Dugo nekodirajuće sekvenciranje-Illumina
Prednosti usluge
●Zajednička analiza mRNA i lncRNA: kombinovanjem kvantifikacije transkripata mRNA sa proučavanjem lncRNA i njihovih meta, moguće je dobiti dubinski pregled regulatornog mehanizma koji leži u osnovi ćelijskog odgovora.
●Extensive Expertise: Naš tim donosi bogato iskustvo u svaki projekat, sa evidencijom obrade preko 23.000 uzoraka u BMK-u koji obuhvata različite tipove uzoraka i lncRNA projekte.
●Rigorozna kontrola kvaliteta: Implementiramo ključne kontrolne tačke u svim fazama, od pripreme uzoraka i biblioteke do sekvenciranja i bioinformatike. Ovaj pedantan nadzor osigurava isporuku konzistentno visokokvalitetnih rezultata.
●Podrška nakon prodaje: Naša posvećenost se proteže i dalje od završetka projekta uz period od 3 mjeseca nakon prodaje. Za to vrijeme nudimo praćenje projekta, pomoć u rješavanju problema i sesije pitanja i odgovora kako bismo odgovorili na sva pitanja u vezi s rezultatima.
Zahtjevi za uzorke i dostava
| Biblioteka | Platforma | Preporučeni podaci | Podaci QC |
| rRNA osiromašena usmjerena biblioteka | Illumina PE150 | 10-16 Gb | Q30≥85% |
nukleotidi:
| Konc. (ng/μl) | Količina (μg) | Čistoća | Integritet |
| ≥ 80 | ≥ 0,8 | OD260/280=1,7-2,5 OD260/230=0,5-2,5 Ograničena ili nikakva kontaminacija proteina ili DNK prikazana na gelu. | RIN≥6.0; 5.0≥28S/18S≥1.0; ograničeno ili nikakvo podizanje osnovne linije |
● Biljke:
Korijen, stabljika ili latica: 450 mg
List ili sjeme: 300 mg
Voće: 1,2 g
● Životinja:
Srce ili crijeva: 450 mg
Viscera ili mozak: 240 mg
Mišići: 600 mg
Kosti, kosa ili koža: 1,5 g
● Artropodi:
Insekti: 9g
Rakovi: 450 mg
● Puna krv:2 cijevi
● Ćelije: 106 ćelije
● Serum i plazma: 6 mL
Preporučena dostava uzorka
Spremnik: epruveta za centrifugiranje od 2 ml (ne preporučuje se limena folija)
Označavanje uzorka: Grupa+replikacija npr. A1, A2, A3; B1, B2, B3.
pošiljka:
1. Suhi led: Uzorci se moraju spakovati u vreće i zakopati u suvi led.
2. RNK stabilne epruvete: Uzorci RNK se mogu osušiti u RNA stabilizacijskoj epruveti (npr. RNAstable®) i poslati na sobnoj temperaturi.
Tok rada usluge
Dizajn eksperimenta
Isporuka uzorka
Ekstrakcija RNK
Izgradnja biblioteke
Sekvenciranje
Analiza podataka
Usluge nakon prodaje
Bioinformatika
Analiza diferencijalne genske ekspresije (DEGs).
Kvantifikacija ekspresije lncRNA – grupiranje
Obogaćivanje ciljnih gena lncRNA
Zajednička analiza položaja mRNA i lncRNA – Circos dijagram (srednji krug je mRNA, a unutrašnji krug je lncRNA)
Istražite napredak koji omogućava BMKGene lncRNA equencing usluge kroz odabranu kolekciju publikacija.
Ji, H. et al. (2020) 'Identifikacija, funkcionalno predviđanje i ključna verifikacija lncRNA lncRNA povezanih sa hladnim stresom u jetri pacova', Scientific Reports 2020 10:1, 10(1), str. 1–14. doi: 10.1038/s41598-020-57451-7.
Jia, Z. et al. (2021) 'Integrativna transkriptomska analiza otkriva imuni mehanizam za soj šarana otpornog na CyHV-3', Frontiers in Immunology, 12, str. 687151. doi: 10.3389/FIMMU.2021.687151/BIBTEX.
Wang, XJ et al. (2022) 'Prioritetizacija konkurentskih mreža za regulaciju endogene RNK u karcinomu pluća malih ćelija: molekularne karakteristike i kandidati za lijekove, Granice u onkologiji, 12, str. 904865. doi: 10.3389/FONC.2022.904865/BIBTEX.
Xiao, L. et al. (2020) 'Genetička disekcija mreže koekspresije gena koja leži u osnovi fotosinteze u Populusu', Plant Biotechnology Journal, 18(4), str. 1015–1026. doi: 10.1111/PBI.13270.
Zheng, H. et al. (2022) 'Globalna regulatorna mreža za disreguliranu ekspresiju gena i abnormalnu metaboličku signalizaciju u imunološkim ćelijama u mikrookruženju Gravesove bolesti i Hashimotoovog tiroiditisa', Granice u imunologiji, 13, str. 879824. doi: 10.3389/FIMMU.2022.879824/BIBTEX.
