MetatranScrticTome sekvenciranje
Servisne karakteristike
● Iscrpljivanje RRNA uslijedilo je za pripremu biblioteke za usmjeravanje MRNA.
● Sekviranje na illumini Novaseq.
Prednosti usluge
●Proučite promjene složenih mikrobnih zajednica:To se događa na transkripcijskom nivou i istražuju potencijalne nove gene.
●Objašnjenje interakcije mikrobne zajednice sa domaćinom ili okolinom.
●Sveobuhvatna bioinformatička analiza: Ovo pruža uvid u taksonomske i funkcionalne kompozicije u zajednici, kao i analizu diferencijalnih gena.
●Opsežna napomena gena:Koristeći moderne baze podataka o genu za informativne informacije o eizmiju gena mikrobnih zajednica.
●Podrška za post-prodaja:Naša posvećenost se pruža izvan završetka projekta sa tromjesečnim periodom usluge nakon prodaje. Za to vrijeme nudimo praćenje projekata, rešavanje problema i rješavanje problema i pitanja za rješavanje bilo kakvih upita u vezi s rezultatima.
Servisne specifikacije
| Platforma sekvenciranja | Strategija sekvenciranja | Preporučeni podaci | Kontrola kvaliteta podataka |
| Illumina Novaseq | PE150 | 12GB | Q30≥85% |
Uzorni zahtjevi
| Koncentracija (NG / μl) | Ukupni iznos (μg) | Volumen (μl) | OD260 / 280 | OD260 / 230 | Rin |
| ≥50 | ≥1.0 | ≥20 | 1.8-2.0 | 1.0-2.5 | ≥6.5 |
Servisni protok rada
Dostava uzoraka
Građevinarstvo biblioteke
Sekvenciranje
Analiza podataka
Usluge nakon prodaje
Uključuje sljedeću analizu:
● Sekviranje kontrole kvaliteta podataka
● Sklop transkripta
● Taksonomska napomena i obilje
● Funkcionalna napomena i obilje
● Kvantifikacija i diferencijalna analiza izražavanja
Taksonomska raspodjela svakog uzorka:
Analiza beta raznolikosti: UPGMA
Funkcionalna napomena - Idi obilje
Diferencijalna oporuba - Lefse
Istražite napredak koji su omogućili usluge sekvenciranja BMKGENE META TRANSISCISCICRICSTICS-a kroz kustornu kolekciju publikacija.
LU, Z. i dr. (2023) "kiselina tolerancije bakterija koje koriste laktate bakterija za narudžbu baktelama doprinosi prevenciji ruminalne acidoze u koza prilagođenim prehrani visokog koncentrata",Prehrana životinja, 14, str. 130-140. Doi: 10.1016 / j.aninu.2023.05.006.
Pjesma, Z. i dr. (2017) 'Umotavanje jezgre funkcionalne mikrobiote u tradicionalnoj čvrstoj fermentaciji sa visokim propusnim sredstvima i metatranscriptics Sequing',Granice u mikrobiologiji, 8 (jul). Doi: 10.3389 / fmicb.2017.01294 / puni.
Wang, W. i dr. (2022) 'Novel Mycoviruses otkriveni iz metatranScripTictics ankete fitopatogene alternarijske gljivice',Virusi, 14 (11), str. 2552. DOI: 10.3390 / V14112552 / S1.
Wei, J. i dr. (2022) 'Paralelna analiza metatranscript-a otkriva razgradnju sekundarnih metabolita postrojenja od strane buba i njihovih crijeva Symbioonss',Molekularan Ekologija, 31 (15), str. 3999-4016. DOI: 10.1111 / MEC.16557.
