BMKCloud Log in
条形banner-03

Productes

Seqüenciació de l'ARN procariota

La seqüenciació d'ARN procariota utilitza la seqüenciació de nova generació (NGS) per revelar la presència i la quantitat d'ARN en un moment determinat, mitjançant l'anàlisi del transcriptoma cel·lular canviant.La seqüenciació d'ARN procariota de la nostra empresa, té com a objectiu específicament procariotes amb genomes de referència, proporcionant-vos perfils de transcriptoma, anàlisi d'estructura gènica, etc. S'ha aplicat àmpliament a la investigació científica bàsica, la investigació i el desenvolupament de fàrmacs, i molt més.

Plataforma: Plataforma Illumina NovaSeq


Detalls del servei

Especificacions del servei

Plataforma: Plataforma Illumina NovaSeq, PE150

Tipus de biblioteca: biblioteca d'ADNc d'inserció de 350 bp (depèn de la distribució màxima)

Estratègia de seqüenciació: Paired-End 150 pb

Quantitat de dades recomanada: 2 Gb de dades en brut/mostra

Bioinformàtica

(1) Control de qualitat de les dades de seqüenciació: distribució de nucleòtids, distribució de qualitat de base, avaluació de la relació d'ARNr;

(2) Anàlisi d'alineació de seqüències: estadístiques de resultats d'alineació, saturació de la seqüenciació, cobertura de la seqüenciació;

(3) Anotació del genoma de referència (NR, Swiss-Prot, Pfam, COG, GO, KEGG);

(4) Anàlisi de l'expressió: Distribució de l'expressió (Amb dues o més mostres), Anàlisi de l'expressió entre mostres (anàlisi de Venn, anàlisi de correlació, anàlisi PCA);

(5) Anàlisi d'expressió diferencial (amb dues o més mostres);

(6) Anàlisi del conjunt de gens: anàlisi de Venn, anàlisi de clúster, anàlisi d'anotació de funcions (COG, GO, KEGG), anàlisi d'enriquiment de funcions (GO, KEGG), gràfic de cordes d'enriquiment de funcions, anàlisi Ipath;

(7) Anàlisi de sRNA: predicció de sRNA, anotació de sRNA (Blast, sRNAMap, sRNATarBase, SIPHT, Rfam), predicció d'estructura secundària de sRNA, predicció del gen objectiu de sRNA;

(8) Anàlisi de l'estructura de la transcripció: anàlisi d'operons, predicció de llocs d'inici i final de transcripció, anotació i anàlisi UTR, predicció de la seqüència del promotor, anàlisi SNP/InDel (anotació SNP/InDel, distribució regional SNP/InDel, estadístiques SNP).

Flux de treball del servei

lliurament de mostres

Lliurament de la mostra

Preparació de la biblioteca

Construcció de la biblioteca

Seqüenciació

Seqüenciació

Anàlisi de dades

Anàlisi de dades

Serveis postvenda

Serveis postvenda


  • Anterior:
  • Pròxim:

  • obtenir un pressupost

    Escriu el teu missatge aquí i envia'ns-ho

    Envia'ns el teu missatge: