-
Tanum/Animal De novo Genome Sequencing
De novoAng sequencing nagtumong sa pagtukod sa tibuok genome sa usa ka espisye gamit ang mga teknolohiya sa sequencing, eg PacBio, Nanopore, NGS, ug uban pa, kung walay reference genome.Ang talagsaong pag-uswag sa gidugayon sa pagbasa sa mga teknolohiya sa pagsunud-sunod sa ikatulo nga henerasyon nagdala og bag-ong mga oportunidad sa pag-assemble sa mga komplikadong genome, sama niadtong adunay taas nga heterozygosity, taas nga ratio sa nagbalik-balik nga mga rehiyon, polyploid, ug uban pa. pagsulbad sa nagbalikbalik nga mga elemento, mga rehiyon nga adunay dili normal nga mga sulud sa GC ug uban pang labi ka komplikado nga mga rehiyon.
Platform: PacBio Sequel II / Nanopore PromethION P48 / Illumina NovaSeq6000
-
Hi-C base sa Genome Assembly
Ang Hi-C usa ka pamaagi nga gidisenyo aron makuha ang chromosome configuration pinaagi sa paghiusa sa probing proximity-based nga interaksyon ug high-throughput sequencing.Ang intensity niini nga mga interaksyon gituohan nga negatibo nga may kalabutan sa pisikal nga gilay-on sa mga chromosome.Busa, ang datos sa Hi-C mahimong makagiya sa pag-cluster, pag-order ug pag-orient sa mga assembled sequence sa usa ka draft genome ug pag-angkla niadtong sa pipila ka gidaghanon sa mga chromosome.Kini nga teknolohiya naghatag gahum sa usa ka chromosome-level genome assembly kung wala ang genetic nga mapa nga nakabase sa populasyon.Ang matag genome nanginahanglan usa ka Hi-C.
Plataporma: Illumina NovaSeq6000 / DNBSEQ
-
Ebolusyonaryong Genetika
Ang ebolusyonaryong genetics kay usa ka packed sequencing service nga gidisenyo alang sa paghatag ug komprehensibong interpretasyon sa ebolusyonaryong impormasyon sa gihatag nga mga materyales base sa genetic variation, lakip na ang mga SNP, InDels, SVs ug CNVs.Naghatag kini sa tanan nga sukaranan nga pagtuki nga gikinahanglan alang sa paghulagway sa mga pagbag-o sa ebolusyon ug mga genetic nga bahin sa mga populasyon, sama sa istruktura sa populasyon, pagkalainlain sa genetic, relasyon sa phylogeny, ug uban pa. Naglangkob usab kini mga pagtuon sa dagan sa gene, nga naghatag gahum sa pagbanabana sa epektibo nga gidak-on sa populasyon, oras sa pagkalainlain.
-
Comparative Genomics
Ang pagtandi nga genomics literal nga nagpasabut sa pagtandi sa kompleto nga mga han-ay sa genome ug istruktura sa lainlaing mga espisye.Ang kini nga disiplina nagtumong sa pagpadayag sa ebolusyon sa mga espisye, function sa gene, mekanismo sa regulasyon sa gene sa lebel sa genome pinaagi sa pag-ila sa pagkasunod-sunod nga mga istruktura ug mga elemento nga nagtipig o naglainlain sa lainlaing mga espisye.Ang kasagarang pagtandi sa genomics nga pagtuon naglakip sa mga pagtuki sa gene family, evolutionary development, whole genome duplication, selective pressure, etc.
-
Pag-analisar sa Bulked Segregant
Ang bulked segregant analysis (BSA) usa ka teknik nga gigamit aron dali nga mailhan ang mga phenotype nga may kalabotan nga genetic marker.Ang nag-unang dagan sa trabaho sa BSA naglangkob sa pagpili sa duha ka grupo sa mga indibidwal nga adunay hilabihan nga kaatbang nga mga phenotype, nga naghiusa sa DNA sa tanan nga mga indibidwal aron mahimong duha ka bulto sa DNA, nga nagpaila sa mga pagkasunod-sunod sa kalainan tali sa duha ka pool.Kini nga teknik kaylap nga gigamit sa pag-ila sa mga genetic marker nga kusganong nakig-uban sa gipunting nga mga gene sa mga genome sa tanum/hayop.
