পণ্য

*এখানে দেখানো ডেমো ফলাফল সব BMKGENE এর সাথে প্রকাশিত জিনোম থেকে

1. বিবর্তন বিশ্লেষণে জিনগত বৈচিত্রের উপর ভিত্তি করে ফাইলোজেনেটিক গাছ, জনসংখ্যার গঠন এবং পিসিএ নির্মাণ রয়েছে।

ফাইলোজেনেটিক গাছ সাধারণ পূর্বপুরুষের সাথে প্রজাতির মধ্যে শ্রেণীবিন্যাস এবং বিবর্তনীয় সম্পর্ককে প্রতিনিধিত্ব করে।
PCA-এর লক্ষ্য হল উপ-জনসংখ্যার মধ্যে ঘনিষ্ঠতা কল্পনা করা।
জনসংখ্যার গঠন অ্যালিল ফ্রিকোয়েন্সির ক্ষেত্রে জিনগতভাবে স্বতন্ত্র উপ-জনসংখ্যার উপস্থিতি দেখায়।

চেন, ইত্যাদি।আল।,পিএনএএস, 2020

2. নির্বাচনী ঝাড়ু

সিলেক্টিভ সুইপ বলতে এমন একটি প্রক্রিয়াকে বোঝায় যার মাধ্যমে একটি সুবিধাজনক সাইট নির্বাচন করা হয় এবং লিঙ্ক করা নিউট্রাল সাইটের ফ্রিকোয়েন্সি বাড়ানো হয় এবং লিঙ্ক না করা সাইটের ফ্রিকোয়েন্সি কমে যায়, যার ফলে আঞ্চলিক কমে যায়।

নির্দিষ্ট ধাপে (10 Kb) একটি স্লাইডিং উইন্ডোর (100 Kb) মধ্যে সমস্ত SNP-এর জনসংখ্যা জেনেটিক ইনডেক্স（π，Fst, Tajima's D) গণনা করে নির্বাচনী সুইপ অঞ্চলে জিনোম-ব্যাপী সনাক্তকরণ প্রক্রিয়া করা হয়।

নিউক্লিওটাইড বৈচিত্র্য (π)

তাজিমার ডি

ফিক্সেশন ইনডেক্স (Fst)

উ, ইত্যাদি।আল।,আণবিক উদ্ভিদ, 2018

3.জিন প্রবাহ

উ, ইত্যাদি।আল।,আণবিক উদ্ভিদ, 2018

4. জনসংখ্যার ইতিহাস

ঝাং, ইত্যাদি।আল।,প্রকৃতি বাস্তুবিদ্যা এবং বিবর্তন, 2021

5. বিচ্যুতি সময়

ঝাং, ইত্যাদি।আল।,প্রকৃতি বাস্তুবিদ্যা এবং বিবর্তন, 2021

বিএমকে কেস

একটি জিনোমিক প্রকরণ মানচিত্র স্প্রিং চাইনিজ বাঁধাকপি (ব্রাসিকা রাপা এসএসপি। পেকিনেনসিস) নির্বাচনের জেনেটিক ভিত্তিতে অন্তর্দৃষ্টি প্রদান করে

প্রকাশিত: আণবিক উদ্ভিদ, 2018

সিকোয়েন্সিং কৌশল:

রিকোয়েন্সিং: সিকোয়েন্সিং ডেপথ: 10×

মূল ফলাফল

এই গবেষণায়, 194টি চীনা বাঁধাকপি 10× এর গড় গভীরতার সাথে পুনরায় অনুক্রমের জন্য প্রক্রিয়া করা হয়েছিল, যার ফলে 1,208,499 SNPs এবং 416,070 InDels পাওয়া গেছে।এই 194টি লাইনের ফাইলোজেনেটিক বিশ্লেষণে দেখা গেছে যে এই লাইনগুলিকে তিনটি ইকোটাইপ, বসন্ত, গ্রীষ্ম এবং শরৎতে ভাগ করা যায়।উপরন্তু, জনসংখ্যার গঠন এবং PCA বিশ্লেষণ ইঙ্গিত করে যে বসন্ত চীনা বাঁধাকপি চীনের শানডং-এ একটি শরৎ বাঁধাকপি থেকে উদ্ভূত হয়েছিল।এগুলি পরবর্তীতে কোরিয়া এবং জাপানে প্রবর্তিত হয়, স্থানীয় লাইনের সাথে অতিক্রম করা হয় এবং তাদের কিছু দেরী-বোল্টিং জাত চীনে ফিরে আসে এবং অবশেষে বসন্ত চীনা বাঁধাকপিতে পরিণত হয়।

বসন্তের চীনা বাঁধাকপি এবং শরৎ বাঁধাকপির জিনোম-ওয়াইড স্ক্যানিং নির্বাচনের উপর 23টি জিনোমিক লোকি প্রকাশ করেছে যেগুলি শক্তিশালী নির্বাচনের মধ্য দিয়ে গেছে, যার মধ্যে দুটি QTL-ম্যাপিংয়ের উপর ভিত্তি করে বোল্টিং-টাইম কন্ট্রোলিং অঞ্চলের সাথে ওভারল্যাপ করা হয়েছিল।এই দুটি অঞ্চলে মূল জিন রয়েছে যা ফুলকে নিয়ন্ত্রণ করে, BrVIN3.1 এবং BrFLC1।ট্রান্সক্রিপ্টোম অধ্যয়ন এবং ট্রান্সজেনিক পরীক্ষা-নিরীক্ষার মাধ্যমে এই দুটি জিনকে বোল্টিং টাইমে জড়িত বলে আরও নিশ্চিত করা হয়েছিল।

চীনা বাঁধাকপি উপর জনসংখ্যা গঠন বিশ্লেষণ

চীনা বাঁধাকপি নির্বাচন সম্পর্কে জেনেটিক তথ্য