পূর্ণ-দৈর্ঘ্য mRNA সিকোয়েন্সিং-ন্যানোপোর
বৈশিষ্ট্য
● পলি-এ এমআরএনএ ক্যাপচারের পরে সিডিএনএ সংশ্লেষণ এবং লাইব্রেরি প্রস্তুতি
● পূর্ণ-দৈর্ঘ্যের প্রতিলিপির ক্রমানুসারে
● একটি রেফারেন্স জিনোমের প্রান্তিককরণের উপর ভিত্তি করে বায়োইনফরম্যাটিক বিশ্লেষণ
● বায়োইনফরম্যাটিক বিশ্লেষণের মধ্যে শুধুমাত্র জিন এবং আইসোফর্ম-স্তরে প্রকাশ নয় বরং lncRNA, জিন ফিউশন, পলি-অ্যাডিনাইলেশন এবং জিন গঠনের বিশ্লেষণও অন্তর্ভুক্ত।
পরিষেবার সুবিধা
●আইসোফর্ম স্তরে অভিব্যক্তির পরিমাণ: বিস্তারিত এবং নির্ভুল অভিব্যক্তি বিশ্লেষণ সক্ষম করা, পুরো জিনের অভিব্যক্তি বিশ্লেষণ করার সময় মুখোশযুক্ত পরিবর্তন উন্মোচন করা
●হ্রাসকৃত ডেটা চাহিদা:নেক্সট-জেনারেশন সিকোয়েন্সিং (এনজিএস) এর তুলনায়, ন্যানোপোর সিকোয়েন্সিং কম ডেটা প্রয়োজনীয়তা প্রদর্শন করে, যা ছোট ডেটা সহ জিন এক্সপ্রেশন কোয়ান্টিফিকেশন স্যাচুরেশনের সমতুল্য স্তরের জন্য অনুমতি দেয়।
●অভিব্যক্তি পরিমাণ নির্ভুলতা উচ্চতর: জিন এবং আইসোফর্ম উভয় স্তরেই
●অতিরিক্ত ট্রান্সক্রিপ্টোমিক তথ্য সনাক্তকরণ: বিকল্প পলিএডিনাইলেশন, ফিউশন জিন এবং lcnRNA এবং তাদের টার্গেট জিন
●ব্যাপক দক্ষতা: আমাদের দল 850টিরও বেশি ন্যানোপুর পূর্ণ-দৈর্ঘ্যের ট্রান্সক্রিপ্টোম প্রকল্প সম্পন্ন করে এবং 8,000টিরও বেশি নমুনা প্রক্রিয়াকরণ করে প্রতিটি প্রকল্পে প্রচুর অভিজ্ঞতা নিয়ে আসে।
●বিক্রয়োত্তর সমর্থন: আমাদের প্রতিশ্রুতি 3 মাসের বিক্রয়োত্তর পরিষেবার মেয়াদ সহ প্রকল্প সমাপ্তির বাইরে প্রসারিত। এই সময়ের মধ্যে, আমরা ফলাফলের সাথে সম্পর্কিত যেকোন প্রশ্নের সমাধান করতে প্রকল্প ফলো-আপ, সমস্যা সমাধানে সহায়তা এবং প্রশ্নোত্তর সেশন অফার করি।
নমুনা প্রয়োজনীয়তা এবং ডেলিভারি
| লাইব্রেরি | সিকোয়েন্সিং কৌশল | ডেটা প্রস্তাবিত | মান নিয়ন্ত্রণ |
| পলি ক সমৃদ্ধ | ইলুমিনা PE150 | 6/12 জিবি | গড় মানের স্কোর: Q10 |
নমুনা প্রয়োজনীয়তা:
নিউক্লিওটাইডস:
| Conc.(ng/μl) | পরিমাণ (μg) | বিশুদ্ধতা | সততা |
| ≥ 100 | ≥ 1.0 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 জেলে দেখানো সীমিত বা কোন প্রোটিন বা ডিএনএ দূষণ নেই। | উদ্ভিদের জন্য: RIN≥7.0; প্রাণীদের জন্য: RIN≥7.5; 5.0≥28S/18S≥1.0; সীমিত বা কোন বেসলাইন উচ্চতা |
● গাছপালা:
মূল, কান্ড বা পাপড়ি: 450 মিলিগ্রাম
পাতা বা বীজ: 300 মিলিগ্রাম
ফল: 1.2 গ্রাম
● প্রাণী:
হার্ট বা অন্ত্র: 300 মিলিগ্রাম
ভিসেরা বা মস্তিষ্ক: 240 মিগ্রা
পেশী: 450 মিলিগ্রাম
হাড়, চুল বা ত্বক: 1 গ্রাম
● আর্থ্রোপডস:
পোকামাকড়: 6 গ্রাম
ক্রাস্টেসিয়া: 300 মিলিগ্রাম
● সম্পূর্ণ রক্ত: 1 টিউব
● কোষ: 106 কোষ
প্রস্তাবিত নমুনা বিতরণ
ধারক: 2 মিলি সেন্ট্রিফিউজ টিউব (টিনের ফয়েল বাঞ্ছনীয় নয়)
নমুনা লেবেলিং: গ্রুপ+প্রতিলিপি যেমন A1, A2, A3; B1, B2, B3।
চালান:
1. শুকনো বরফ: নমুনাগুলি ব্যাগে প্যাক করা এবং শুকনো বরফের মধ্যে সমাহিত করা দরকার।
2. আরএনএস্টেবল টিউব: আরএনএ নমুনাগুলিকে আরএনএ স্ট্যাবিলাইজেশন টিউবে শুকানো যেতে পারে (যেমন RNAstable®) এবং ঘরের তাপমাত্রায় পাঠানো যেতে পারে।
সার্ভিস ওয়ার্ক ফ্লো
নিউক্লিওটাইডস:
নমুনা বিতরণ
গ্রন্থাগার নির্মাণ
সিকোয়েন্সিং
ডেটা বিশ্লেষণ
বিক্রয়োত্তর সেবা
সার্ভিস ওয়ার্ক ফ্লো
টিস্যু:
পরীক্ষামূলক নকশা
নমুনা বিতরণ
আরএনএ নিষ্কাশন
গ্রন্থাগার নির্মাণ
সিকোয়েন্সিং
ডেটা বিশ্লেষণ
বিক্রয়োত্তর সেবা
● কাঁচা তথ্য প্রক্রিয়াকরণ
● প্রতিলিপি সনাক্তকরণ
● বিকল্প স্প্লিসিং
● জিন স্তর এবং আইসোফর্ম স্তরে প্রকাশের পরিমাণ নির্ধারণ
● ডিফারেনশিয়াল এক্সপ্রেশন বিশ্লেষণ
● ফাংশন টীকা এবং সমৃদ্ধকরণ (DEGs এবং DETs)
বিকল্প স্প্লিসিং বিশ্লেষণ
বিকল্প পলিয়াডেনিলেশন বিশ্লেষণ (এপিএ)
lncRNA পূর্বাভাস
উপন্যাসের জিনের টীকা
DETs এর ক্লাস্টারিং
ডিইজিতে প্রোটিন-প্রোটিন নেটওয়ার্ক
BMKGene-এর ন্যানোপুর পূর্ণ-দৈর্ঘ্যের mRNA সিকোয়েন্সিং পরিষেবাগুলির দ্বারা সহজলভ্য অগ্রগতিগুলি প্রকাশের একটি সংকলিত সংগ্রহের মাধ্যমে অন্বেষণ করুন৷
গং, বি. এট আল। (2023) 'এপিজেনেটিক অ্যান্ড ট্রান্সক্রিপশনাল অ্যাক্টিভেশন অফ দ্য সিক্রেটরি কিনেস FAM20C অ্যাজ অ্যানকোজিন ইন গ্লিওমা', জার্নাল অফ জেনেটিক্স অ্যান্ড জিনোমিক্স, 50(6), পিপি। 422-433। doi: 10.1016/J.JGG.2023.01.008.
তিনি, জেড এবং অন্যান্য। (2023) 'আইএফএন-γ-এর প্রতি লিম্ফোসাইটের পূর্ণ-দৈর্ঘ্যের ট্রান্সক্রিপ্টোম সিকোয়েন্সিং ফ্লাউন্ডারে একটি Th1-স্কিউড ইমিউন প্রতিক্রিয়া প্রকাশ করে', ফিশ অ্যান্ড শেলফিশ ইমিউনোলজি, 134, পি. 108636. doi: 10.1016/J.FSI.2023.108636.
মা, ওয়াই এবং অন্যান্য। (2023) 'প্যাকবিও এবং ওএনটি আরএনএ সিকোয়েন্সিং পদ্ধতির তুলনামূলক বিশ্লেষণ নিমোপিলেমা নোমুরাই বিষ সনাক্তকরণের জন্য', জিনোমিক্স, 115(6), পি. 110709. doi: 10.1016/J.YGENO.2023.110709.
ইউ, ডি. এট আল। (2023) 'Nano-seq বিশ্লেষণ hUMSC থেকে প্রাপ্ত exosomes এবং microvesicles এর মধ্যে বিভিন্ন কার্যকরী প্রবণতা প্রকাশ করে', স্টেম সেল রিসার্চ অ্যান্ড থেরাপি, 14(1), pp. 1-13৷ doi: 10.1186/S13287-023-03491-5/টেবিল/6।
