-
পূর্ণ-দৈর্ঘ্য mRNA সিকোয়েন্সিং-ন্যানোপোর
আরএনএ সিকোয়েন্সিং ব্যাপক ট্রান্সক্রিপ্টোম বিশ্লেষণের জন্য একটি অমূল্য হাতিয়ার হয়েছে।নিঃসন্দেহে, ঐতিহ্যগত শর্ট-পঠিত সিকোয়েন্সিং এখানে অনেক গুরুত্বপূর্ণ বিকাশ অর্জন করেছে।তবুও, এটি প্রায়শই পূর্ণ-দৈর্ঘ্যের আইসোফর্ম সনাক্তকরণ, পরিমাণ নির্ধারণ, পিসিআর পক্ষপাতের সীমাবদ্ধতার সম্মুখীন হয়।
ন্যানোপোর সিকোয়েন্সিং নিজেকে অন্যান্য সিকোয়েন্সিং প্ল্যাটফর্ম থেকে আলাদা করে, যাতে নিউক্লিওটাইডগুলি ডিএনএ সংশ্লেষণ ছাড়াই সরাসরি পড়া হয় এবং দশ হাজার কিলোবেসে দীর্ঘ পঠন তৈরি করে।এটি পূর্ণ-দৈর্ঘ্যের ট্রান্সক্রিপ্ট ক্রসিং এবং আইসোফর্ম-স্তরের অধ্যয়নের চ্যালেঞ্জগুলি মোকাবেলা করার জন্য সরাসরি পাঠ-আউট করার ক্ষমতা দেয়।
প্ল্যাটফর্ম：ন্যানোপুর প্রমিথিওন
লাইব্রেরি:সিডিএনএ-পিসিআর
-
De novo পূর্ণ-দৈর্ঘ্যের ট্রান্সক্রিপ্টোম সিকোয়েন্সিং -PacBio
নতুনপূর্ণ-দৈর্ঘ্যের ট্রান্সক্রিপ্টোম সিকোয়েন্সিং, নামেও পরিচিতনতুনIso-Seq পঠিত দৈর্ঘ্যে PacBio সিকোয়েন্সারের সুবিধা গ্রহণ করে, যা কোনো বিরতি ছাড়াই পূর্ণ-দৈর্ঘ্যের সিডিএনএ অণুর সিকোয়েন্সিং সক্ষম করে।এটি সম্পূর্ণরূপে ট্রান্সক্রিপ্ট সমাবেশ ধাপে উত্পন্ন কোনো ত্রুটি এড়ায় এবং আইসোফর্ম-স্তরের রেজোলিউশনের সাথে ইউনিজিন সেট তৈরি করে।এই ইউনিজিন সেটগুলি ট্রান্সক্রিপ্টোম স্তরে "রেফারেন্স জিনোম" হিসাবে শক্তিশালী জেনেটিক তথ্য সরবরাহ করে।উপরন্তু, পরবর্তী প্রজন্মের সিকোয়েন্সিং ডেটার সাথে একত্রিত করে, এই পরিষেবাটি আইসোফর্ম-স্তরের অভিব্যক্তির সঠিক পরিমাণ নির্ধারণের ক্ষমতা দেয়।
প্ল্যাটফর্ম: PacBio সিক্যুয়েল IIলাইব্রেরি: SMRT বেল লাইব্রেরি -
ইউক্যারিওটিক এমআরএনএ সিকোয়েন্সিং-ইলুমিনা
mRNA সিকোয়েন্সিং নির্দিষ্ট অবস্থার অধীনে কোষ থেকে ট্রান্সক্রিপ্ট করা সমস্ত mRNA এর প্রোফাইলিং সক্ষম করে।এটি জিন এক্সপ্রেশন প্রোফাইল, জিনের গঠন এবং নির্দিষ্ট জৈবিক প্রক্রিয়ার আণবিক প্রক্রিয়া প্রকাশ করার জন্য একটি শক্তিশালী প্রযুক্তি।আজ অবধি, mRNA সিকোয়েন্সিং মৌলিক গবেষণা, ক্লিনিকাল ডায়াগনস্টিকস, ড্রাগ ডেভেলপমেন্ট ইত্যাদিতে ব্যাপকভাবে নিযুক্ত করা হয়েছে।
প্ল্যাটফর্ম: ইলুমিনা নোভাসেক 6000
-
নন-রেফারেন্স ভিত্তিক mRNA সিকোয়েন্সিং-ইলুমিনা
এমআরএনএ সিকোয়েন্সিং নেক্সট জেনারেশন সিকোয়েন্সিং টেকনিক (এনজিএস) গ্রহণ করে মেসেঞ্জার আরএনএ(এমআরএনএ) ফর্ম ইউক্যারিওটকে নির্দিষ্ট সময়ে ক্যাপচার করতে যা কিছু বিশেষ ফাংশন সক্রিয় হয়।বিভক্ত করা দীর্ঘতম প্রতিলিপিটিকে 'ইউনিজিন' বলা হয় এবং পরবর্তী বিশ্লেষণের জন্য রেফারেন্স ক্রম হিসাবে ব্যবহৃত হয়, যা রেফারেন্স ছাড়াই প্রজাতির আণবিক প্রক্রিয়া এবং নিয়ন্ত্রক নেটওয়ার্ক অধ্যয়নের একটি কার্যকর উপায়।
ট্রান্সক্রিপ্টোম ডেটা সমাবেশ এবং ইউনিজিন কার্যকরী টীকা পরে
(1) SNP বিশ্লেষণ, SSR বিশ্লেষণ, CDS ভবিষ্যদ্বাণী এবং জিনের গঠন প্রিফর্ম করা হবে।
(2) প্রতিটি নমুনায় ইউনিজিন এক্সপ্রেশনের পরিমাণ নির্ধারণ করা হবে।
(3) নমুনার (বা গোষ্ঠী) মধ্যে ভিন্নভাবে প্রকাশিত ইউনিজিনগুলি ইউনিজিন অভিব্যক্তির উপর ভিত্তি করে আবিষ্কৃত হবে
(4) পৃথকভাবে প্রকাশিত ইউনিজিনগুলির ক্লাস্টারিং, কার্যকরী টীকা এবং সমৃদ্ধকরণ বিশ্লেষণ করা হবে
-
দীর্ঘ নন-কোডিং সিকোয়েন্সিং-ইলুমিনা
লং নন-কোডিং RNAs (lncRNAs) হল এক ধরনের RNA অণু যার দৈর্ঘ্য 200 nt-এর বেশি, যেগুলি অত্যন্ত কম কোডিং সম্ভাবনার দ্বারা চিহ্নিত করা হয়।LncRNA, নন-কোডিং RNA-তে একটি মূল সদস্য হিসাবে, প্রধানত নিউক্লিয়াস এবং প্লাজমাতে পাওয়া যায়।সিকোয়েন্সিং টেকনোলজি এবং বায়োইনফর্টিক্সের বিকাশ অসংখ্য নভেল lncRNA-এর শনাক্ত করতে এবং জৈবিক ফাংশনগুলির সাথে যুক্ত করতে সক্ষম করে।সঞ্চিত প্রমাণগুলি পরামর্শ দেয় যে lncRNA ব্যাপকভাবে এপিজেনেটিক রেগুলেশন, ট্রান্সক্রিপশন রেগুলেশন এবং পোস্ট-ট্রান্সক্রিপশন রেগুলেশনের সাথে জড়িত।
-
ছোট আরএনএ সিকোয়েন্সিং-ইলুমিনা
ছোট আরএনএ বলতে বোঝায় নন-কোডিং আরএনএ অণুগুলির একটি শ্রেণী যা সাধারণত 200nt এর কম দৈর্ঘ্যের হয়, যার মধ্যে রয়েছে মাইক্রো RNA (miRNA), ছোট হস্তক্ষেপ RNA (siRNA), এবং piwi-interacting RNA (piRNA)।
মাইক্রোআরএনএ (এমআইআরএনএ) হল অন্তঃসত্ত্বা ছোট আরএনএর একটি শ্রেণী যার দৈর্ঘ্য প্রায় 20-24nt, যা কোষে বিভিন্ন গুরুত্বপূর্ণ নিয়ন্ত্রক ভূমিকা পালন করে।miRNA অনেক জীবন প্রক্রিয়ার সাথে জড়িত যা টিস্যু প্রকাশ করে - নির্দিষ্ট এবং পর্যায় - নির্দিষ্ট অভিব্যক্তি এবং বিভিন্ন প্রজাতিতে অত্যন্ত সংরক্ষিত।
-
সার্কআরএনএ সিকোয়েন্সিং-ইলুমিনা
সম্পূর্ণ ট্রান্সক্রিপ্টোম সিকোয়েন্সিং ডিজাইন করা হয়েছে সমস্ত ধরনের আরএনএ অণুকে প্রোফাইল করার জন্য, যার মধ্যে কোডিং (mRNA) এবং নন-কোডিং RNA (lncRNA, circRNA এবং miRNA সহ) যা নির্দিষ্ট সময়ে নির্দিষ্ট কোষ দ্বারা প্রতিলিপি করা হয়।সম্পূর্ণ ট্রান্সক্রিপ্টোম সিকোয়েন্সিং, যা "টোটাল আরএনএ সিকোয়েন্সিং" নামেও পরিচিত, এর লক্ষ্য ট্রান্সক্রিপ্টম স্তরে ব্যাপক নিয়ন্ত্রক নেটওয়ার্কগুলি প্রকাশ করা।এনজিএস প্রযুক্তির সুবিধা গ্রহণ করে, ceRNA বিশ্লেষণ এবং যৌথ RNA বিশ্লেষণের জন্য সম্পূর্ণ ট্রান্সক্রিপ্টোম পণ্যগুলির ক্রম উপলব্ধ রয়েছে, যা কার্যকরী চরিত্রায়নের দিকে প্রথম পদক্ষেপ প্রদান করে।circRNA-miRNA-mRNA ভিত্তিক ceRNA এর নিয়ন্ত্রক নেটওয়ার্ক প্রকাশ করছে।
-
সম্পূর্ণ ট্রান্সক্রিপ্টোম সিকোয়েন্সিং - ইলুমিনা
সম্পূর্ণ ট্রান্সক্রিপ্টোম সিকোয়েন্সিং ডিজাইন করা হয়েছে সমস্ত ধরনের আরএনএ অণুকে প্রোফাইল করার জন্য, যার মধ্যে কোডিং (mRNA) এবং নন-কোডিং RNA (lncRNA, circRNA এবং miRNA সহ) যা নির্দিষ্ট সময়ে নির্দিষ্ট কোষ দ্বারা প্রতিলিপি করা হয়।সম্পূর্ণ ট্রান্সক্রিপ্টোম সিকোয়েন্সিং, যা "টোটাল আরএনএ সিকোয়েন্সিং" নামেও পরিচিত, এর লক্ষ্য ট্রান্সক্রিপ্টম স্তরে ব্যাপক নিয়ন্ত্রক নেটওয়ার্কগুলি প্রকাশ করা।এনজিএস প্রযুক্তির সুবিধা গ্রহণ করে, ceRNA বিশ্লেষণ এবং যৌথ RNA বিশ্লেষণের জন্য সম্পূর্ণ ট্রান্সক্রিপ্টোম পণ্যগুলির ক্রম উপলব্ধ রয়েছে, যা কার্যকরী চরিত্রায়নের দিকে প্রথম পদক্ষেপ প্রদান করে।circRNA-miRNA-mRNA ভিত্তিক ceRNA এর নিয়ন্ত্রক নেটওয়ার্ক প্রকাশ করছে।
-
প্রোক্যারিওটিক আরএনএ সিকোয়েন্সিং
প্রোক্যারিওটিক আরএনএ সিকোয়েন্সিং পরবর্তী প্রজন্মের সিকোয়েন্সিং (এনজিএস) ব্যবহার করে একটি নির্দিষ্ট মুহুর্তে আরএনএর উপস্থিতি এবং পরিমাণ প্রকাশ করতে, পরিবর্তিত সেলুলার ট্রান্সক্রিপ্টোম বিশ্লেষণ করে।আমাদের কোম্পানির প্রোক্যারিওটিক আরএনএ সিকোয়েন্সিং, বিশেষত রেফারেন্স জিনোম সহ প্রোক্যারিওটগুলিকে লক্ষ্য করে, আপনাকে ট্রান্সক্রিপ্টোম প্রোফাইলিং, জিন গঠন বিশ্লেষণ ইত্যাদি প্রদান করে। এটি মৌলিক বিজ্ঞান গবেষণা, ওষুধ গবেষণা এবং উন্নয়ন এবং আরও অনেক কিছুতে ব্যাপকভাবে প্রয়োগ করা হয়েছে।
প্ল্যাটফর্ম: ইলুমিনা নোভাসেক 6000
-
মেটাট্রান্সক্রিপ্টোম সিকোয়েন্সিং
মেটাট্রান্সক্রিপ্টোম সিকোয়েন্সিং প্রাকৃতিক পরিবেশে (যেমন মাটি, জল, সমুদ্র, মল এবং অন্ত্রের) মধ্যে জীবাণুর (ইউক্যারিওটস এবং প্রোক্যারিওটস উভয়) জিনের অভিব্যক্তি চিহ্নিত করে। বিশেষত, এই পরিষেবাগুলি আপনাকে জটিল মাইক্রোবিয়াল সম্প্রদায়ের সম্পূর্ণ জিন এক্সপ্রেশন প্রোফাইলিং পেতে দেয়, ট্যাক্সোনমিকসিস। প্রজাতির, ভিন্নভাবে প্রকাশিত জিনের কার্যকরী সমৃদ্ধকরণ বিশ্লেষণ এবং আরও অনেক কিছু।
প্ল্যাটফর্ম: ইলুমিনা নোভাসেক 6000
