Mga produkto

Tibuok nga transcriptome sequencing - Illumina

Ang tibuuk nga pagsunud sa transcriptome nagtanyag usa ka komprehensibo nga pamaagi sa pag-profile sa lainlaing mga molekula sa RNA, nga naglangkob sa parehong coding (mRNA) ug non-coding RNAs (lncRNA, circRNA, ug miRNA).Gikuha sa kini nga teknik ang tibuuk nga transcriptome sa piho nga mga selula sa usa ka gihatag nga higayon, nga nagtugot alang sa usa ka holistic nga pagsabut sa mga proseso sa cellular.Nailhan usab nga "total RNA sequencing," kini nagtumong sa pag-unveil sa makuti nga mga regulatory network sa transcriptome level, nga makapahimo sa lawom nga pag-analisar sama sa kompetisyon nga endogenous RNA (ceRNA) ug joint RNA analysis.Kini nagtimaan sa inisyal nga lakang padulong sa functional characterization, labi na sa pag-unrave sa mga regulatory network nga naglambigit sa circRNA-miRNA-mRNA-based ceRNA interactions.

Kontaka Kami

Mga Detalye sa Serbisyo

Bioinformatics

Mga Resulta sa Demo

Gipili nga mga Publikasyon

Mga bahin

● Doble nga librarya aron masunod-sunod ang kompleto nga transcriptome: rRNA depletion gisundan sa PE150 nga pag-andam sa librarya ug pagpili sa gidak-on nga gisundan sa SE50 nga pag-andam sa librarya

● Kompleto nga pagtuki sa bioinformatics sa mRNA, lncRNA, circRNA ug miRNA sa lain nga mga taho sa bioinformatics

● Ang hiniusang pagtuki sa tanang ekspresyon sa RNA sa hiniusang taho, lakip ang pagtuki sa mga network sa ceRNA.

Mga Bentaha sa Serbisyo

●Ang lawom nga pagtuki sa mga regulatory network: Ang pag-analisa sa ceRNA network gipalihok pinaagi sa hiniusang pagkasunodsunod sa mRNA, lncRNA, circRNA ug miRNA ug pinaagi sa usa ka kompleto nga bioinformatic workflow.

●Komprehensibo nga Anotasyon: naggamit kami og daghang mga database aron magamit nga i-annotate ang Differentially Expressed Genes (DEGs) ug ipahigayon ang katugbang nga pagtuki sa pagpauswag, paghatag og mga panabut sa mga proseso sa cellular ug molekula nga nagpahipi sa tubag sa transcriptome.

●Lapad nga Eksperto: nga adunay track record sa malampusong pagsira sa kapin sa 2000 ka buok transcriptome nga mga proyekto sa nagkalain-laing research domain, ang among team nagdala ug daghang kasinatian sa matag proyekto.

●Hugot nga Pagkontrol sa Kalidad: gipatuman namo ang mga core control point sa tanang yugto, gikan sa sample ug pag-andam sa library ngadto sa sequencing ug bioinformatics.Kini nga makuti nga pag-monitor nagsiguro sa paghatud sa kanunay nga taas nga kalidad nga mga sangputanan.

● Komprehensibo nga Anotasyon: naggamit kami og daghang mga database aron magamit nga i-annotate ang Differentially Expressed Genes (DEGs) ug ipahigayon ang katugbang nga pagtuki sa pagpauswag, paghatag og mga panabut sa mga proseso sa cellular ug molekula nga nagpahipi sa tubag sa transcriptome.

●Suporta sa Post-Sales: Ang among pasalig molapas pa sa pagkompleto sa proyekto nga adunay 3 ka bulan nga human sa pagbaligya nga panahon sa serbisyo.Niini nga panahon, nagtanyag kami nga pag-follow-up sa proyekto, tabang sa pag-troubleshoot, ug mga sesyon sa Q&A aron matubag ang bisan unsang mga pangutana nga may kalabotan sa mga resulta.

Sample nga Kinahanglanon ug Paghatud

Library	Estratehiya sa pagkasunodsunod	Girekomenda ang datos	Pagkontrol sa Kalidad
nahurot ang rRNA	Illumina PE150	16 Gb	Q30≥85%
Gipili ang gidak-on	Illumina SE50	10-20M nga pagbasa	Q30≥85%

Sample nga Kinahanglanon:

Nucleotides:

Conc.(ng/μl)

Gidaghanon (μg)

Kaputli

Integridad

≥ 100

≥ 1

OD260/280=1.7-2.5

OD260/230=0.5-2.5

Limitado o walay kontaminasyon sa protina o DNA nga gipakita sa gel.

Mga tanom: RIN≥6.5

Hayop: RIN≥7.0

5.0≥28S/18S≥1.0;

limitado o walay baseline elevation

Girekomenda nga Sample Delivery

sudlanan:
2 ml centrifuge tube (Tin foil dili girekomendar)
Sample nga pag-label: Grupo+kopya eg A1, A2, A3;B1, B2, B3...

pagpadala:
1.Dry-ice: Ang mga sample kinahanglan nga ibutang sa mga bag ug ilubong sa dry-ice.
2.RNAstable tubes: RNA samples mahimong mamala sa RNA stabilization tube(eg RNAstable®) ug ipadala sa lawak temperatura.

Daloy sa Trabaho sa Serbisyo

Eksperimento nga disenyo

Sample nga paghatod

Pagkuha sa RNA

Pagtukod sa librarya

Pagsunodsunod

Pagtuki sa datos

After-sale nga serbisyo

Kaniadto: Chromatin Immunoprecipitation Sequencing (ChIP-seq)

Sunod: circRNA sequencing-Illumina

Bioinformatics

Overview sa ekspresyon sa RNA

Differentially Expressed nga mga gene

pagtuki sa ceRNA

Nagkalainlain nga gipahayag nga mga miRNA ug may kalabutan nga mga RNA

Susihon ang mga pag-uswag sa panukiduki nga gipadali sa tibuok transcriptome sequencing nga mga serbisyo sa BMKGene pinaagi sa usa ka curated nga koleksyon sa mga publikasyon.

Dai, Y. ug uban pa.(2022) 'Komprehensibo nga mga profile sa ekspresyon sa mRNAs, lncRNAs ug miRNAs sa sakit nga Kashin-Beck nga giila sa RNA-sequencing', Molecular Omics, 18(2), pp. 154-166.doi: 10.1039/D1MO00370D.

Liu, N. nan ug uban pa.(2022) 'Full length transcriptomes analysis of cold-resistance of Apis cerana in Changbai Mountain during overwintering period.', Gene, 830, pp. 146503–146503.doi: 10.1016/J.GENE.2022.146503.

Wang, XJ ug uban pa.(2022) 'Multi-Omics Integration-Based Prioritization sa Cometing Endogenous RNA Regulation Networks sa Small Cell Lung Cancer: Molecular Characteristics ug Drug Candidates', Frontiers sa Oncology, 12, p.904865. doi: 10.3389/FONC.2022.904865/BIBTEX.

Xu, P. ug uban pa.(2022) 'Ang hiniusa nga pagtuki sa lncRNA / circRNA-miRNA-mRNA nga mga profile sa ekspresyon nagpadayag sa mga nobela nga panan-aw sa mga potensyal nga mekanismo agig tubag sa root-knot nematodes sa mani', BMC Genomics, 23(1), pp. 1–12.doi: 10.1186/S12864-022-08470-3/FIGURES/7.

Yan, Z. ug uban pa.(2022) 'Ang whole-transcriptome RNA sequencing nagpasiugda sa mga mekanismo sa molekula nga nalangkit sa pagmentinar sa kalidad sa postharvest sa broccoli pinaagi sa red LED irradiation', Postharvest Biology and Technology, 188, p.111878. doi: 10.1016/J.POSTHARVBIO.2022.111878.