BMKCloud Log in

Mga produkto

Metatranscriptome Sequencing

Gigamit ang teknolohiya sa pagsunud-sunod sa Illumina, ang serbisyo sa metatranscriptome sequencing sa BMKGENE nagpadayag sa dinamikong ekspresyon sa gene sa lainlain nga han-ay sa mga mikrobyo, nga naglangkob sa mga eukaryote hangtod sa mga prokaryote ug mga virus, sulod sa natural nga palibot sama sa yuta, tubig, dagat, stool, ug gut. Ang among komprehensibo nga serbisyo naghatag gahum sa mga tigdukiduki sa pagsusi sa kompleto nga mga profile sa ekspresyon sa gene sa komplikado nga mga komunidad sa microbial. Labaw pa sa pag-analisa sa taxonomic, ang among metatranscriptome sequencing nga serbisyo nagpadali sa pagsuhid sa pagpaayo sa pagpaandar, paghatag kahayag sa mga lahi nga gipahayag nga mga gene ug ang ilang mga tahas. Pagdiskubre sa daghang biolohikal nga mga panabut samtang nag-navigate ka sa komplikado nga mga talan-awon sa ekspresyon sa gene, pagkalainlain sa taxonomic, ug dinamikong pag-andar sa sulod niining lainlaing mga niche sa kalikopan.

Kontaka Kami

Mga Detalye sa Serbisyo

Bioinformatics

Mga Resulta sa Demo

Gipili nga mga publikasyon

Mga Feature sa Serbisyo

● rRNA depletion gisundan sa direksyon mRNA librarya pag-andam.

● Pagsunodsunod sa Illumina NovaSeq.

Mga Bentaha sa Serbisyo

●Tun-i ang mga Pagbag-o sa Komplikadong Microbial nga Komunidad:Nahitabo kini sa lebel sa transkripsyon ug pagsuhid sa potensyal nga bag-ong mga gene.

●Pagpatin-aw sa Microbial Community Interactions uban sa Host o Environment.

●Komprehensibo nga Bioinformatic Analysis: Naghatag kini og mga panabut sa taxonomic ug functional nga mga komposisyon sa komunidad, ingon man usab sa pag-analisa sa ekspresyon sa gene nga differential.

●Daghang Gene Annotation:Paggamit sa pinakabag-o nga mga database sa function sa gene alang sa impormasyon nga impormasyon sa ekspresyon sa gene sa microbial nga mga komunidad.

●Suporta sa Post-Sales:Ang among pasalig labaw pa sa pagkompleto sa proyekto nga adunay 3 ka bulan nga pagkahuman sa pagbaligya nga panahon sa serbisyo. Niining panahona, nagtanyag kami nga pag-follow-up sa proyekto, tabang sa pag-troubleshoot, ug mga sesyon sa Q&A aron matubag ang bisan unsang mga pangutana nga may kalabotan sa mga resulta.

Mga Detalye sa Serbisyo

Pagsunod-sunod nga plataporma	Estratehiya sa Pagsunodsunod	Girekomenda ang datos	Pagkontrol sa Kalidad sa Data
Illumina NovaSeq	PE150	12Gb	Q30≥85%

Sample nga Kinahanglanon

Konsentrasyon (ng/µL)	Kinatibuk-ang kantidad (µg)	Volume (µL)	OD260/280	OD260/230	RIN
≥50	≥1.0	≥20	1.8-2.0	1.0-2.5	≥6.5

Daloy sa Trabaho sa Serbisyo

Sample nga paghatod

Pagtukod sa librarya

Pagsunodsunod

Pagtuki sa datos

After-sale nga serbisyo

Kaniadto: De novo Fungal Genome Assembly

Sunod: Prokaryotic RNA Sequencing

Naglakip sa mosunod nga pagtuki:

● Pagsunod-sunod sa Data Quality Control

● Transcript Assembly

● Taxonomic Annotation ug Abundance

● Functional Annotation ug Abundance

● Pagkunhod sa Ekspresyon ug Pagtuki sa Differential

Taxonomic distribution sa matag sample:

Beta diversity analysis: UPGMA

Functional nga anotasyon - GO abundance

Nagkalainlain nga kadagaya sa taxonomy - LEFSE

Susihon ang mga pag-uswag nga gipadali sa mga serbisyo sa pagsunud-sunod sa meta transcriptomics sa BMKGene pinaagi sa usa ka curated nga koleksyon sa mga publikasyon.

Lu, Z. ug uban pa. (2023) 'Acid tolerance sa lactate-utilizing bacteria sa order nga Bacteroidales nakatampo sa pagpugong sa ruminal acidosis sa mga kanding nga gipahaum sa usa ka high-concentrate nga pagkaon',Nutrisyon sa Hayop, 14, pp. 130–140. doi: 10.1016/J.ANINU.2023.05.006.

Kanta, Z. et al. (2017) 'Pag-unraveling sa core functional microbiota sa tradisyonal nga solid-state fermentation pinaagi sa high-throughput amplicons ug metatranscriptomics sequencing',Mga utlanan sa Microbiology, 8(HUL). doi: 10.3389/FMICB.2017.01294/FULL.

Wang, W. et al. (2022) 'Novel Mycoviruses Nadiskobrehan gikan sa usa ka Metatranscriptomics Survey sa Phytopathogenic Alternaria Fungus',Mga virus, 14(11), p. 2552. doi: 10.3390/V14112552/S1.

Wei, J. ug uban pa. (2022) 'Ang parallel metatranscriptome analysis nagpadayag sa pagkadaut sa mga sekondaryang metabolite sa tanum pinaagi sa mga bakukang ug sa ilang mga gut symbionts',Molekular Ekolohiya, 31(15), pp. 3999–4016. doi: 10.1111/MEC.16557.