Proizvodi

Sekvenciranje RNK sa jednim jezgrom

Istaknuta slika sekvenciranja RNK sa jednim jezgrom

Napredak u hvatanju jedne ćelije i tehnici izgradnje individualne biblioteke u kombinaciji sa sekvenciranjem visoke propusnosti omogućava studije genske ekspresije na bazi ćelije po ćeliju.Omogućava dublju i potpuniju sistemsku analizu složenih ćelijskih populacija, u kojoj se u velikoj mjeri izbjegava maskiranje njihove heterogenosti uzimanjem prosjeka svih ćelija.

Međutim, neke ćelije nisu prikladne za pretvaranje u jednoćelijsku suspenziju, pa su potrebne druge metode pripreme uzoraka – ekstrakcija jezgra iz tkiva, odnosno, jezgro se direktno ekstrahuje iz tkiva ili ćelije i priprema u jednonukleusnu suspenziju za jednostruke ćelije. sekvenciranje ćelija.

BMK pruža 10× Genomics ChromiumTM uslugu sekvenciranja jednoćelijske RNK.Ova usluga je široko korištena u studijama vezanim za bolesti, kao što su diferencijacija imunoloških stanica, heterogenost tumora, razvoj tkiva itd.

Čip prostornog transkriptoma: 10× Genomika

Platforma: Illumina NovaSeq platforma

Kontaktiraj nas

Detalji usluge

Bioinformatika

Demo Results

Tehnički princip

Izolacija jezgara se postiže pomoću 10× Genomics ChromiumTM, koji se sastoji od osmokanalnog mikrofluidnog sistema sa dvostrukim ukrštanjima.U ovom sistemu, perle gela sa bar kodovima i prajmerom, enzimi i jedno jezgro su inkapsulirani u kapi ulja veličine nanolitara, stvarajući gel perle u emulziji (GEM).Kada se formira GEM, u svakom GEM-u se vrši liza ćelija i oslobađanje bar kodova.mRNA se reverzno transkribuju u molekule cDNK sa 10× bar kodovima i UMI, koji su dalje podložni konstrukciji standardne biblioteke sekvenciranja.

Tkivo nije pogodno za pripremu jednoćelijske suspenzije

Ćelija / tkivo	Razlog
Nesvježe smrznuto tkivo	Nije moguće dobiti svježe ili dugo sačuvane organizacije
Mišićne ćelije, megakariociti, masnoće…	Prečnik ćelije je prevelik za ulazak u instrument
Jetra…	Previše krhak da bi se slomio, nesposoban da razlikuje pojedinačne ćelije
Neuronska ćelija, mozak…	Osetljiviji, lakši za stres, promeniće rezultate sekvenciranja
Gušterača, štitna žlijezda…	Bogat endogenim enzimima koji utiču na proizvodnju jednoćelijske suspenzije

Jedno jezgro protiv jedne ćelije

Jedno jezgro	Jednoćelijska
Neograničen prečnik ćelije	Prečnik ćelije: 10-40 μm
Materijal može biti zamrznuto tkivo	Materijal mora biti svježa maramica
Nizak stres zamrznutih ćelija	Tretman enzimima može izazvati reakciju na stres ćelije
Ne moraju se uklanjati crvena krvna zrnca	Crvena krvna zrnca se moraju ukloniti
Nuklearna ekspresija bioinformacija	Cijela ćelija izražava bioinformaciju