条形 ব্যানার-03

পণ্য

হাই-সি ভিত্তিক ক্রোমাটিন মিথস্ক্রিয়া

হাই-সি (Hi-C) হলো একটি পদ্ধতি যা প্রক্সিমিটি-ভিত্তিক মিথস্ক্রিয়া পরীক্ষা এবং হাই-থ্রুপুট সিকোয়েন্সিং-এর সমন্বয়ে জিনোমিক কনফিগারেশন ধারণ করার জন্য ডিজাইন করা হয়েছে। এই পদ্ধতিটি ফর্মালডিহাইড দিয়ে ক্রোমাটিন ক্রসলিংকিং-এর উপর ভিত্তি করে তৈরি, যার পরে ডাইজেশন এবং রি-লাইগেশন এমনভাবে করা হয় যাতে শুধুমাত্র সমযোজীভাবে সংযুক্ত খণ্ডাংশগুলোই লাইগেশন প্রোডাক্ট তৈরি করে। এই লাইগেশন প্রোডাক্টগুলোর সিকোয়েন্সিং-এর মাধ্যমে জিনোমের ত্রিমাত্রিক (3D) গঠন অধ্যয়ন করা সম্ভব হয়। হাই-সি জিনোমের সেই অংশগুলোর বিন্যাস অধ্যয়ন করতে সক্ষম করে যা হালকাভাবে প্যাক করা (এ কম্পার্টমেন্ট, ইউক্রোমাটিন) এবং ট্রান্সক্রিপশনালি সক্রিয় হওয়ার সম্ভাবনা বেশি, এবং সেই অঞ্চলগুলো যা আরও শক্তভাবে প্যাক করা (বি কম্পার্টমেন্ট, হেটেরোক্রোমাটিন)। হাই-সি টপোলজিক্যালি অ্যাসোসিয়েটেড ডোমেইন (TADs) চিহ্নিত করতেও ব্যবহার করা যেতে পারে; এগুলো হলো জিনোমের এমন অঞ্চল যার ভাঁজ করা কাঠামো রয়েছে এবং যার এক্সপ্রেশন প্যাটার্ন একই রকম হওয়ার সম্ভাবনা থাকে। এটি ক্রোমাটিন লুপ শনাক্ত করতেও ব্যবহৃত হয়; এগুলো হলো ডিএনএ-এর এমন অঞ্চল যা প্রোটিন দ্বারা একত্রে নোঙর করা থাকে এবং প্রায়শই নিয়ন্ত্রক উপাদানে সমৃদ্ধ হয়। BMKGene-এর Hi-C সিকোয়েন্সিং পরিষেবা গবেষকদের জিনোমিক্সের স্থানিক মাত্রা অন্বেষণে সক্ষম করে, যা জিনোম নিয়ন্ত্রণ এবং স্বাস্থ্য ও রোগের ক্ষেত্রে এর প্রভাব বোঝার জন্য নতুন পথ খুলে দেয়।


পরিষেবার বিবরণ

বায়োইনফরমেটিক্স

ডেমো ফলাফল

বিশেষ প্রকাশনা

পরিষেবার বৈশিষ্ট্য

● PE150 ব্যবহার করে ইলুমিনা নোভা সিক (Illumina NovaSeq)-এ সিকোয়েন্সিং।

● এই পরিষেবার জন্য নিষ্কাশিত নিউক্লিক অ্যাসিডের পরিবর্তে টিস্যুর নমুনা প্রয়োজন হয়, যা ফর্মালডিহাইডের সাহায্যে ক্রস-লিঙ্ক করে ডিএনএ-প্রোটিনের পারস্পরিক ক্রিয়াকে সংরক্ষণ করে।

● হাই-সি (Hi-C) পরীক্ষায় প্রথমে বায়োটিন দিয়ে স্টিকি এন্ডগুলোর রেস্ট্রিকশন ও এন্ড রিপেয়ার করা হয় এবং এরপর ইন্টারঅ্যাকশনগুলো অক্ষুণ্ণ রেখে প্রাপ্ত ব্লান্ট এন্ডগুলোকে সার্কুলারাইজ করা হয়। তারপর স্ট্রেপ্টাভিডিন বিডস দিয়ে ডিএনএ-কে পুল ডাউন করা হয় এবং পরবর্তী লাইব্রেরি তৈরির জন্য বিশুদ্ধ করা হয়।

পরিষেবার সুবিধা

●সর্বোত্তম সীমাবদ্ধতা এনজাইম ডিজাইনবিভিন্ন প্রজাতির উপর ৯৩% পর্যন্ত বৈধ মিথস্ক্রিয়া জোড়ার মাধ্যমে উচ্চ Hi-C কার্যকারিতা নিশ্চিত করা।

●ব্যাপক অভিজ্ঞতা ও প্রকাশনা রেকর্ড:BMKGene-এর ৮০০টি ভিন্ন প্রজাতির ২০০০-এরও বেশি Hi-C সিকোয়েন্সিং প্রকল্প এবং বিভিন্ন পেটেন্ট নিয়ে ব্যাপক অভিজ্ঞতা রয়েছে। তাদের ১০০টিরও বেশি প্রকাশিত কেস রয়েছে, যেগুলোর সম্মিলিত ইমপ্যাক্ট ফ্যাক্টর ৯০০-এরও বেশি।

●উচ্চ-দক্ষ বায়োইনফরমেটিক্স দল:হাই-সি পরীক্ষা ও ডেটা বিশ্লেষণের জন্য নিজস্ব পেটেন্ট ও সফটওয়্যার কপিরাইট এবং স্ব-উন্নত ডেটা ভিজ্যুয়ালাইজেশন সফটওয়্যার রয়েছে।

●বিক্রয়োত্তর সহায়তা:প্রকল্প সমাপ্তির পরেও আমাদের দায়বদ্ধতা ৩ মাসের বিক্রয়োত্তর সেবার মাধ্যমে অব্যাহত থাকে। এই সময়ে, আমরা প্রকল্পের ফলো-আপ, সমস্যা সমাধানে সহায়তা এবং ফলাফল সম্পর্কিত যেকোনো জিজ্ঞাসার সমাধানের জন্য প্রশ্নোত্তর পর্বের আয়োজন করে থাকি।

●বিশদ টীকাআমরা একাধিক ডেটাবেস ব্যবহার করে শনাক্তকৃত ভ্যারিয়েশনযুক্ত জিনগুলোর কার্যকরী টীকা প্রদান করি এবং সংশ্লিষ্ট এনরিচমেন্ট বিশ্লেষণ সম্পাদন করি, যা একাধিক গবেষণা প্রকল্পে অন্তর্দৃষ্টি প্রদান করে।

পরিষেবার স্পেসিফিকেশন

লাইব্রেরি

ক্রমবিন্যাস কৌশল

প্রস্তাবিত ডেটা আউটপুট

হাই-সি সিগন্যাল রেজোলিউশন

হাই-সি লাইব্রেরি

ইলুমিনা পিই১৫০

ক্রোমাটিন লুপ: ১৫০x

TAD: 50x

ক্রোমাটিন লুপ: ১০ কিলোবাইট

TAD: 40Kb

পরিষেবার প্রয়োজনীয়তা

নমুনা প্রকার

প্রয়োজনীয় পরিমাণ

প্রাণীর টিস্যু

≥২ গ্রাম

সম্পূর্ণ রক্ত

≥২ মিলি

ছত্রাক

≥১ গ্রাম

উদ্ভিদ- তরুণ টিস্যু

প্রতি ভাগে ১ গ্রাম, ২-৪টি ভাগ নেওয়ার পরামর্শ দেওয়া হয়।

কালচার করা কোষ

≥১x১০7


  • পূর্ববর্তী:
  • পরবর্তী:

  • 图片98

    নিম্নলিখিত বিশ্লেষণ অন্তর্ভুক্ত:

    ● কাঁচা ডেটার গুণমান নিয়ন্ত্রণ (QC);

    ● ম্যাপিং এবং হাই-সি লাইব্রেরি কিউসি: বৈধ ইন্টারঅ্যাকশন পেয়ার এবং ইন্টারঅ্যাকশন ডিক্যাই এক্সপোনেন্ট (আইডিই);

    ● জিনোম-ব্যাপী মিথস্ক্রিয়া প্রোফাইলিং: সিস/ট্রান্স বিশ্লেষণ এবং হাই-সি মিথস্ক্রিয়া মানচিত্র;

    ● এ/বি কম্পার্টমেন্ট বণ্টনের বিশ্লেষণ;

    ● TAD ও ক্রোমাটিন লুপ শনাক্তকরণ;

    ● নমুনাগুলোর মধ্যে ত্রিমাত্রিক ক্রোমাটিন কাঠামোগত উপাদানসমূহের পার্থক্যমূলক বিশ্লেষণ এবং সংশ্লিষ্ট জিনগুলোর ক্রিয়াশীল টীকা।

    সিস এবং ট্রান্স অনুপাত বিতরণ

    图片99

     

    নমুনাগুলির মধ্যে ক্রোমোজোমাল মিথস্ক্রিয়ার হিটম্যাপ

    图片100

     

    জিনোম-ব্যাপী A/B কম্পার্টমেন্টের বন্টন图片23

     

    জিনোম-ব্যাপী ক্রোমাটিন লুপের বিতরণ

     

    图片102

     

    TAD-এর দৃশ্যায়ন

    图片103

     

    নির্বাচিত প্রকাশনা সংকলনের মাধ্যমে BMKGene-এর Hi-C সিকোয়েন্সিং পরিষেবার দ্বারা সাধিত গবেষণার অগ্রগতি সম্পর্কে জানুন।

     

     

    মেং, টি. এট আল. (২০২১) 'একটি তুলনামূলক সমন্বিত মাল্টি-ওমিক্স বিশ্লেষণ কর্ডোমার জন্য CA2 কে একটি নতুন লক্ষ্যবস্তু হিসেবে চিহ্নিত করে',নিউরো-অনকোলজি, 23(10), পৃ. 1709-1722। doi: 10.1093/NEUONC/NOAB156।

    জু, এল. প্রমুখ (২০২১) 'সমন্বিত হাই-সি, ন্যানোপোর এবং আরএনএ সিকোয়েন্সিং-এর মাধ্যমে জিনোমের ত্রিমাত্রিক বিশৃঙ্খলা ও পুনর্বিন্যাস এনএএফএলডি-র রোগোৎপত্তি সম্পর্কে অন্তর্দৃষ্টি প্রদান করে',Acta Pharmaceutica Sinica B, 11(10), পৃ. 3150-3164। doi: 10.1016/J.APSB.2021.03.022।

    একটি মূল্য উদ্ধৃতি নিন

    আপনার বার্তাটি এখানে লিখে আমাদের কাছে পাঠিয়ে দিন।

    আমাদের কাছে আপনার বার্তা পাঠান: