পূর্ণ দৈর্ঘ্যের mRNA সিকোয়েন্সিং -প্যাকবায়ো
বৈশিষ্ট্য
● পলি-এ এমআরএনএ থেকে সিডিএনএ সংশ্লেষণ এবং তারপরে লাইব্রেরি প্রস্তুতি
● CCS মোডে সিকোয়েন্সিং করে হাইফাই রিড তৈরি করা
● পূর্ণ দৈর্ঘ্যের প্রতিলিপিগুলির ক্রমবিন্যাস
● এই বিশ্লেষণের জন্য কোনো রেফারেন্স জিনোমের প্রয়োজন হয় না; তবে, এটি ব্যবহার করা যেতে পারে।
● বায়োইনফরমেটিক বিশ্লেষণ lncRNA ট্রান্সক্রিপ্ট আইসোফর্ম, জিন ফিউশন, পলি-অ্যাডেনাইলেশন এবং জিনের গঠন বিশ্লেষণ করতে সক্ষম করে।
পরিষেবার সুবিধা
●উচ্চ নির্ভুলতা৯৯.৯% (Q30) এর বেশি নির্ভুলতাসহ হাইফাই রিড, যা এনজিএস (NGS) এর সমতুল্য।
● বিকল্প স্প্লাইসিং বিশ্লেষণসম্পূর্ণ ট্রান্সক্রিপ্টের সিকোয়েন্সিং আইসোফর্ম শনাক্তকরণ এবং বৈশিষ্ট্য নির্ধারণে সক্ষম করে।
●ব্যাপক দক্ষতা১১০০টিরও বেশি প্যাকবায়ো পূর্ণাঙ্গ ট্রান্সক্রিপ্টোম প্রকল্প সম্পন্ন করা এবং ২৩০০টিরও বেশি নমুনা প্রক্রিয়াকরণের অভিজ্ঞতার সুবাদে, আমাদের দল প্রতিটি প্রকল্পে বিপুল অভিজ্ঞতা নিয়ে আসে।
●বিক্রয়োত্তর সহায়তাপ্রকল্প সমাপ্তির পরেও আমাদের দায়বদ্ধতা ৩ মাসের বিক্রয়োত্তর সেবার মাধ্যমে অব্যাহত থাকে। এই সময়ে, আমরা প্রকল্পের ফলো-আপ, সমস্যা সমাধানে সহায়তা এবং ফলাফল সম্পর্কিত যেকোনো জিজ্ঞাসার সমাধানের জন্য প্রশ্নোত্তর পর্বের আয়োজন করে থাকি।
নমুনার প্রয়োজনীয়তা এবং ডেলিভারি
| লাইব্রেরি | ক্রমবিন্যাস কৌশল | ডেটা সুপারিশ করা হয়েছে | গুণমান নিয়ন্ত্রণ |
| পলিএ সমৃদ্ধ এমআরএনএ সিসিএস লাইব্রেরি | প্যাকবায়ো সিক্যুয়েল II প্যাকবায়ো রেভিও | ২০/৪০ জিবি ৫/১০ এম সিসিএস | Q30≥85% |
নমুনা প্রয়োজনীয়তা:
নিউক্লিওটাইড:
● উদ্ভিদ:
মূল, কাণ্ড বা পাপড়ি: ৪৫০ মিলিগ্রাম
পাতা বা বীজ: ৩০০ মিলিগ্রাম
ফল: ১.২ গ্রাম
● প্রাণী:
হৃৎপিণ্ড বা অন্ত্র: ৩০০ মিলিগ্রাম
অভ্যন্তরীণ অঙ্গ বা মস্তিষ্ক: ২৪০ মিলিগ্রাম
পেশী: ৪৫০ মিলিগ্রাম
হাড়, চুল বা ত্বক: ১ গ্রাম
● আর্থ্রোপড:
পোকামাকড়: ৬ গ্রাম
ক্রাস্টেশিয়া: ৩০০ মিলিগ্রাম
● সম্পূর্ণ রক্ত১ টিউব
● কোষ: 106 কোষ
| ঘনত্ব (ng/μl) | পরিমাণ (μg) | বিশুদ্ধতা | সততা |
| ≥ ১০০ | ≥ ১.০ | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 জেলে সীমিত বা কোনো প্রোটিন বা ডিএনএ দূষণ দেখা যায়নি। | উদ্ভিদের জন্য: RIN≥৭.৫; প্রাণীদের ক্ষেত্রে: RIN≥8.0; ৫.০≥ ২৮এস/১৮এস≥১.০; সীমিত বা কোনো বেসলাইন উচ্চতা নেই |
প্রস্তাবিত নমুনা ডেলিভারি
ধারক: ২ মিলি সেন্ট্রিফিউজ টিউব (টিন ফয়েল ব্যবহার করার পরামর্শ দেওয়া হয় না)
নমুনার নামকরণ: গ্রুপ+প্রতিলিপি, যেমন A1, A2, A3; B1, B2, B3।
চালান:
১. ড্রাই-আইস: নমুনাগুলো ব্যাগে ভরে ড্রাই-আইসের মধ্যে পুঁতে রাখতে হবে।
২. আরএনএস্টেবল টিউব: আরএনএ নমুনা আরএনএ স্থিতিশীলকরণ টিউবে (যেমন আরএনএস্টেবল®) শুকিয়ে কক্ষ তাপমাত্রায় পাঠানো যেতে পারে।
পরিষেবা কার্যপ্রবাহ
পরীক্ষার নকশা
নমুনা সরবরাহ
আরএনএ নিষ্কাশন
গ্রন্থাগার নির্মাণ
ক্রমবিন্যাস
ডেটা বিশ্লেষণ
বিক্রয়োত্তর সেবা
নিম্নলিখিত বিশ্লেষণ অন্তর্ভুক্ত:
● কাঁচা ডেটার গুণমান নিয়ন্ত্রণ
● বিকল্প পলিঅ্যাডেনাইলেশন বিশ্লেষণ (APA)
● ফিউশন ট্রান্সক্রিপ্ট বিশ্লেষণ
● বিকল্প স্প্লাইসিং বিশ্লেষণ
● বেঞ্চমার্কিং ইউনিভার্সাল সিঙ্গেল-কপি অর্থোলগস (BUSCO) বিশ্লেষণ
● নভেল ট্রান্সক্রিপ্ট বিশ্লেষণ: কোডিং সিকোয়েন্স (CDS) এর পূর্বাভাস এবং কার্যকরী টীকা
● lncRNA বিশ্লেষণ: lncRNA এবং এর লক্ষ্যবস্তুসমূহের পূর্বাভাস
● মাইক্রোস্যাটেলাইট শনাক্তকরণ (এসএসআর)
BUSCO বিশ্লেষণ
বিকল্প স্প্লাইসিং বিশ্লেষণ
বিকল্প পলিঅ্যাডেনাইলেশন বিশ্লেষণ (এপিএ)
নতুন প্রতিলিপির কার্যকরী টীকা
এই বিশেষ প্রকাশনাটিতে BMKGene-এর ন্যানোপোর পূর্ণদৈর্ঘ্য mRNA সিকোয়েন্সিং পরিষেবার মাধ্যমে সাধিত অগ্রগতিগুলো অন্বেষণ করুন।
মা, ওয়াই. এট আল. (2023) 'নেমোপিলেমা নোমুরাই বিষ শনাক্তকরণের জন্য প্যাকবায়ো এবং ওএনটি আরএনএ সিকোয়েন্সিং পদ্ধতির তুলনামূলক বিশ্লেষণ', জিনোমিক্স, 115(6), পৃ. 110709. doi: 10.1016/J.YGENO.2023.110709.
চাও, কিউ. এট আল. (2019) 'পপুলাস কাণ্ডের ট্রান্সক্রিপ্টোমের বিকাশগত গতিশীলতা', প্ল্যান্ট বায়োটেকনোলজি জার্নাল, 17(1), পৃষ্ঠা 206–219। doi: 10.1111/PBI.12958।
ডেং, এইচ. এট আল. (2022) 'অ্যাক্টিনিডিয়া ল্যাটিফোলিয়া (একটি অ্যাসকরবেট-সমৃদ্ধ ফল ফসল)-এর ফলের বিকাশ এবং পরিপক্কতার সময় অ্যাসকরবিক অ্যাসিডের পরিমাণের গতিশীল পরিবর্তন এবং সংশ্লিষ্ট আণবিক প্রক্রিয়া', আন্তর্জাতিক আণবিক বিজ্ঞান জার্নাল, 23(10), পৃ. 5808. doi: 10.3390/IJMS23105808/S1.
হুয়া, এক্স. এট আল. (2022) 'প্যারিস পলিফিলাতে জৈব সক্রিয় পলিফিলিনে জড়িত জৈব সংশ্লেষণ পথের জিনের কার্যকর পূর্বাভাস', কমিউনিকেশনস বায়োলজি 2022 5:1, 5(1), পৃষ্ঠা 1–10। doi: 10.1038/s42003-022-03000-z.
লিউ, এম. এট আল. (2023) 'টুটা অ্যাবসোলুটা (মেয়ারিক) ট্রান্সক্রিপ্টোম এবং সাইটোক্রোম P450 জিনের সম্মিলিত প্যাকবায়ো আইসো-সিক এবং ইলুমিনা আরএনএ-সিক বিশ্লেষণ', ইনসেক্টস, 14(4), পৃ. 363. doi: 10.3390/INSECTS14040363/S1.
ওয়াং, লিজুন প্রমুখ (2019) 'Ricinus communis-এ রিসিনোলিক অ্যাসিড জৈব সংশ্লেষণ আরও ভালোভাবে বোঝার জন্য PacBio একক-অণু রিয়েল-টাইম বিশ্লেষণ এবং Illumina RNA সিকোয়েন্সিং-এর সমন্বয়ে ট্রান্সক্রিপ্টোমের জটিলতার একটি সমীক্ষা', BMC Genomics, 20(1), পৃ. 1–17। doi: 10.1186/S12864-019-5832-9।
