-
Seqüenciació d'ARNm de longitud completa-Nanopore
La seqüenciació de l'ARN ha estat una eina inestimable per a l'anàlisi completa del transcriptoma.Sens dubte, la seqüenciació tradicional de lectura curta va aconseguir nombrosos desenvolupaments importants aquí.No obstant això, sovint es troba amb limitacions en les identificacions d'isoformes de llarga durada, la quantificació i el biaix de la PCR.
La seqüenciació de nanopores es distingeix d'altres plataformes de seqüenciació, ja que els nucleòtids es llegeixen directament sense síntesi d'ADN i genera una lectura llarga a desenes de quilobases.Això permet la lectura directa creuant transcripcions completes i abordar els reptes dels estudis a nivell d'isoforma.
Plataforma：Nanopore PromethION
Biblioteca:cDNA-PCR
-
De novo Seqüenciació de transcriptoma de longitud completa -PacBio
De nouseqüenciació de transcriptoma de longitud completa, també coneguda com aDe nouIso-Seq aprofita els avantatges del seqüenciador PacBio en longitud de lectura, que permet la seqüenciació de molècules d'ADNc de longitud completa sense cap interrupció.Això evita completament qualsevol error generat en els passos de muntatge de la transcripció i construeix conjunts unigènes amb resolució a nivell d'isoforma.Aquest conjunt unigène proporciona informació genètica potent com a "genoma de referència" a nivell de transcriptoma.A més, combinant-se amb dades de seqüenciació de nova generació, aquest servei permet una quantificació precisa de l'expressió a nivell d'isoformes.
Plataforma: PacBio Sequel IIBiblioteca: biblioteca de campanes SMRT -
Seqüenciació d'ARNm eucariotes-Il·lumina
La seqüenciació d'ARNm permet el perfil de tots els ARNm transcrits de cèl·lules en condicions específiques.És una tecnologia potent per revelar el perfil d'expressió gènica, les estructures gèniques i els mecanismes moleculars de determinats processos biològics.Fins ara, la seqüenciació de l'ARNm s'ha utilitzat àmpliament en la investigació fonamental, el diagnòstic clínic, el desenvolupament de fàrmacs, etc.
Plataforma: Illumina NovaSeq 6000
-
Seqüenciació d'ARNm no basada en referència-Illumina
La seqüenciació de l'ARNm adopta la tècnica de seqüenciació de nova generació (NGS) per capturar l'ARN missatger (ARNm) dels eucariotes en un període específic en què s'estan activant algunes funcions especials.La transcripció més llarga empalmada es va anomenar "Unigene" i es va utilitzar com a seqüència de referència per a l'anàlisi posterior, que és un mitjà eficaç per estudiar el mecanisme molecular i la xarxa reguladora de l'espècie sense referència.
Després del muntatge de dades del transcriptoma i l'anotació funcional unigène
(1) Es realitzaran anàlisis SNP, anàlisi SSR, predicció de CDS i estructura gènica.
(2) Es realitzarà la quantificació de l'expressió unigènica a cada mostra.
(3) Es descobriran unigènes expressats de manera diferent entre mostres (o grups) a partir de l'expressió unigènica
(4) Es realitzarà l'agrupament, l'anotació funcional i l'anàlisi d'enriquiment d'unigènes expressats de manera diferencial
-
Seqüenciació llarga no codificant-Illumina
Els ARN llargs no codificants (lncRNAs) són un tipus de molècules d'ARN amb una longitud superior a 200 nt, que es caracteritzen per un potencial de codificació extremadament baix.El LncRNA, com a membre clau dels ARN no codificants, es troba principalment al nucli i al plasma.El desenvolupament de la tecnologia de seqüenciació i la bioinformàtica permet identificar nombrosos lncRNAs nous i associar-los amb funcions biològiques.Les evidències acumulades suggereixen que el lncRNA està àmpliament implicat en la regulació epigenètica, la regulació de la transcripció i la regulació posterior a la transcripció.
-
Seqüenciació d'ARN petit-Il·lumina
L'ARN petit es refereix a una classe de molècules d'ARN no codificants que solen tenir una longitud inferior a 200 nt, incloent micro ARN (miRNA), petit ARN d'interferència (siRNA) i ARN que interacciona amb piwi (piRNA).
El microARN (miRNA) és una classe d'ARN petit endògen amb una longitud d'uns 20-24nt, que té una varietat de papers reguladors importants a les cèl·lules.miRNA implicat en molts processos vitals que revelen l'expressió específica del teixit –específic i estadi– i altament conservat en diferents espècies.
-
Seqüenciació de circRNA-Il·lumina
La seqüenciació del transcriptoma sencer està dissenyada per perfilar tots els tipus de molècules d'ARN, inclosos els ARN codificants (ARNm) i no codificants (inclosos lncRNA, circRNA i miRNA) que són transcrits per cèl·lules específiques en un moment determinat.La seqüenciació del transcriptoma sencer, també coneguda com a "seqüenciació d'ARN total", té com a objectiu revelar xarxes reguladores completes a nivell de transcriptoma.Aprofitant la tecnologia NGS, hi ha disponibles seqüències de productes de transcriptoma sencers per a l'anàlisi de ceRNA i l'anàlisi d'ARN conjunt, que proporciona el primer pas cap a la caracterització funcional.Revelació de la xarxa reguladora de ceRNA basat en circRNA-miRNA-mRNA.
-
Seqüenciació del transcriptoma sencer - Illumina
La seqüenciació del transcriptoma sencer està dissenyada per perfilar tots els tipus de molècules d'ARN, inclosos els ARN codificants (ARNm) i no codificants (inclosos lncRNA, circRNA i miRNA) que són transcrits per cèl·lules específiques en un moment determinat.La seqüenciació del transcriptoma sencer, també coneguda com a "seqüenciació d'ARN total", té com a objectiu revelar xarxes reguladores completes a nivell de transcriptoma.Aprofitant la tecnologia NGS, hi ha disponibles seqüències de productes de transcriptoma sencers per a l'anàlisi de ceRNA i l'anàlisi d'ARN conjunt, que proporciona el primer pas cap a la caracterització funcional.Revelació de la xarxa reguladora de ceRNA basat en circRNA-miRNA-mRNA.
-
Seqüenciació de l'ARN procariota
La seqüenciació d'ARN procariota utilitza la seqüenciació de nova generació (NGS) per revelar la presència i la quantitat d'ARN en un moment determinat, mitjançant l'anàlisi del transcriptoma cel·lular canviant.La seqüenciació d'ARN procariota de la nostra empresa, té com a objectiu específicament procariotes amb genomes de referència, proporcionant-vos perfils de transcriptoma, anàlisi d'estructura gènica, etc. S'ha aplicat àmpliament a la investigació científica bàsica, la investigació i el desenvolupament de fàrmacs, entre d'altres.
Plataforma: Illumina NovaSeq 6000
-
Seqüenciació del metatranscriptoma
La seqüenciació del metatranscriptoma identifica l'expressió gènica de microbis (tant eucariotes com procariotes) dins d'entorns naturals (és a dir, sòl, aigua, mar, femta i intestí.). Concretament, aquest servei us permet obtenir perfils d'expressió gènica completa de comunitats microbianes complexes, anàlisi taxonòmica d'espècies, anàlisi d'enriquiment funcional de gens expressats de manera diferent i molt més.
Plataforma: Illumina NovaSeq 6000
