণ
ক্রমবিন্যাস
ডেটা বিশ্লেষণ
বিক্রয়োত্তর সেবা
নিম্নলিখিত বিশ্লেষণ অন্তর্ভুক্ত:
- সিকোয়েন্সিং ডেটা গুণমান নিয়ন্ত্রণ
- রেফারেন্স জিনোমের সাথে সারিবদ্ধকরণ
- ভ্যারিয়েন্ট কলিং: SNP এবং InDel
- ভ্যারিয়েন্ট টীকা
ভ্যারিয়েন্ট কলিং: SNP প্রকার
ভ্যারিয়েন্ট কলিং: ইনডেল দৈর্ঘ্যের বন্টন
নির্বাচিত প্রকাশনা সংকলনের মাধ্যমে BMKGene-এর মাইক্রোবিয়াল জিনোম রি-সিকোয়েন্সিং পরিষেবার দ্বারা সাধিত অগ্রগতিগুলো অন্বেষণ করুন।
জিয়া, ওয়াই. এট আল. (২০২৩) 'গমের বামন বান্ট রোগের প্রতিরোধক জিন স্ক্রিনিং করার জন্য ট্রান্সক্রিপটোম এবং সম্পূর্ণ জিনোম পুনঃ-সিকোয়েন্সিংয়ের সমন্বয়',আন্তর্জাতিক আণবিক বিজ্ঞান জার্নাল, 24(24)। doi: 10.3390/IJMS242417356.
জিয়াং, এম. এট আল. (২০২৩) 'অ্যাম্পিসিলিন-নিয়ন্ত্রিত গ্লুকোজ বিপাক ব্যাকটেরিয়ার সহনশীলতা থেকে প্রতিরোধে রূপান্তরকে প্রভাবিত করে',বিজ্ঞানের অগ্রগতি, 9(10). doi: 10.1126/SCIADV.ADE8582/SUPPL_FILE/SCIADV.ADE8582_SM.PDF.
ইয়াং, এম. প্রমুখ (২০২২) 'অ্যালিডিওমারিনা হালালকালিফিলা স্প. নভ., চীনের ইনার মঙ্গোলিয়া স্বায়ত্তশাসিত অঞ্চলের একটি সোডা হ্রদ থেকে বিচ্ছিন্ন একটি হ্যালোঅ্যালকালিফিলিক ব্যাকটেরিয়া', ইন্ট. জে. সিস্ট. ইভোল.মাইক্রোবায়োল, 72, পৃ. 5263. doi: 10.1099/ijsem.0.005263.
Zhu, Z., Wu, R. এবং Wang, G.-H. (2024) 'Nasonia vitripennis থেকে বিচ্ছিন্ন Staphylococcus nepalensis ZZ-2023a এর জিনোম ক্রম',মাইক্রোবায়োলজি রিসোর্স ঘোষণাdoi: 10.1128/MRA.00802-23.
