条形banner-03

Productes

Seqüenciació d'ADN/ARN: seqüenciador de nanopores

La seqüenciació ONT és una tecnologia de seqüenciació de senyals elèctrics en temps real d'una sola molècula basada en nanoporus. El principi de seqüenciació de cada plataforma és el mateix. L'ADN/ARN bicatenari s'uneix a la proteïna nanoporosa incrustada al biofilm i es desenrotlla sota el conducte de la proteïna motora. Sota l'acció de la diferència de voltatge a banda i banda del biofilm, les cadenes d'ADN/ARN passen a través de la proteïna del canal de nanoporus a una velocitat determinada. A causa de les diferències en les propietats químiques de les diferents bases de la cadena d'ADN/ARN, quan una sola base o molècula d'ADN passa a través del canal de nanoporus, provocarà el canvi de diferents senyals elèctrics. En detectar i correspondre a aquests senyals, es poden calcular els tipus de base corresponents i es pot completar la detecció en temps real de la seqüència.


Detalls del servei

Resultat de la demostració

Característiques dels detalls del servei

Plataforma

Mida de la biblioteca

Rendiment de dades teòriques (per cel·la)

Precisió de base única

Aplicacions

Nanoporus

8Kb, 10kb, 20kb, Ultrallarg, cDNA-PCR

70-90 Gb/Cèl·lula

85-92%

Crida SV, De novo, Seqüenciació de longitud completa, Iso-Seq, Anotació gènica, Detecció de metilació de l'ADN

Avantatges del servei

● Més de 5 anys d'experiència en la plataforma de seqüenciació PacBio amb milers de projectes tancats amb diverses espècies.
● BMKGENE és un soci oficial d'Oxford Nanopore, amb certificació de doble plataforma ARN/ADN.
● Hi ha models convencionals de seqüenciadors amb equipament complet i un rendiment de seqüenciació suficient.
● Basant-se en la plataforma Nanopore, s'han publicat més de 10 investigacions de Denovo en animals i plantes en revistes de renom internacional.

Requisits de mostra


Tipus de mostra

Import

Concentració (Qubit ®)

Volum

Puresa

Altres

ADN genòmic

Depèn del requisit de dades

 ≥20 ng/μl

≥15 μl

DO260/280=1,7-2,2;

OD260/230≥1.5;

Pic clar a 260 nm, sense contaminacions

La concentració s'ha de mesurar per Qubit i Qubit/Nanopore ≤ 2

ARN total

≥1,2 μg

≥100 μg/μl

≥15 μl

DO260/280=1,7-2,5;

OD260/230=0.5-2.5; sense contaminacions

Valor RIN ≥7,5

 

Flux de treball del servei

preparació de mostres

Preparació de mostres

Preparació de la biblioteca

Construcció de biblioteques

Seqüenciació

Seqüenciació

Anàlisi de dades

Anàlisi de dades

Control de qualitat de la mostra

Lliurament del projecte


  • Anterior:
  • Següent:

  • Avaluació de la qualitat de les dades de la mostra d'ADN

    Taula 1. Estadístiques sobre dades netes.

    BMKID

    núm. seq. crua

    rawSumBase

    cleanSeqNum

    netejaSumaBase

    cleanN50Len

    cleanN90Len

    cleanMeanLen

    cleanMaxLen

    cleanMeanQual

    ADN_BMK01

    1.218.239

    26.37

    1.121.736

    25,90

    28.014

    15.764

    23.090

    143.181

    9

    Avaluació de la qualitat de les dades de la mostra d'ARN

    Taula 1. Estadístiques sobre dades netes.

    Nom del fitxer

    ID de client

    LecturaNúm.

    Número de base

    N50

    Longitud mitjana

    Longitud màxima

    Puntuació mitjana

    RNA_BMK001

    C2

    8.947.708

    4.047.230.083

    398

    452

    129.227

    Q12

    Figura 1. Distribució de la longitud de lectura

    A3

    Figura 2. Distribució de la puntuació de qualitat de les dades netes

    A4

    Figura 3. Distribució de la longitud i la puntuació de qualitat de les dades netes

    A5

    obtenir un pressupost

    Escriu el teu missatge aquí i envia'ns-el

    Envia'ns el teu missatge: