条形 Banner-03

Productes

Seqüenciació d'ADN/ARN - Seqüenciador de nanopor

La seqüenciació ONT és una única tecnologia de seqüenciació de senyal elèctric en temps real de molècules basada en nanopores, el principi de seqüenciació de cada plataforma és el mateix. L’ADN/ARN de doble cadena s’unirà a la proteïna nanoporosa incrustada al biofilm i desfer-se sota el plom de la proteïna motora, sota l’acció de la diferència de tensió dels dos costats del biofilm, les cadenes d’ADN/ARN passen per la proteïna del canal nanopor preu. A causa de les diferències de les propietats químiques de les diferents bases de la cadena ADN/ARN, quan una sola molècula de base o ADN passa pel canal nanopore, provocarà el canvi de diferents senyals elèctrics. En detectar i correspondre a aquests senyals, es poden calcular els tipus de base corresponents i es pot completar la detecció en temps real de la seqüència.


Detalls del servei

Resultat de la demostració

Funcions de detalls del servei

Plataforma

Mida de la biblioteca

Rendiment de dades teòriques (per cèl·lula)

Precisió de la base d'una sola base

Aplicacions

Nanopor

8KB, 10KB, 20KB, Ultralong, ADNc-PCR

70-90GB/Cèl·lula

85-92%

Trucades SV, de Novo, seqüenciació de longitud completa, iso-seq, anotació gènica, detecció de metilació de l'ADN

Avantatges del servei

● Experiència de més de 5 anys a la plataforma de seqüenciació de Pacbio amb milers de projectes tancats amb diverses espècies.
● BMKGENE és un soci oficial d'Oxford Nanopore, amb la certificació RNA/ADN de doble plataforma.
● Hi ha models principals de seqüenciadors amb equips complets i rendiment de seqüenciació suficient.
● A partir de la plataforma Nanopore, més de 10 investigacions d’animals i plantes s’han publicat en revistes de renom internacional.

Requisits de la mostra


Tipus de mostra

Quantitat

Concentració (qubit ®)

Volum

Puresa

Altres

ADN genòmic

Depèn del requisit de dades

 ≥20ng/μL

≥15 μl

OD260/280 = 1,7-2,2;

OD260/230≥1.5 ;

Clear pic a 260 nm , sense contaminacions

La concentració ha de ser mesurada per qubit i qubit/nanopor ≤ 2

ARN total

≥1,2μg

≥100μg/μL

≥15 μl

OD260/280 = 1,7-2,5;

OD260/230 = 0,5-2,5 ; Sense contaminacions

Valor RIN ≥7,5

 

Flux de treball del servei

Preparació de la mostra

Preparació de la mostra

Preparació de la biblioteca

Construcció de la biblioteca

Seqüenciació

Seqüenciació

Anàlisi de dades

Anàlisi de dades

Mostra qc

Lliurament del projecte


  • Anterior:
  • A continuació:

  • Avaluació de la qualitat de les dades de la mostra d'ADN

    Taula 1. Estadístiques sobre dades netes.

    Bmkid

    rawseqnum

    rawsumbasa

    neteSeqnum

    neteja

    NeteN50len

    netn90len

    netmeanlen

    netmaxlen

    CleanMeanQual

    ADN_BMK01

    1.218.239

    26.37

    1.121.736

    25,90

    28.014

    15.764

    23.090

    143.181

    9

    Avaluació de la qualitat de les dades de la mostra d’ARN

    Taula 1. Estadístiques sobre dades netes.

    Nom de fitxer

    Clientid

    ReadNum

    Cicenum

    N50

    Longitud mitjana

    MaxLength

    MeanQscore

    RNA_BMK001

    C2

    8.947.708

    4.047.230.083

    398

    452

    129.227

    Q12

    Figura 1. Distribució de longitud de lectura

    A3

    Figura 2. Distribució de puntuació de qualitat de dades netes

    A4

    Figura 3. Distribució de puntuacions de longitud i qualitat de dades netes

    A5

    Obteniu un pressupost

    Escriviu el vostre missatge aquí i ens ho envieu

    Envieu -nos el vostre missatge: