Seqüenciació d'ARN petit-Il·lumina
Característiques
● Selecció de la mida de l'ARN abans de la preparació de la biblioteca
● Anàlisi bioinformàtica centrada en la predicció de miRNA i els seus objectius
Avantatges del servei
●Anàlisi bioinformàtica integral:permetre la identificació de miRNAs coneguts i nous, la identificació d'objectius de miRNAs i l'anotació funcional corresponent i l'enriquiment amb múltiples bases de dades (KEGG, GO)
●Control de qualitat rigorós: implementem punts de control bàsics en totes les etapes, des de la preparació de mostres i biblioteques fins a la seqüenciació i la bioinformàtica.Aquest control minuciós garanteix el lliurament de resultats d'alta qualitat constant.
●Suport postvenda: El nostre compromís s'estén més enllà de la finalització del projecte amb un període de servei postvenda de 3 mesos.Durant aquest temps, oferim seguiment del projecte, assistència per a la resolució de problemes i sessions de preguntes i respostes per resoldre qualsevol consulta relacionada amb els resultats.
●Àmplia experiència: amb un historial de tancament amb èxit de múltiples projectes d'ARNs que cobreixen més de 100 espècies en diversos dominis de recerca, el nostre equip aporta una gran experiència a cada projecte.
Requisits de mostra i lliurament
| Biblioteca | Plataforma | Dades recomanades | QC de dades |
| Talla seleccionada | Illumina SE50 | 10M-20M de lectures | Q30≥85% |
Requisits de mostra:
Nucleòtids:
| Conc. (ng/μl) | Quantitat (μg) | Puresa | Integritat |
| ≥ 80 | ≥ 0,5 | OD260/280=1,7-2,5 OD260/230=0,5-2,5 Es mostra al gel una contaminació limitada o nul·la de proteïnes o ADN. | RIN≥6,5; 5,0≥28S/18S≥1,0; elevació de referència limitada o nul·la |
● Plantes:
Arrel, tija o pètal: 450 mg
Fulla o llavor: 300 mg
Fruita: 1,2 g
● Animal:
Cor o intestí: 450 mg
Vísceres o cervell: 240 mg
Múscul: 600 mg
Ossos, cabell o pell: 1,5 g
● Artròpodes:
Insectes: 9g
Crustacis: 450 mg
● Sang sencera: 2 tubs
● Cèl·lules: 106 cèl · lules
● Sèrum i Plasma:6 ml
Lliurament de mostres recomanat
Contenidor:
Tub de centrífuga de 2 ml (no es recomana paper d'alumini)
Etiquetatge de la mostra: grup+rèplica, p. ex. A1, A2, A3;B1, B2, B3....
Enviament:
1.Gel sec: les mostres s'han d'envasar en bosses i enterrar-les en gel sec.
2. Tubs RNAstable: les mostres d'ARN es poden assecar en un tub d'estabilització d'ARN (per exemple, RNAstable®) i enviar-se a temperatura ambient.
Flux de treball del servei
Disseny d'experiments
Lliurament de la mostra
Extracció d'ARN
Construcció de la biblioteca
Seqüenciació
Anàlisi de dades
Serveis postvenda
Bioinformàtica
Identificació de miRNA: estructura i profunditat
Expressió diferencial de miRNA - agrupació jeràrquica
Anotació funcional de la diana de miRNAs expressats de manera diferencial
Exploreu els avenços de la investigació facilitats pels serveis de seqüenciació d'ARNs de BMKGene mitjançant una col·lecció de publicacions curada.
Chen, H. et al.(2023) "Les infeccions virals inhibeixen la biosíntesi i la fotosíntesi de saponines a Panax notoginseng", Plant Physiology and Biochemistry, 203, pàg.108038. doi: 10.1016/J.PLAPHY.2023.108038.
Li, H. et al.(2023) "La proteïna FREE1 que conté el domini FYVE de la planta s'associa amb components del microprocessador per reprimir la biogènesi de miRNA", informa EMBO, 24 (1).doi: 10.15252/EMBR.202255037/SUPPL_FILE/EMBR202255037-SUP-0004-SDATAFIG4.TIF.
Yu, J. et al.(2023) "El MicroRNA Ame-Bantam-3p controla el desenvolupament de la pupa larvària dirigint-se al gen 8 de múltiples dominis semblants a factors de creixement epidèrmic (megf8) a l'abella, Apis mellifera", International Journal of Molecular Sciences, 24 (6), p. .5726. doi: 10.3390/IJMS24065726/S1.
Zhang, M. et al.(2018) 'Anàlisi integrada de MiRNA i gens associats a la qualitat de la carn revela que Gga-MiR-140-5p afecta la deposició de greix intramuscular en pollastres', Cellular Physiology and Biochemistry, 46 (6), pàg. 2421–2433.doi: 10.1159/000489649.
