mRNA-seq (NGS) – নতুন

mRNA সিকোয়েন্সিং নির্দিষ্ট পরিস্থিতিতে কোষের সমস্ত mRNA ট্রান্সক্রিপ্টের প্রোফাইলিং করার অনুমতি দেয় এবং বিভিন্ন গবেষণা ক্ষেত্রে এটি একটি বহুল ব্যবহৃত প্রযুক্তি। BMKCloud De novo mRNA-seq পাইপলাইনটি পলি-এ সমৃদ্ধ সিকোয়েন্সিং লাইব্রেরি বিশ্লেষণ করার জন্য ডিজাইন করা হয়েছে যখন কোনও রেফারেন্স জিনোম উপলব্ধ থাকে না। পাইপলাইনটি মান নিয়ন্ত্রণ দিয়ে শুরু হয়, তারপরেনতুন করেট্রান্সক্রিপ্ট অ্যাসেম্বলি এবং ইউনিজিন সেট নির্বাচন। ইউনিজিন স্ট্রাকচার বিশ্লেষণ কোডিং সিকোয়েন্স (CDS) এবং সরল সিকোয়েন্স রিপিট (SSR) ভবিষ্যদ্বাণী করে। পরবর্তীকালে, ডিফারেনশিয়াল এক্সপ্রেশন বিশ্লেষণ পরীক্ষিত অবস্থার মধ্যে ডিফারেনশিয়ালি এক্সপ্রেসড জিন (DEGs) খুঁজে পায়, তারপরে জৈবিক অন্তর্দৃষ্টি বের করার জন্য DEGs-এর কার্যকরী টীকা এবং সমৃদ্ধকরণ করা হয়।