ইউক্যারিওটিক mRNA সিকোয়েন্সিং-NGS
বৈশিষ্ট্য
● স্ট্র্যান্ড-নির্দিষ্ট সিকোয়েন্সিং ডেটা প্রাপ্তি সক্ষম করার জন্য ঐচ্ছিক দিকনির্দেশক mRNA লাইব্রেরি প্রস্তুতি।
● বিভিন্ন ধরনের বিআই বিশ্লেষণ আমাদের সকল গ্রাহকের চাহিদা পূরণ করে।
সুবিধাগুলি
●ব্যাপক দক্ষতাআমরা কোষ কালচার, টিস্যু এবং শারীরিক তরল পদার্থের মতো বিভিন্ন ধরণের ৬০০,০০০-এরও বেশি নমুনা প্রক্রিয়াজাত করেছি। আমরা প্রতিটি প্রকল্পে আমাদের বিপুল অভিজ্ঞতা নিয়ে আসি।
●কঠোর মান নিয়ন্ত্রণআমরা নমুনা প্রস্তুতি থেকে শুরু করে লাইব্রেরি প্রস্তুতি, সিকোয়েন্সিং এবং বায়োইনফরমেটিক্স পর্যন্ত সকল পর্যায়ে মূল নিয়ন্ত্রণ ব্যবস্থা প্রয়োগ করি। আমাদের সতর্ক পর্যবেক্ষণ ধারাবাহিকভাবে উচ্চ মানের ফলাফল প্রদান নিশ্চিত করে।
●বিশদ টীকাআমরা ডিফারেনশিয়ালি এক্সপ্রেসড জিন (ডিইজি)-গুলোকে কার্যকরীভাবে টীকাযুক্ত করতে এবং সংশ্লিষ্ট এনরিচমেন্ট বিশ্লেষণ সম্পাদন করতে একাধিক ডেটাবেস ব্যবহার করি। এই ব্যাপক পদ্ধতিটি ট্রান্সক্রিপ্টোম প্রতিক্রিয়ার অন্তর্নিহিত কোষীয় এবং আণবিক প্রক্রিয়াগুলো সম্পর্কে অন্তর্দৃষ্টি প্রদান করে, যা আপনার পরীক্ষার ডেটা সম্পর্কে সম্ভাব্য সমস্ত তথ্য প্রাপ্তি নিশ্চিত করে।
●বিক্রয়োত্তর সহায়তাউপস্থিত থাকার গুরুত্ব আমরা বুঝি, তাই প্রকল্প সমাপ্তির পরেও আমাদের প্রতিশ্রুতি ৩ মাসের বিক্রয়োত্তর সেবার মাধ্যমে প্রসারিত হয়। এই সময়ে, আমরা প্রকল্পের ফলো-আপ, সমস্যা সমাধানে সহায়তা এবং ফলাফল সম্পর্কিত যেকোনো জিজ্ঞাসার সমাধানের জন্য প্রশ্নোত্তর পর্বের আয়োজন করে থাকি।
নমুনার প্রয়োজনীয়তা এবং ডেলিভারি
| লাইব্রেরি | ক্রমবিন্যাস কৌশল | ডেটা সুপারিশ করা হয়েছে | গুণমান নিয়ন্ত্রণ |
| পলি এ সমৃদ্ধ | ইলুমিনা পিই১৫০ ডিএনবিএসইকিউ-টি৭ | ৬ -১০ জিবি | Q30≥85% |
নমুনা প্রয়োজনীয়তা:
নিউক্লিওটাইড:
ন্যূনতম নমুনার প্রয়োজনীয়তা:
| ঘনত্ব (ng/μl) | পরিমাণ (μg) | বিশুদ্ধতা | সততা | |
| স্ট্যান্ডার্ড লাইব্রেরি | ≥ ১০ | ≥ ০.২ | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 জেলে সীমিত বা কোনো প্রোটিন বা ডিএনএ দূষণ দেখা যায়নি। | উদ্ভিদের জন্য: RIN≥4.0; প্রাণীদের ক্ষেত্রে: RIN≥4.5; ৫.০≥২৮এস/১৮এস≥১.০; সীমিত বা কোনো বেসলাইন উচ্চতা নেই |
| দিকনির্দেশক গ্রন্থাগার | ≥ ১০ | ≥ ০.২ | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 জেলে সীমিত বা কোনো প্রোটিন বা ডিএনএ দূষণ দেখা যায়নি। | উদ্ভিদের জন্য: RIN≥4.0; প্রাণীদের ক্ষেত্রে: RIN≥4.5; ৫.০≥২৮এস/১৮এস≥১.০; সীমিত বা কোনো বেসলাইন উচ্চতা নেই |
| গাছপালা | পশু | আর্থ্রোপড | সম্পূর্ণ রক্ত | কোষ |
| মূল, কাণ্ড বা পাপড়ি: ৪৫০ মিলিগ্রাম পাতা বা বীজ: ৩০০ মিলিগ্রাম ফল: ১.২ গ্রাম | হৃৎপিণ্ড বা অন্ত্র: ৩০০ মিগ্রা অভ্যন্তরীণ অঙ্গ বা মস্তিষ্ক: ২৪০ মিলিগ্রাম পেশী: ৪৫০ মিলিগ্রাম হাড়, চুল বা ত্বক: ১ গ্রাম | পোকামাকড়: ৬ গ্রাম ক্রাস্টেশিয়া: ৩০০ মিলিগ্রাম | ১ টিউব | ১০৬টি কোষ |
প্রস্তাবিত নমুনা ডেলিভারি
পাত্র: ২ মিলি সেন্ট্রিফিউজ টিউব (টিন ফয়েল ব্যবহার করা বাঞ্ছনীয় নয়)
নমুনার নামকরণ: গ্রুপ+প্রতিলিপি, যেমন A1, A2, A3; B1, B2, B3... ...
চালান:
১. ড্রাই-আইস: নমুনাগুলো ব্যাগে ভরে ড্রাই-আইসের মধ্যে পুঁতে রাখতে হবে।
২. আরএনএ স্থিতিশীলকরণ টিউব: আরএনএ নমুনা আরএনএ স্থিতিশীলকরণ টিউবে (যেমন আরএনএস্টেবল®) শুকানো যেতে পারে এবং কক্ষ তাপমাত্রায় পাঠানো যেতে পারে।
নমুনার প্রয়োজনীয়তা এবং ডেলিভারি
পরীক্ষার নকশা
নমুনা সরবরাহ
আরএনএ নিষ্কাশন
গ্রন্থাগার নির্মাণ
ক্রমবিন্যাস
ডেটা বিশ্লেষণ
বিক্রয়োত্তর সেবা
বায়োইনফরমেটিক্স
যেসব নমুনার রেফারেন্স জিনোম পাওয়া যায়, তাদের ক্ষেত্রে BI বিশ্লেষণটি নিম্নরূপ:
Øকাঁচা ডেটার গুণমান নিয়ন্ত্রণ
Øরেফারেন্স জিনোম অ্যালাইনমেন্ট
Øপ্রতিলিপি কাঠামো বিশ্লেষণ
Øঅভিব্যক্তি পরিমাণ নির্ধারণ
Øডিফারেনশিয়াল এক্সপ্রেশন বিশ্লেষণ
Øফাংশন টীকা এবং সমৃদ্ধকরণ
যেসব নমুনার রেফারেন্স জিনোম নেই, তাদের জন্য এই বিকল্পটি উপলব্ধ:
• কাঁচা ডেটার গুণমান নিয়ন্ত্রণ
•কাঠামো অপ্টিমাইজেশন সহ সমাবেশ
•ডিফারেনশিয়াল এক্সপ্রেশন বিশ্লেষণ
•ফাংশন টীকা এবং সমৃদ্ধকরণ
রেফারেন্স জিনোম অ্যালাইনমেন্ট
ডেটা স্যাচুরেশন
জৈবিক প্রতিলিপির নমুনা পারস্পরিক সম্পর্ক এবং মূল্যায়ন
ভিন্নভাবে প্রকাশিত জিন (DEGs)
ডিইজি-এর কার্যকরী টীকা
ডিইজিগুলির কার্যকরী সমৃদ্ধি
নির্বাচিত প্রকাশনা সংকলনের মাধ্যমে BMKGene-এর ইউক্যারিওটিক NGS mRNA সিকোয়েন্সিং পরিষেবার দ্বারা সাধিত অগ্রগতিগুলো অন্বেষণ করুন।
হুয়াং, এল. এট আল. (২০২৩) 'ট্রাইক্লোসান এবং ট্রাইক্লোকার্বান গন্ধ শনাক্তকরণে বাধা সৃষ্টি করে, ঘ্রাণ সংকেত সঞ্চালনে ব্যাঘাত ঘটিয়ে এবং ঘ্রাণ তথ্য প্রক্রিয়াকরণে বিঘ্ন ঘটিয়ে গোল্ডফিশের ঘ্রাণ ক্ষমতা দুর্বল করে',জল গবেষণা, ২৩৩, পৃ. ১১৯৭৩৬। ডিওআই: ১০.১০১৬/জে.ওয়াট্রেস.২০২৩.১১৯৭৩৬।
জিয়া, এলজে এট আল. (২০২৩) 'অ্যাসপারজিলাস ফিউমিগ্যাটাস মানব পি১১ হাইজ্যাক করে ছত্রাক-ধারণকারী ফ্যাগোসোমগুলিকে অ-অবক্ষয়ী পথে পুনঃনির্দেশিত করে',কোষ পোষক ও অণুজীব, 31(3), pp. 373-388.e10। doi: 10.1016/J.CHOM.2023.02.002।
জিন, কে. প্রমুখ (২০২২) 'মা বাঁশের (Dendrocalamus latiflorus Munro) কাণ্ডের বিকাশে টিসিপি ট্রান্সক্রিপশন ফ্যাক্টরসমূহের সম্পৃক্ততা',উদ্ভিদ বিজ্ঞানের অগ্রযাত্রা, ১৩, পৃ. ৮৮৪৪৪৩। ডিওআই: ১০.৩৩৮৯/এফপিএলএস.২০২২.৮৮৪৪৪৩/বিআইবিটিইএক্স।
ওয়েন, এক্স. প্রমুখ (২০২২) 'ক্রাইস্যান্থেমাম ল্যাভান্ডুলিফোলিয়াম জিনোম এবং বিভিন্ন ধরনের ক্যাপিউলামের অন্তর্নিহিত আণবিক প্রক্রিয়া',উদ্যানপালন গবেষণা, 9. doi: 10.1093/HR/UHAB022.
ঝাং, ইউজি এট আল. (২০২৩) 'সিনার্জিস্টিক ROS অগমেন্ট এবং অটোফ্যাজি ব্লকেজের মাধ্যমে কোলোরেক্টাল ক্যান্সারের সোনোডাইনামিক থেরাপি উন্নত করার জন্য একটি ক্যাসকেড ন্যানোরিঅ্যাক্টর',ন্যানো টুডে, 49, পৃ. 101798. doi: 10.1016/J.NANTOD.2023.101798.
