সম্পূর্ণ ট্রান্সক্রিপটোম সিকোয়েন্সিং – ইলুমিনা
বৈশিষ্ট্য
● সম্পূর্ণ ট্রান্সক্রিপ্টোমের সিকোয়েন্সিং-এর জন্য দ্বৈত লাইব্রেরি তৈরি: আরআরএনএ ডেপ্লিশন লাইব্রেরি এবং স্মল আরএনএ লাইব্রেরি প্রস্তুতি।
● পৃথক বায়োইনফরমেটিক রিপোর্টে mRNA, lncRNA, circRNA এবং miRNA-এর পূর্ণাঙ্গ বায়োইনফরমেটিক বিশ্লেষণ, এবং সেইসাথে ceRNA নেটওয়ার্ক বিশ্লেষণ সহ সকল RNA এক্সপ্রেশনকে একত্রিত করে একটি যৌথ বিশ্লেষণ।
পরিষেবার সুবিধা
●ব্যাপক দক্ষতাআমরা বিভিন্ন ধরনের নমুনা নিয়ে ২১০০টিরও বেশি সম্পূর্ণ ট্রান্সক্রিপ্টোম প্রকল্প সম্পন্ন করেছি। আমরা প্রতিটি প্রকল্পে আমাদের বিপুল অভিজ্ঞতা নিয়ে আসি।
●কঠোর মান নিয়ন্ত্রণআমরা নমুনা প্রস্তুতি থেকে শুরু করে লাইব্রেরি প্রস্তুতি, সিকোয়েন্সিং এবং বায়োইনফরমেটিক্স পর্যন্ত সকল পর্যায়ে মূল নিয়ন্ত্রণ ব্যবস্থা প্রয়োগ করি। আমাদের সতর্ক পর্যবেক্ষণ ধারাবাহিকভাবে উচ্চ মানের ফলাফল প্রদান নিশ্চিত করে।
●বিশদ টীকাআমরা ডিফারেনশিয়ালি এক্সপ্রেসড জিন (ডিইজি)-গুলোকে কার্যকরীভাবে টীকাযুক্ত করতে এবং সংশ্লিষ্ট এনরিচমেন্ট বিশ্লেষণ সম্পাদন করতে একাধিক ডেটাবেস ব্যবহার করি। এই ব্যাপক পদ্ধতিটি ট্রান্সক্রিপ্টোম প্রতিক্রিয়ার অন্তর্নিহিত কোষীয় এবং আণবিক প্রক্রিয়াগুলো সম্পর্কে অন্তর্দৃষ্টি প্রদান করে, যা আপনার পরীক্ষার ডেটা সম্পর্কে সম্ভাব্য সমস্ত তথ্য প্রাপ্তি নিশ্চিত করে।
●নিয়ন্ত্রক নেটওয়ার্কগুলির গভীর বিশ্লেষণmRNA, lncRNA, circRNA, ও miRNA-এর যুগপৎ সিকোয়েন্সিং এবং একটি বিশদ বায়োইনফরমেটিক কর্মপ্রবাহের মাধ্যমে ceRNA নেটওয়ার্ক বিশ্লেষণ সম্ভব হয়।
●বিক্রয়োত্তর সহায়তাউপস্থিত থাকার গুরুত্ব আমরা বুঝি, তাই প্রকল্প সমাপ্তির পরেও আমাদের প্রতিশ্রুতি ৩ মাসের বিক্রয়োত্তর সেবার মাধ্যমে প্রসারিত হয়। এই সময়ে, আমরা প্রকল্পের ফলো-আপ, সমস্যা সমাধানে সহায়তা এবং ফলাফল সম্পর্কিত যেকোনো জিজ্ঞাসার সমাধানের জন্য প্রশ্নোত্তর পর্বের আয়োজন করে থাকি।
নমুনার প্রয়োজনীয়তা এবং ডেলিভারি
| লাইব্রেরি | ক্রমবিন্যাস কৌশল | ডেটা সুপারিশ করা হয়েছে | গুণমান নিয়ন্ত্রণ |
| আরআরএনএ হ্রাস পেয়েছে | ইলুমিনা পিই১৫০ | ১৬ জিবি | Q30≥85% |
| নির্বাচিত আকার | ইলুমিনা SE50 | ১০-২০ মিলিয়ন রিড |
নমুনা প্রয়োজনীয়তা:
নিউক্লিওটাইড:
| ঘনত্ব (ng/μl) | পরিমাণ (μg) | বিশুদ্ধতা | সততা |
| ≥ ৮০ | ≥ ১.৬ | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 জেলে সীমিত বা কোনো প্রোটিন বা ডিএনএ দূষণ দেখা যায়নি। | RIN≥6.0 ৫.০≥২৮এস/১৮এস≥১.০; সীমিত বা কোনো বেসলাইন উচ্চতা নেই |
প্রস্তাবিত নমুনা ডেলিভারি
পাত্র: ২ মিলি সেন্ট্রিফিউজ টিউব (টিন ফয়েল ব্যবহার করা বাঞ্ছনীয় নয়)
নমুনার নামকরণ: গ্রুপ+প্রতিলিপি, যেমন A1, A2, A3; B1, B2, B3।
চালান:
১. ড্রাই-আইস: নমুনাগুলো ব্যাগে ভরে ড্রাই-আইসের মধ্যে পুঁতে রাখতে হবে।
২. আরএনএস্টেবল টিউব: আরএনএ নমুনা আরএনএ স্থিতিশীলকরণ টিউবে (যেমন আরএনএস্টেবল®) শুকিয়ে কক্ষ তাপমাত্রায় পাঠানো যেতে পারে।
পরিষেবা কার্যপ্রবাহ
পরীক্ষার নকশা
নমুনা সরবরাহ
আরএনএ নিষ্কাশন
গ্রন্থাগার নির্মাণ
ক্রমবিন্যাস
ডেটা বিশ্লেষণ
বিক্রয়োত্তর সেবা
বায়োইনফরমেটিক্স
প্রতিটি ভিন্ন ভিন্ন আরএনএ-এর উপর করা সমস্ত বিশ্লেষণের পাশাপাশি, ৪ ধরনের আরএনএ-কে আমাদের যৌথ বিশ্লেষণে একত্রিত করা হয়েছে:
- সকল বিভিন্ন ধরণের আরএনএ ডেটার মধ্যে সহ-অভিব্যক্তি বিশ্লেষণ
- আরএনএ অভিব্যক্তির সংক্ষিপ্ত বিবরণ
- ডিফারেনশিয়াল এক্সপ্রেশনের সংক্ষিপ্ত বিবরণ
- CeRNA নেটওয়ার্ক
- পথটিতে সমন্বিত মূল জিনগুলি
- সংরক্ষণ বিশ্লেষণ
- লক্ষ্য সম্পর্ক
আরএনএ অভিব্যক্তির সংক্ষিপ্ত বিবরণ
ভিন্নভাবে প্রকাশিত জিন
ceRNA বিশ্লেষণ
ভিন্নভাবে প্রকাশিত miRNA এবং সম্পর্কিত RNA
নির্বাচিত প্রকাশনা সংকলনের মাধ্যমে BMKGene-এর সম্পূর্ণ ট্রান্সক্রিপ্টোম সিকোয়েন্সিং পরিষেবার দ্বারা সাধিত গবেষণার অগ্রগতি অন্বেষণ করুন।
দাই, ওয়াই. এট আল. (২০২২) 'আরএনএ-সিকোয়েন্সিং দ্বারা শনাক্তকৃত কাশিন-বেক রোগে এমআরএনএ, এলএনসিআরএনএ এবং এমআইআরএনএ-এর ব্যাপক অভিব্যক্তি প্রোফাইল',আণবিক ওমিক্স, 18(2), পৃ. 154-166। doi: 10.1039/D1MO00370D।
লিউ, এন. ন্যান প্রমুখ (২০২২) 'শীতকালীন সময়ে চাংবাই পর্বতে এপিস সেরানার শৈত্য-সহনশীলতার পূর্ণাঙ্গ ট্রান্সক্রিপ্টোম বিশ্লেষণ।'জিন, ৮৩০, পৃষ্ঠা ১৪৬৫0৩–১৪৬৫0৩। ডিওআই: 10.1016/J.GENE.2022.146503।
ওয়াং, এক্সজে এট আল. (২০২২) 'স্মল সেল লাং ক্যান্সারে প্রতিযোগী এন্ডোজেনাস আরএনএ নিয়ন্ত্রণ নেটওয়ার্কের মাল্টি-ওমিক্স ইন্টিগ্রেশন-ভিত্তিক অগ্রাধিকার নির্ধারণ: আণবিক বৈশিষ্ট্য এবং ঔষধ প্রার্থী',ফ্রন্টিয়ার্স ইন অনকোলজি, 12, পৃ. 904865. doi: 10.3389/FONC.2022.904865/BIBTEX.
জু, পি. প্রমুখ (২০২২) 'চিনাবাদামে রুট-নট নেমাটোডের প্রতিক্রিয়ায় সম্ভাব্য প্রক্রিয়া সম্পর্কে lncRNA/circRNA-miRNA-mRNA এক্সপ্রেশন প্রোফাইলের সমন্বিত বিশ্লেষণ নতুন অন্তর্দৃষ্টি প্রকাশ করে',বিএমসি জিনোমিক্স, 23(1), পৃষ্ঠা 1–12। doi: 10.1186/S12864-022-08470-3/FIGURES/7।
ইয়ান, জেড. এট আল. (২০২২) 'লাল এলইডি বিকিরণের মাধ্যমে ব্রোকলির ফসল-পরবর্তী গুণমান বজায় রাখার সাথে সম্পর্কিত আণবিক প্রক্রিয়াগুলিকে সম্পূর্ণ-ট্রান্সক্রিপটোম আরএনএ সিকোয়েন্সিং তুলে ধরে',ফসল-পরবর্তী জীববিজ্ঞান এবং প্রযুক্তি, ১৮৮, পৃ. ১১১৮৭৮। ডিওআই: ১০.১০১৬/জে.পোস্টহার্ভবায়ো.২০২২.১১১৮৭৮।
