-
Sekvenciranje mRNA pune dužine-Nanopore
RNK sekvenciranje je neprocjenjivo sredstvo za sveobuhvatnu analizu transkriptoma.Bez sumnje, tradicionalno sekvenciranje kratkog čitanja ovdje je postiglo brojne važne pomake.Ipak, često nailazi na ograničenja u identifikaciji pune dužine izoforme, kvantifikaciji, PCR pristranosti.
Sekvenciranje nanopora razlikuje se od drugih platformi za sekvenciranje po tome što se nukleotidi čitaju direktno bez sinteze DNK i generiše dugo čitanje na desetinama kilobaza.Ovo omogućava direktno čitanje ukrštanjem transkripata pune dužine i rješavanje izazova u studijama na nivou izoforme.
Platforma：Nanopore PromethION
biblioteka:cDNA-PCR
-
De novo Sekvenciranje transkriptoma pune dužine -PacBio
De novosekvenciranje transkriptoma pune dužine, takođe poznato kaoDe novoIso-Seq koristi prednosti PacBio sekvencera u dužini čitanja, što omogućava sekvenciranje cDNK molekula pune dužine bez ikakvih prekida.Ovo u potpunosti izbjegava sve greške nastale u koracima sastavljanja transkripta i konstruira unigene skupove s rezolucijom na nivou izoforme.Ovaj unigenski skup pruža moćne genetske informacije kao "referentni genom" na nivou transkriptoma.Osim toga, u kombinaciji s podacima sekvenciranja sljedeće generacije, ova usluga omogućava preciznu kvantifikaciju ekspresije na nivou izoforme.
Platforma: PacBio Sequel IIBiblioteka: SMRT biblioteka zvona -
Sekvenciranje eukariotske mRNA-Illumina
Sekvenciranje mRNA omogućava profilisanje svih mRNK transkribovanih iz ćelija pod specifičnim uslovima.To je moćna tehnologija za otkrivanje profila genske ekspresije, genskih struktura i molekularnih mehanizama određenih bioloških procesa.Do danas se sekvenciranje mRNA široko koristi u fundamentalnim istraživanjima, kliničkoj dijagnostici, razvoju lijekova itd.
Platforma: Illumina NovaSeq 6000
-
Nereferentno sekvencioniranje mRNA-Illumina
Sekvenciranje mRNA usvaja tehniku sekvenciranja sljedeće generacije (NGS) za hvatanje glasničke RNK (mRNA) iz Eukariota u određenom periodu u kojem se neke posebne funkcije aktiviraju.Najduži spojeni transkript nazvan je 'Unigene' i korišten je kao referentna sekvenca za kasniju analizu, što je efikasno sredstvo za proučavanje molekularnog mehanizma i regulatorne mreže vrste bez reference.
Nakon sastavljanja podataka transkriptoma i unigene funkcionalne anotacije
(1) SNP analiza, SSR analiza, CDS predviđanje i genska struktura će se izvršiti.
(2) Kvantifikacija ekspresije unigena u svakom uzorku će se izvršiti.
(3) Diferencijalno izraženi unigeni između uzoraka (ili grupa) će biti otkriveni na osnovu unigene ekspresije
(4) Radit će se grupiranje, funkcionalna anotacija i analiza obogaćivanja različito izraženih unigena
-
Dugo nekodirajuće sekvenciranje-Illumina
Duge nekodirajuće RNK (lncRNA) su tip molekula RNK dužine preko 200 nt, koje karakteriše izuzetno nizak potencijal kodiranja.LncRNA, kao ključni član nekodirajuće RNA, uglavnom se nalazi u jezgru i plazmi.Razvoj tehnologije sekvenciranja i bioinformtike omogućava identifikaciju brojnih novih lncRNA i njihovo povezivanje sa biološkim funkcijama.Akumulativni dokazi sugeriraju da je lncRNA naširoko uključena u epigenetsku regulaciju, regulaciju transkripcije i post-transkripcijsku regulaciju.
-
Mala RNK sekvenciranje-Illumina
Mala RNK se odnosi na klasu nekodirajućih RNA molekula koje su obično manje od 200 nt u dužini, uključujući mikro RNK (miRNA), malu interferentnu RNK (siRNA) i RNK u interakciji s piwi (piRNA).
MikroRNA (miRNA) je klasa endogene male RNK dužine od oko 20-24nt, koja igra niz važnih regulatornih uloga u ćelijama.miRNA uključena u mnoge životne procese koji otkrivaju tkivo – specifično i stadijsko – specifičnu ekspresiju i visoko očuvanu kod različitih vrsta.
-
circRNA sekvenciranje-Illumina
Sekvenciranje cijelog transkriptoma je dizajnirano da profilira sve vrste RNA molekula, uključujući kodirajuće (mRNA) i nekodirajuće RNA (uključujući lncRNA, circRNA i miRNA) koje se transkribiraju od strane specifičnih stanica u određeno vrijeme.Sekvenciranje cjelokupnog transkriptoma, također poznato kao "ukupno sekvenciranje RNK" ima za cilj otkrivanje sveobuhvatnih regulatornih mreža na nivou transkriptoma.Koristeći prednosti NGS tehnologije, sekvence cijelih transkriptomskih proizvoda su dostupne za ceRNA analizu i zajedničku RNA analizu, što predstavlja prvi korak ka funkcionalnoj karakterizaciji.Otkrivanje regulatorne mreže ceRNA zasnovane na circRNA-miRNA-mRNA.
-
Sekvenciranje cijelog transkriptoma – Illumina
Sekvenciranje cijelog transkriptoma je dizajnirano da profilira sve vrste RNA molekula, uključujući kodirajuće (mRNA) i nekodirajuće RNA (uključujući lncRNA, circRNA i miRNA) koje se transkribiraju od strane specifičnih stanica u određeno vrijeme.Sekvenciranje cjelokupnog transkriptoma, također poznato kao "ukupno sekvenciranje RNK" ima za cilj otkrivanje sveobuhvatnih regulatornih mreža na nivou transkriptoma.Koristeći prednosti NGS tehnologije, sekvence cijelih transkriptomskih proizvoda su dostupne za ceRNA analizu i zajedničku RNA analizu, što predstavlja prvi korak ka funkcionalnoj karakterizaciji.Otkrivanje regulatorne mreže ceRNA zasnovane na circRNA-miRNA-mRNA.
-
Sekvenciranje prokariotske RNK
Sekvencioniranje prokariotske RNK koristi sekvenciranje sljedeće generacije (NGS) da otkrije prisustvo i količinu RNK u datom trenutku, analizom promjenjivog ćelijskog transkriptoma.Sekvencioniranje prokariotske RNK naše kompanije je posebno usmjereno na prokariote sa referentnim genomima, pružajući vam profiliranje transkriptoma, analizu strukture gena, itd. Široko je primijenjeno u temeljnim naučnim istraživanjima, istraživanju i razvoju lijekova i još mnogo toga.
Platforma: Illumina NovaSeq 6000
-
Sekvenciranje metatranskriptoma
Sekvenciranje metatranskriptoma identifikuje ekspresiju gena mikroba (i eukariota i prokariota) u prirodnom okruženju (tj. tlo, voda, more, izmet i crijeva). Konkretno, ove usluge vam omogućavaju da dobijete profiliranje cjelokupne genske ekspresije složenih mikrobnih zajednica, taksonomsku analizu vrsta, analiza funkcionalnog obogaćivanja različito eksprimiranih gena i drugo.
Platforma: Illumina NovaSeq 6000
