Pag-analisar sa Tibuok Genome nga Asosasyon
Daloy sa Trabaho
Mga Bentaha sa Serbisyo
●Halapad nga Ekspertis ug mga rekord sa publikasyonUban sa natipon nga kasinatian sa GWAS, ang BMKGene nakakompleto na og gatusan ka mga proyekto sa espisye sa panukiduki sa populasyon sa GWAS, nakatabang sa mga tigdukiduki sa pagmantala og kapin sa 100 ka mga artikulo, ug ang cumulative impact factor miabot sa 500.
● Komprehensibo nga pag-analisar sa bioinformaticsAng workflow naglakip sa SNP-trait association analysis, nga naghatud sa usa ka hugpong sa mga kandidato nga gene ug sa ilang katugbang nga functional annotation.
●Hanas kaayo nga bioinformatics team ug mubo nga analysis cycleUban sa dakong kasinatian sa abanteng genomics analysis, ang team sa BMKGene naghatag ug komprehensibo nga mga pag-analisar nga dali ra mahuman.
●Suporta Pagkahuman sa Pagbaligya:Ang among pasalig molapas pa sa pagkompleto sa proyekto nga adunay 3 ka bulan nga after-sale service period. Niining panahona, nagtanyag kami og project follow-up, troubleshooting assistance, ug Q&A sessions aron matubag ang bisan unsang mga pangutana nga may kalabotan sa mga resulta.
Mga detalye ug kinahanglanon sa serbisyo
| Matang sa pagkasunod-sunod | Girekomendar nga sukod sa populasyon | Estratehiya sa pagkasunod-sunod | Mga kinahanglanon sa nukleotida |
| Pagsunod-sunod sa Tibuok Genome | 200 ka mga sample | 10x | Konsentrasyon: ≥ 1 ng/ µL Kinatibuk-ang kantidad ≥ 30ng Limitado o walay pagkadaot o kontaminasyon |
| Gipadako nga Tipik sa Espisipiko nga Lokus (SLAF) | Giladmon sa tag: 10x Gidaghanon sa mga tag: < 400 Mb: Girekomenda ang WGS < 1Gb: 100K nga mga tag 1Gb > 2Gb: 300K nga mga tag Maximum nga 500k nga mga tag | Konsentrasyon ≥ 5 ng/µL Kinatibuk-ang kantidad ≥ 80 ng Nanodrop OD260/280=1.6-2.5 Agarose gel: walay o limitado nga pagkadaot o kontaminasyon
|
Pagpili sa Materyal
Nagkalainlaing mga barayti, subspecies, landraces/genebanks/sinagol nga pamilya/ihalas nga mga kahinguhaan
Nagkalainlaing mga barayti, subspecies, landraces
Pamilya sa katunga-magsoon/pamilya sa tibuok-magsoon/mga ihalas nga kahinguhaan
Dagayday sa Trabaho sa Serbisyo
Disenyo sa eksperimento
Paghatud sa sampol
Pagkuha sa RNA
Pagtukod og librarya
Pagkasunod-sunod
Pag-analisar sa datos
Mga serbisyo human sa pagbaligya
Naglakip sa mosunod nga pag-analisar:
- Pag-analisar sa asosasyon sa tibuok genome: LM, LMM, EMMAX, FASTLMM nga modelo
- Functional annotation sa mga kandidato nga gene
Pag-analisar sa asosasyon sa kinaiya sa SNP – Manhattan plot
Pag-analisar sa asosasyon sa kinaiya sa SNP – QQ plot
Susiha ang mga pag-uswag nga gipadali sa mga serbisyo sa de GWAS sa BMKGene pinaagi sa usa ka pinili nga koleksyon sa mga publikasyon:
Lv, L. et al. (2023) 'Pagsabot sa henetikong basehan sa pag-agwanta sa ammonia sa razor clam Sinonovacula constricta pinaagi sa genome-wide association study',Akuakultura, 569, p. 739351. doi: 10.1016/J.AQUACULTURE.2023.739351.
Li, X. et al. (2022) 'Ang mga pag-analisa sa multi-omics sa 398 ka foxtail millet accessions nagpadayag sa mga rehiyon sa genomic nga nalangkit sa domestication, mga kinaiya sa metabolite, ug mga epekto nga kontra-panghubag',Tanom nga Molekular, 15(8), pp. 1367–1383. doi: 10.1016/j.molp.2022.07.003.
Li, J. et al. (2022) 'Pagmapa sa Tibuok Genome nga Asosasyon sa mga Hulless Barely Phenotype sa Kalikopan sa Hula',Mga Utlanan sa Siyensiya sa Tanom, 13, p. 924892. doi: 10.3389/FPLS.2022.924892/BIBTEX.
Zhao, X. et al. (2021) 'Ang GmST1, nga nag-encode sa usa ka sulfotransferase, naghatag og resistensya sa mga strain sa soybean mosaic virus nga G2 ug G3',Tanom, Selyula ug Kalikopan, 44(8), pp. 2777–2792. doi: 10.1111/PCE.14066.
