Transcriptoma espacial BMKMANU S1000
Esquema tècnic del transcriptoma espacial BMKMANU S1000
Avantatges de BMKMANU S1000
1) Resolució subcel·lular: cada àrea de captura contenia més de 2 milions de punts espacials amb codi de barres amb un diàmetre de 2,5 µm i un espai de 5 µm entre els centres de les taques, permetent l'anàlisi del transcriptoma espacial amb resolució subcel·lular (5 µm).
2) Anàlisi de resolució multinivell: anàlisi multinivell flexible que oscil·la entre 100 μm i 5 μm per resoldre diverses característiques del teixit amb una resolució òptima.
3) Perfil complet del transcriptoma: es poden analitzar les transcripcions capturades de tota la diapositiva de teixit, sense restriccions en el nombre de gens diana i l'àrea diana.
Especificacions del servei
| Biblioteca | Estratègia de seqüenciació | Sortida de dades recomanada |
| Biblioteca d'ADNc S1000 | BMKMANU S1000-Illumina PE150 | 60 Gb/mostra |
Exemples de requisits
| Mostra | Número | Mida | Qualitat de l'ARN |
| Bloc de teixit incrustat OCT | 2-3 blocs/mostra | Aprox.6,8x6,8x6,8 mm3 | RIN≥7 |
Per obtenir més detalls sobre la guia de preparació de mostres i el flux de treball del servei, no dubteu a parlar amb aExpert en BMKGENE
Flux de treball del servei
Disseny d'experiments
Lliurament de la mostra
Preexperimentació
Codi de barres espacial
Construcció de la biblioteca
Seqüenciació
Anàlisi de dades
Serveis postvenda
Les dades generades per BMKMANU S1000 s'analitzen mitjançant el programari "BSTMatrix", dissenyat de manera independent per BMKGENE, que inclou:
1) Generació de matrius d'expressió gènica
2) Tractament d'imatges HE
3) Compatible amb programari de tercers per a l'anàlisi
4) "BSTViewer" en línia ajuda a obtenir resultats de visualització a diferents resolucions.
1.Agrupació puntual
2.Distribució espacial
Note: Resoluciónivell = 13 (100 µm, esquerra); 7 (50 µm, dret)
3.Mapa de calor de agrupació d'abundància d'expressió del marcador
4.Anàlisi de dades entre mostres
