Proizvodi

DNK/RNA sekvenciranje – Nanopore sekvencer

Sekvenciranje DNK/RNA – istaknuta slika sekvencera nanopora

ONT sekvenciranje je tehnologija sekvenciranja jednog molekula u realnom vremenu električnog signala zasnovana na nanoporama, princip sekvenciranja svake platforme je isti.Dvolančana DNK/RNA će se vezati za nanoporozni protein ugrađen u biofilm i odmotati se pod vođstvom motornog proteina, pod dejstvom razlike napona sa obe strane biofilma, DNK/RNA lanci prolaze kroz protein nanopornog kanala na određenom stopa.Zbog razlika u hemijskim svojstvima različitih baza na DNK/RNA lancu, kada jedna baza ili molekul DNK prođe kroz kanal nanopora, to će uzrokovati promjenu različitih električnih signala.Otkrivanjem ovih signala i odgovarajućim njima, mogu se izračunati odgovarajući bazni tipovi i može se završiti detekcija sekvence u realnom vremenu.

Kontaktiraj nas

Detalji usluge

Demo rezultat

Detalji usluge Karakteristike

Platforma	Veličina biblioteke	Teoretski prinos podataka (po ćeliji)	Preciznost sa jednom bazom	Prijave
Nanopore	8Kb, 10kb, 20kb, Ultralong, cDNA-PCR	70-90Gb/cell	85-92%	SV pozivanje, De novo, Sekvenciranje pune dužine, Iso-Seq, Oznaka gena, Detekcija metilacije DNK

Prednosti usluge

● Preko 5 godina iskustva na PacBio platformi za sekvenciranje sa hiljadama zatvorenih projekata sa različitim vrstama.
● BMKGENE je zvanični partner Oxford Nanoporea, sa RNA/DNK sertifikacijom dvostruke platforme.
● Postoje mainstream modeli sekvencera sa kompletnom opremom i dovoljnom propusnošću sekvenciranja.
● Na osnovu Nanopore platforme, više od 10 istraživanja Denovo na životinjama i biljkama objavljeno je u međunarodno priznatim časopisima.

Zahtjevi za uzorke

Tip uzorka

Iznos

Koncentracija (Qubit®)

Volume

Čistoća

Drugi

Genomska DNK

Zavisi od zahtjeva za podacima

≥20ng/μl

≥15μl

OD260/280=1,7-2,2;

OD260/230≥1,5；

Jasan vrh na 260 nm, bez kontaminacije

Koncentraciju treba mjeriti Qubitom i Qubit/Nanopore ≤ 2

Totalna RNA

≥1.2μg

≥100μg/μl

≥15μl

OD260/280=1,7-2,5;

OD260/230=0,5-2,5；bez kontaminacije

RIN vrijednost ≥7,5

Service Workflow

Priprema uzorka

Izgradnja biblioteke

Sekvenciranje

Analiza podataka

Isporuka projekta

Prethodno: DNK/RNA sekvenciranje – Illumina sekvencer

Sljedeći: Specifično-Locus Amplified Fragment Sequencing (SLAF-Seq)

Procjena kvaliteta podataka uzorka DNK

Tabela 1. Statistika čistih podataka.

BMKID	rawSeqNum	rawSumBase	cleanSeqNum	cleanSumBase	cleanN50Len	cleanN90Len	cleanMeanLen	cleanMaxLen	cleanMeanQual
DNA_BMK01	1,218,239	26.37	1,121,736	25.90	28,014	15,764	23,090	143,181	9