BMKCloud Log in
条形banner-03

Productes

Seqüenciació d'ADN/ARN - Seqüenciador Nanopore

La seqüenciació ONT és una tecnologia de seqüenciació de senyal elèctric en temps real d'una sola molècula basada en nanopors, el principi de seqüenciació de cada plataforma és el mateix.L'ADN/ARN de doble cadena s'uneix a la proteïna nanoporosa incrustada en el biofilm i es desenrotlla sota el plom de la proteïna motora, sota l'acció de la diferència de voltatge d'ambdós costats del biofilm, les cadenes d'ADN/ARN passen a través de la proteïna del canal de nanoporos a un cert punt. taxa.A causa de les diferències de propietats químiques de les diferents bases de la cadena d'ADN/ARN, quan una sola base o molècula d'ADN passa pel canal de nanopors, provocarà el canvi de diferents senyals elèctrics.Mitjançant la detecció i la correspondència d'aquests senyals, es poden calcular els tipus de base corresponents i es pot completar la detecció en temps real de la seqüència.


Detalls del servei

Resultat de demostració

Característiques dels detalls del servei

Plataforma

Mida de la biblioteca

Rendiment de dades teòriques (per cel·la)

Precisió d'una sola base

Aplicacions

Nanopor

8Kb, 10kb, 20kb, ultrallarg, cDNA-PCR

70-90 Gb/cel·la

85-92%

Crida SV, De novo, Seqüenciació de llarga durada, Iso-Seq, Anotació de gens, Detecció de metilació de l'ADN

Avantatges del servei

● Més de 5 anys d'experiència a la plataforma de seqüenciació PacBio amb milers de projectes tancats amb diverses espècies.
● BMKGENE és soci oficial d'Oxford Nanopore, amb certificació d'ARN/ADN de doble plataforma.
● Hi ha models convencionals de seqüenciadors amb un equip complet i un rendiment de seqüenciació suficient.
● A partir de la plataforma Nanopore, s'han publicat més de 10 investigacions de Denovo en animals i plantes en revistes de renom internacional.

Exemples de requisits


Tipus de mostra

Import

Concentració (Qubit ®)

Volum

Puresa

Altres

ADN genòmic

Depèn del requisit de dades

 ≥20ng/μl

≥15μl

OD260/280=1,7-2,2;

OD260/230≥1,5;

Pic clar a 260 nm, sense contaminacions

La concentració s'ha de mesurar amb Qubit i Qubit/Nanopore ≤ 2

ARN total

≥1,2 μg

≥100μg/μl

≥15μl

OD260/280=1,7-2,5;

OD260/230 = 0,5-2,5; sense contaminacions

Valor RIN ≥7,5

 

Flux de treball del servei

preparació de mostres

Preparació de la mostra

Preparació de la biblioteca

Construcció de la biblioteca

Seqüenciació

Seqüenciació

Anàlisi de dades

Anàlisi de dades

Mostra de control de qualitat

Lliurament del projecte


  • Anterior:
  • Pròxim:

  • Avaluació de la qualitat de les dades de la mostra d'ADN

    Taula 1. Estadístiques de dades netes.

    BMKID

    rawSeqNum

    rawSumBase

    cleanSeqNum

    cleanSumBase

    cleanN50Len

    cleanN90Len

    cleanMeanLen

    cleanMaxLen

    cleanMeanQual

    DNA_BMK01

    1.218.239

    26.37

    1.121.736

    25.90

    28.014

    15.764

    23.090

    143.181

    9

    Avaluació de la qualitat de les dades de la mostra d'ARN

    Taula 1. Estadístiques de dades netes.

    Nom de l'arxiu

    ClientID

    ReadNúm

    BaseNúm

    N50

    Longitud mitjana

    Longitud màxima

    Puntuació Q mitjana

    RNA_BMK001

    C2

    8.947.708

    4.047.230.083

    398

    452

    129.227

    P12

    Figura 1. Distribució de la longitud de lectura

    A3

    Figura 2. Distribució de la puntuació de qualitat de les dades netes

    A4

    Figura 3. Distribució de la puntuació de la longitud i la qualitat de les dades netes

    A5

    obtenir un pressupost

    Escriu el teu missatge aquí i envia'ns-ho

    Envia'ns el teu missatge: