-
Chromatin Immunoprecipitation Sequencing (ChIP-seq)
Naghatag ang ChIP-Seq og genome-wide profiling sa mga target sa DNA alang sa pagbag-o sa histone, mga hinungdan sa transkripsyon, ug uban pang mga protina nga may kalabotan sa DNA.Gihiusa niini ang pagkapili sa chromatin immuno-precipitation (ChIP) aron mabawi ang piho nga mga protina-DNA complex, nga adunay gahum sa sunod nga henerasyon nga pagkasunud (NGS) alang sa taas nga throughput nga pagkasunud sa nabawi nga DNA.Dugang pa, tungod kay ang mga complex sa protina-DNA nakuha gikan sa buhi nga mga selula, ang mga lugar nga nagbugkos mahimong itandi sa lainlaing mga tipo sa selula ug mga tisyu, o sa ilawom sa lainlaing mga kondisyon.Ang mga aplikasyon gikan sa regulasyon sa transkripsyon hangtod sa mga agianan sa pag-uswag hangtod sa mga mekanismo sa sakit ug sa unahan.
Plataporma: Illumina NovaSeq Platform
-
Tibuok genome bisulfite sequencing
Ang DNA methylation sa ikalima nga posisyon sa cytosine (5-mC) adunay sukaranan nga impluwensya sa ekspresyon sa gene ug kalihokan sa cellular.Ang dili normal nga mga pattern sa methylation nalambigit sa daghang mga kondisyon ug sakit, sama sa kanser.Ang WGBS nahimong standard nga bulawan alang sa pagtuon sa genome-wide methylation sa usa ka base nga resolusyon.
Plataporma: Illumina NovaSeq Platform
-
Pagsusi alang sa Transposase-Accessible Chromatin nga adunay High Throughput Sequencing (ATAC-seq)
Ang ATAC-seq usa ka high-throughput sequencing nga pamaagi alang sa pagtuki sa genome-wide chromatin accessibility, nga importante alang sa global epigenetic control sa gene expression.Ang mga sequencing adapters gisal-ot sa bukas nga mga rehiyon sa chromatin pinaagi sa hyperactive Tn5 transposase.Pagkahuman sa PCR amplification, usa ka sequencing library ang gitukod.Ang tanan nga bukas nga mga rehiyon sa chromatin mahimong makuha ubos sa usa ka piho nga kondisyon sa panahon, dili lamang limitado sa mga lugar nga nagbugkos sa usa ka transcription factor, o usa ka piho nga rehiyon nga gibag-o sa histone.
-
Gipamub-an ang Representasyon sa Bisulfite Sequencing (RRBS)
Ang panukiduki sa DNA methylation kanunay nga usa ka mainit nga hilisgutan sa panukiduki sa sakit, ug suod nga kalambigitan sa ekspresyon sa gene ug pheno-typic nga mga kinaiya.Ang RRBS usa ka tukma, episyente ug ekonomikanhon nga pamaagi alang sa panukiduki sa DNA methylation.Pagpalambo sa promoter ug CpG nga mga rehiyon sa isla pinaagi sa enzymatic cleavage (Msp I), inubanan sa Bisulfite sequencing, naghatag og taas nga resolusyon sa DNA methylation detection.
Plataporma: Illumina NovaSeq Platform
