BMKCloud Log in
条形banner-03

Proizvodi

Analiza asocijacija na nivou genoma

Studija asocijacija na nivou genoma (GWAS) ima za cilj identifikaciju genetskih varijanti (genotipa) koje su povezane sa specifičnim osobinama (fenotipom).GWAS studija istražuje genetske markere koji prelaze cijeli genom velikog broja individua i predviđa povezanost genotip-fenotip statističkom analizom na nivou populacije.Široko se primjenjuje u istraživanju ljudskih bolesti i funkcionalnom rudarenju gena na složenim osobinama životinja ili biljaka.


Detalji usluge

Demo rezultat

Featured Publication

image3

1. Prednosti usluge

● Brojni projektni slučajevi: od svog osnivanja 2009. godine, BMKGENE je završio stotine projekata vrsta u istraživanju GWAS populacije, pomogao istraživačima da objave više od 100 članaka, a kumulativni faktor uticaja je dostigao 500.
● Profesionalni analitičari.
● Kratak ciklus analize.
● Precizno prikupljanje podataka.

2. Specifikacije usluge

Tip

Populaciona skala

Strategija sekvenciranja i dubina

SLAF-GWAS Broj uzorka ≥200 Veličina genoma < 400M, sa ref-genomom, preporučuje se WGS

Veličina genoma ≤ 1G, 100K oznake i 10X

1G ≤ Veličina genoma ≤ 2G, 200K oznake i 10X

Veličina genoma > 2G, 300K oznake i 10X

WGS-GWAS

Broj uzorka ≥200

10X za svaki uzorak

3. Odabir materijala

动物1
动物2
image7

Različite sorte, podvrste, landrase/genske banke/mješovite porodice/divlji resursi

Različite sorte, podvrste, domaće rase

Porodica sa polubratom/porodica sa punim bratom/divlji resursi

4. Analiza bioinformacija

● Analiza asocijacija na nivou genoma
● Analiza i skrining značajnog SNP-a
● Funkcionalna oznaka gena kandidata

5. Tok rada servisa

Uzorak QC

Dizajn eksperimenta

dostava uzorka

Isporuka uzorka

Pilot eksperiment

Ekstrakcija RNK

Library Preparation

Izgradnja biblioteke

Sekvenciranje

Sekvenciranje

Analiza podataka

Analiza podataka

Usluge nakon prodaje

Usluge nakon prodaje


  • Prethodno:
  • Sljedeći:

  • a.Fenotip QC

    Histogram raspodjele frekvencije

    image9

    Statistika fenotipa

    image10

    b.Analiza asocijacija (Model: GEMMA, FaST-LMM, EMMAX)

    QQ Plot

    image11

    Manhattan Plot

    Ammonia_emmax_manhattan_00

    Godina

    Journal

    IF

    Naslov

    2022

    NC

    17.69

    Genomska osnova giga-hromozoma i giga-genoma drveća božura Paeonia ostii

    2015

    NP

    7.43

    Otisci pripitomljavanja usidre genomske regije od agronomskog značaja u soji

    2018

    MP

    9.32

    Ponovno sekvenciranje cijelog genoma svjetske kolekcije aksesija uljane repice otkriva genetsku osnovu njihove divergencije ekotipova

    2022

    HR

    7.29

    Analiza povezanosti na nivou genoma pruža molekularni uvid u prirodnu varijaciju veličine sjemenki lubenice

    dobiti citat

    Napišite svoju poruku ovdje i pošaljite nam je

    Pošaljite nam svoju poruku: