-
Seqüenciació d'immunoprecipitació de cromatina (ChIP-seq)
ChIP-Seq proporciona un perfil a tot el genoma de les dianes d'ADN per a la modificació d'histones, factors de transcripció i altres proteïnes associades a l'ADN.Combina la selectivitat de la immunoprecipitació de la cromatina (ChIP) per recuperar complexos proteïnes-ADN específics, amb el poder de la seqüenciació de nova generació (NGS) per a la seqüenciació d'alt rendiment de l'ADN recuperat.A més, com que els complexos proteïna-ADN es recuperen de cèl·lules vives, els llocs d'unió es poden comparar en diferents tipus de cèl·lules i teixits, o en diferents condicions.Les aplicacions van des de la regulació transcripcional fins a vies de desenvolupament fins a mecanismes de malaltia i més enllà.
Plataforma: Illumina NovaSeq 6000
-
Seqüenciació de bisulfits del genoma sencer
La metilació de l'ADN a la cinquena posició de la citosina (5-mC) té una influència fonamental en l'expressió gènica i l'activitat cel·lular.Els patrons anormals de metilació s'han associat amb diverses condicions i malalties, com ara el càncer.WGBS s'ha convertit en l'estàndard d'or per estudiar la metilació de tot el genoma amb una resolució de base única.
Plataforma: Illumina NovaSeq6000
-
Assaig de cromatina accessible a transposasa amb seqüenciació d'alt rendiment (ATAC-seq)
ATAC-seq és un mètode de seqüenciació d'alt rendiment per a l'anàlisi de l'accessibilitat de la cromatina a tot el genoma, que és important per al control epigenètic global de l'expressió gènica.Els adaptadors de seqüenciació s'insereixen a les regions obertes de cromatina mitjançant la transposasa Tn5 hiperactiva.Després de l'amplificació per PCR, es construeix una biblioteca de seqüenciació.Totes les regions de cromatina obertes es poden obtenir sota una condició d'espai-temps específica, no només limitada als llocs d'unió d'un factor de transcripció o a una determinada regió modificada amb histones.
-
Seqüenciació de bisulfits de representació reduïda (RRBS)
La investigació sobre la metilació de l'ADN sempre ha estat un tema candent en la investigació de malalties i està estretament relacionada amb l'expressió gènica i els trets fenotípics.RRBS és un mètode precís, eficient i econòmic per a la investigació de la metilació de l'ADN.L'enriquiment de les regions insulars del promotor i CpG mitjançant la divisió enzimàtica (Msp I), combinat amb la seqüenciació de bisulfits, proporciona una detecció de metilació de l'ADN d'alta resolució.
Plataforma: Illumina NovaSeq 6000
