BMKCloud Prijavite se

Proizvodi

Metatranscriptome Sequencing

Istaknuta slika sekvenciranja metatranskriptoma

Koristeći Illumina tehnologiju sekvenciranja, BMKGENE-ova usluga sekvenciranja metatranskriptoma otkriva dinamičku ekspresiju gena raznolikog niza mikroba, od eukariota do prokariota i virusa, u prirodnom okruženju kao što su tlo, voda, more, stolica i crijeva. Naša sveobuhvatna usluga osnažuje istraživače da uđu u kompletne profile ekspresije gena kompleksnih mikrobnih zajednica. Osim taksonomske analize, naša usluga sekvenciranja metatranskriptoma olakšava istraživanje funkcionalnog obogaćivanja, bacajući svjetlo na različito izražene gene i njihove uloge. Otkrijte mnoštvo bioloških uvida dok se krećete po složenim pejzažima ekspresije gena, taksonomske raznolikosti i funkcionalne dinamike unutar ovih raznolikih ekoloških niša.

Kontaktirajte nas

Detalji usluge

Bioinformatika

Demo Results

Istaknute publikacije

Service Features

● Deplecija rRNA praćena usmjerenom pripremom biblioteke mRNA.

● Sekvenciranje na Illumina NovaSeq.

Prednosti usluge

●Proučite promjene složenih mikrobnih zajednica:To se dešava na nivou transkripcije i istražuje potencijalne nove gene.

●Objašnjavanje interakcije mikrobne zajednice sa domaćinom ili okolinom.

●Sveobuhvatna bioinformatička analiza: Ovo pruža uvid u taksonomske i funkcionalne sastave zajednice, kao i analizu diferencijalne ekspresije gena.

●Opsežna genska anotacija:Korištenje ažuriranih baza podataka o funkcijama gena za informativne informacije o ekspresiji gena mikrobnih zajednica.

●Postprodajna podrška:Naša posvećenost se proteže i dalje od završetka projekta uz period od 3 mjeseca nakon prodaje. Za to vrijeme nudimo praćenje projekta, pomoć u rješavanju problema i sesije pitanja i odgovora kako bismo odgovorili na sva pitanja u vezi s rezultatima.

Specifikacije usluge

Platforma za sekvenciranje	Strategija sekvenciranja	Podaci se preporučuju	Kontrola kvaliteta podataka
Illumina NovaSeq	PE150	12Gb	Q30≥85%

Zahtjevi za uzorke

Koncentracija (ng/µL)	Ukupna količina (µg)	Volumen (µL)	OD260/280	OD260/230	RIN
≥50	≥1.0	≥20	1.8-2.0	1.0-2.5	≥6,5

Tok rada usluge

Isporuka uzorka

Izgradnja biblioteke

Sekvenciranje

Analiza podataka

Usluge nakon prodaje

Prethodno: De novo skupština genoma gljivica

sljedeće: Prokariotska RNK sekvenciranje

Uključuje sljedeću analizu:

● Kontrola kvaliteta podataka sekvenciranja

● Sklapanje transkripta

● Taksonomska oznaka i brojnost

● Funkcionalna napomena i obilje

● Kvantifikacija izraza i diferencijalna analiza

Taksonomska distribucija svakog uzorka:

Beta analiza raznolikosti: UPGMA

Funkcionalna napomena – GO obilje

Diferencijalna taksonomska brojnost – LEFSE

Istražite napredak koji omogućava BMKGene-ove usluge sekvenciranja meta transkriptomike kroz odabranu kolekciju publikacija.

Lu, Z. et al. (2023) 'Tolerancija kiseline bakterija koje koriste laktat iz reda Bacteroidales doprinosi prevenciji acidoze rumena kod koza prilagođenih visokokoncentriranoj prehrani',Animal Nutrition, 14, str. 130–140. doi: 10.1016/J.ANINU.2023.05.006.

Song, Z. et al. (2017) 'Razkrivanje osnovne funkcionalne mikrobiote u tradicionalnoj fermentaciji u čvrstom stanju pomoću amplikona visoke propusnosti i metatranskriptomskog sekvenciranja',Granice u mikrobiologiji, 8 (JUL). doi: 10.3389/FMICB.2017.01294/FULL.

Wang, W. et al. (2022) 'Novi mikovirusi otkriveni u metatranskriptomskom istraživanju fitopatogene alternarije gljive',Virusi, 14(11), str. 2552. doi: 10.3390/V14112552/S1.

Wei, J. et al. (2022) 'Paralelna analiza metatranskriptoma otkriva degradaciju sekundarnih metabolita biljaka od strane buba i njihovih crijevnih simbionta',Molekularno Ekologija, 31(15), str. 3999–4016. doi: 10.1111/MEC.16557.