BMKCloud Log in
条形banner-03

Proizvodi

Eukariotska mRNA Sequencing-Illumina

Sekvenciranje mRNA omogućava profilisanje svih mRNK transkribovanih iz ćelija pod specifičnim uslovima.To je moćna tehnologija za otkrivanje profila genske ekspresije, genskih struktura i molekularnih mehanizama određenih bioloških procesa.Do danas se sekvenciranje mRNA široko koristi u fundamentalnim istraživanjima, kliničkoj dijagnostici, razvoju lijekova itd.

Platforma: Illumina NovaSeq platforma


Detalji usluge

Bioinformatika

Demo Results

Prednosti

● Sa velikim iskustvom: Preko 200.000 uzoraka je obrađeno u BMK-u koji pokrivaju različite tipove uzoraka, uključujući kulturu ćelija, tkivo, telesnu tečnost, itd. i preko 7.000 mRNA-Seq projekata zatvorenih koji pokrivaju različite oblasti istraživanja.

● Strogi sistem kontrole kvaliteta: Osnovne tačke kontrole kvaliteta kroz sve korake, uključujući pripremu uzoraka, pripremu biblioteke, sekvenciranje i bioinformatiku su pod pomnim nadzorom kako bi se pružili rezultati visokog kvaliteta.

● Više dostupnih baza podataka za anotaciju funkcija i studije obogaćivanja radi ispunjavanja različitih istraživačkih ciljeva.

● Usluge nakon prodaje: Usluge nakon prodaje koje vrijede 3 mjeseca po završetku projekta, uključujući praćenje projekta, rješavanje problema, pitanja i odgovore o rezultatima, itd.

Zahtjevi za uzorke i dostava

Biblioteka Strategija sekvenciranja Podaci se preporučuju Kontrola kvaliteta
Poly A obogaćen Illumina PE150

6 Gb

Q30≥85%

Uzorci zahtjeva:

nukleotidi:

Konc. (ng/μl)

Količina (μg)

Čistoća

Integritet

≥ 20

≥ 0,5

OD260/280=1,7-2,5

OD260/230=0,5-2,5

Ograničena ili nikakva kontaminacija proteina ili DNK prikazana na gelu.

Za biljke: RIN≥6,5;

Za životinje: RIN≥7,0;

5.0≥28S/18S≥1.0;

ograničeno ili nikakvo podizanje osnovne linije

Tkivo: Težina (suvo):≥1 g
*Za tkivo manje od 5 mg, preporučujemo da pošaljete fleš zamrznut (u tečnom azotu) uzorak tkiva.

ćelijska suspenzija:Broj ćelija = 3×106- 1×107
*Preporučujemo slanje zamrznutog ćelijskog lizata.U slučaju da ta ćelija broji manji od 5×105.

Uzorci krvi:Volumen≥1 ml

mikroorganizam:Masa ≥ 1 g

Preporučena dostava uzorka

Spremnik: epruveta za centrifugiranje od 2 ml (ne preporučuje se limena folija)

Označavanje uzorka: Grupa+replikacija npr. A1, A2, A3;B1, B2, B3... ...

pošiljka:

  1. Suhi led: Uzorke je potrebno spakovati u vreće i zakopati u suvi led.
  2. RNK stabilne epruvete: Uzorci RNK se mogu sušiti u RNA stabilizacijskoj cijevi (npr. RNAstable®) i otpremiti na sobnoj temperaturi.

Tok rada usluge

Uzorak QC

Dizajn eksperimenta

dostava uzorka

Isporuka uzorka

Pilot eksperiment

Ekstrakcija RNK

Library Preparation

Izgradnja biblioteke

Sekvenciranje

Sekvenciranje

Analiza podataka

Analiza podataka

Usluge nakon prodaje

Usluge nakon prodaje


  • Prethodno:
  • Sljedeći:

  • Bioinformatika

    wps_doc_10

    Eukariotski tok rada analize sekvenciranja mRNA

    Bioinformatika

    ØKontrola kvaliteta sirovih podataka

    ØReferentno poravnanje genoma

    ØAnaliza strukture transkripta

    ØKvantifikacija izraza

    ØAnaliza diferencijalnog izraza

    ØAnotacija i obogaćivanje funkcija

    1.Kriva zasićenja podataka mRNA

    3(1)

    2.Analiza diferencijalne ekspresije-Vulkanski dijagram

    4(1)

    3.KEGG napomena na DEG

    5(1)

    4.GO klasifikacija na DEG

    6(1)

    dobiti citat

    Napišite svoju poruku ovdje i pošaljite nam je

    Pošaljite nam svoju poruku: