Re-seqüenciació del genoma sencer de bacteris i fongs
Els projectes de reseqüenciació del genoma sencer de bacteris i fongs són fonamentals per avançar en la genòmica microbiana, ja que permeten completar i comparar genomes microbians. Això facilita l'enginyeria de fermentació, l'optimització dels processos industrials i l'exploració de vies del metabolisme secundari. A més, la re-seqüenciació de fongs i bacteris és crucial per entendre l'adaptació ambiental, optimitzar les soques i revelar la dinàmica d'evolució genètica, amb àmplies implicacions en medicina, agricultura i ciències ambientals.
Avantatges del servei
●L'anàlisi bioinformàtica inclou trucades variants:Proporcionar coneixements funcionals sobre els genomes reseqüenciats.
● Àmplia experiència: Amb milers de projectes de reseqüenciació microbiana realitzats anualment, aportem més d'una dècada d'experiència, un equip d'anàlisi altament qualificat, contingut complet i un excel·lent suport postvenda.
●Suport postvenda:El nostre compromís s'estén més enllà de la finalització del projecte amb un període de servei postvenda de 3 mesos. Durant aquest temps, oferim seguiment del projecte, assistència per a la resolució de problemes i sessions de preguntes i respostes per resoldre qualsevol consulta relacionada amb els resultats.
Especificacions del servei
| Plataforma de seqüenciació | Estratègia de seqüenciació | Dades recomanades | Control de qualitat |
| Illumina NovaSeq | PE150 | Profunditat de 100x | Q30≥85% |
Exemples de requisits
| Concentració (ng/µL) | Import total (ng) | Volum (µl) |
| ≥1 | ≥60 | ≥20 |
Bacteris: ≥1x107 cèl·lules
Fongs unicel·lulars: ≥5x106-1x107 cèl·lules
Macro fongs: ≥4g
Flux de treball del servei
Lliurament de la mostra
Construcció de la biblioteca
Seqüenciació
Anàlisi de dades
Serveis postvenda
Inclou l'anàlisi següent:
- Control de qualitat de dades de seqüenciació
- Alineació amb el genoma de referència
- Variant de trucada: SNP i InDel
- Anotació de variants
Variant de trucada: tipus SNP
Variant de trucada: distribució de longitud InDel
Exploreu els avenços facilitats pels serveis de reseqüenciació del genoma microbià de BMKGene mitjançant una col·lecció de publicacions curada.
Jia, Y. et al. (2023) "Combinació de la re-seqüenciació del transcriptoma i del genoma sencer per detectar els gens de resistència a malalties per al panet de blat",Revista internacional de ciències moleculars, 24 (24). doi: 10.3390/IJMS242417356.
Jiang, M. et al. (2023) "El metabolisme de la glucosa controlat per ampicil·lina manipula la transició de la tolerància a la resistència en bacteris",Avenços de la Ciència, 9(10). doi: 10.1126/SCIADV.ADE8582/SUPPL_FILE/SCIADV.ADE8582_SM.PDF.
Yang, M. et al. (2022) 'Aliidiomarina halalkaliphila sp. nov., un bacteri haloalcalifílic aïllat d'un llac de soda a la Regió Autònoma de Mongòlia Interior, Xina', Int. J. Syst. Evol.Microbiol, 72, pàg. 5263. doi: 10.1099/ijsem.0.005263.
Zhu, Z., Wu, R. i Wang, G.-H. (2024) "Seqüència del genoma de Staphylococcus nepalensis ZZ-2023a, aïllada de Nasonia vitripennis",Anuncis de recursos de microbiologia. doi: 10.1128/MRA.00802-23.
