Seqüenciació de bisulfits de representació reduïda (RRBS)
Especificacions del servei
Plataforma: plataforma NovaSeq, PE150
Tipus de biblioteca: biblioteca d'ADN tractada amb bisulfit d'inserció de 200-400 pb
Estratègia de seqüenciació: Paired-End 150 pb
Sortida de dades recomanada: 10 Gb de dades en brut/mostra
Exemples de requisits
Quantitat d'ADN: ≥ 2ug
Concentració d'ADN: ≥ 20 ng/μl.
Puresa: OD260/280 = 1,8 a 2,0 sense degradació ni contaminació per ARN
Anàlisi bioinformàtica
Flux de treball del servei
Lliurament de la mostra
Construcció de la biblioteca
Seqüenciació
Anàlisi de dades
Serveis postvenda
a.Estadístiques d'alineació del genoma de referència
Estadístiques de lectures de mapes
SEstadístiques de profunditat de seqüenciació i cobertura del lloc C
Acobertura acumulada
Deficiència de la digestió de cada mostra
b.Detecció de llocs de metilació
Llista dels nivells de metilació al lloc C
Bconversió S
Mcitosina etilada
Distribució del nivell de metilació
c.Mapa de metilació
Ga tot l'enoma
Gelement enoma
d.Comparació dels nivells de metilació entre mostres
PAirwise Correlació de la metilació de CG
PMetilació CA-CG
Cbrillantor de la metilació CG
d.Anàlisi de metilació diferencial
Sestadístiques de DMR
Distribució de longituds DMR
Hmapa de menjar
DDistribució de la RM a la regió objectiu
