条形banner-03

Mga produkto

Tibuok Transcriptome Sequencing - Illumina

Ang tibuuk nga pagsunud sa transcriptome nagtanyag usa ka komprehensibo nga pamaagi sa pag-profile sa lainlaing mga molekula sa RNA, nga naglangkob sa coding (mRNA) ug non-coding RNAs (lncRNA, circRNA, ug miRNA). Gikuha sa kini nga teknik ang tibuuk nga transcriptome sa piho nga mga cell sa usa ka gihatag nga higayon, nga nagtugot alang sa usa ka holistic nga pagsabut sa mga proseso sa cellular. Nailhan usab nga "total RNA sequencing," kini nagtumong sa pag-unveil sa makuti nga mga regulatory network sa transcriptome level, nga makapahimo sa lawom nga pag-analisar sama sa kompetisyon nga endogenous RNA (ceRNA) ug joint RNA analysis. Kini nagtimaan sa inisyal nga lakang padulong sa functional characterization, labi na sa pag-unrave sa mga regulatory network nga naglambigit sa circRNA-miRNA-mRNA-based nga mga interaksyon sa ceRNA.


Mga Detalye sa Serbisyo

Bioinformatics

Mga Resulta sa Demo

Gipili nga mga Publikasyon

Mga bahin

● Doble nga librarya aron masunod-sunod ang kompleto nga transcriptome: rRNA depletion gisundan sa PE150 nga pag-andam sa librarya ug pagpili sa gidak-on nga gisundan sa SE50 nga pag-andam sa librarya

● Kompleto nga pagtuki sa bioinformatics sa mRNA, lncRNA, circRNA, ug miRNA sa separadong mga taho sa bioinformatics

● Ang hiniusang pagtuki sa tanang ekspresyon sa RNA sa usa ka hiniusa nga taho, lakip ang pagtuki sa mga network sa ceRNA.

Mga Bentaha sa Serbisyo

Sa lawom nga Pagtuki sa Regulatory Networks: Ang pag-analisa sa ceRNA network gipalihok pinaagi sa hiniusang pagkasunodsunod sa mRNA, lncRNA, circRNA, ug miRNA ug pinaagi sa usa ka kompleto nga bioinformatic workflow.

Komprehensibo nga Anotasyon: Gigamit namo ang daghang mga database aron ma-annotate ang mga Differentially Expressed Genes (DEGs) ug ipahigayon ang katugbang nga pag-analisa sa pagpalambo, paghatag og mga pagsabot sa mga proseso sa cellular ug molekular nga nagpahipi sa transcriptome nga tubag.

Lapad nga Eksperto: Uban sa usa ka track record sa malampuson nga pagsira sa kapin sa 2100 ka tibuok transcriptome nga mga proyekto sa lain-laing research domain, ang among team nagdala og daghang kasinatian sa matag proyekto.

Hugot nga Pagkontrol sa Kalidad: Gipatuman namo ang kinauyokan nga mga punto sa pagkontrol sa tanang yugto, gikan sa pag-andam sa sample ug library ngadto sa pagkasunodsunod ug bioinformatics. Kini nga makuti nga pag-monitor nagsiguro sa paghatud sa kanunay nga taas nga kalidad nga mga sangputanan.

Suporta sa Post-Sales: Ang among pasalig molapas pa sa pagkompleto sa proyekto nga adunay 3 ka bulan nga human sa pagbaligya nga panahon sa serbisyo. Niini nga panahon, nagtanyag kami nga pag-follow-up sa proyekto, tabang sa pag-troubleshoot, ug mga sesyon sa Q&A aron matubag ang bisan unsang mga pangutana nga may kalabotan sa mga resulta.

Sample nga Kinahanglanon ug Paghatud

Library

Estratehiya sa pagkasunodsunod

Girekomenda ang datos

Pagkontrol sa Kalidad

nahurot ang rRNA

Illumina PE150

16 Gb

Q30≥85%

Gipili ang gidak-on

Illumina SE50

10-20M nga pagbasa

Sample nga Kinahanglanon:

Nucleotides:

Conc.(ng/μl)

Gidaghanon (μg)

Kaputli

Integridad

≥ 80

≥ 1.6

OD260/280=1.7-2.5

OD260/230=0.5-2.5

Limitado o walay kontaminasyon sa protina o DNA nga gipakita sa gel.

RIN≥6.0

5.0≥28S/18S≥1.0;

limitado o walay baseline elevation

Girekomenda nga Sample Delivery

Kontainer: 2 ml centrifuge tube (Tin foil dili girekomendar)

Sample nga pag-label: Grupo+kopya eg A1, A2, A3; B1, B2, B3.

pagpadala:

1. Dry-ice: Ang mga sample kinahanglang ibutang sa mga bag ug ilubong sa dry-ice.

2. RNAstable nga mga tubo: Ang mga sample sa RNA mahimong mamala sa RNA stabilization tube (eg RNAstable®) ug ipadala sa temperatura sa lawak.

Daloy sa Trabaho sa Serbisyo

Sample nga QC

Eksperimento nga disenyo

sample delivery

Sample nga paghatod

Eksperimento sa piloto

Pagkuha sa RNA

Pagpangandam sa Library

Pagtukod sa librarya

Pagsunodsunod

Pagsunodsunod

Pagtuki sa datos

Pagtuki sa datos

Human sa pagbaligya Serbisyo

After-sale nga serbisyo


  • Kaniadto:
  • Sunod:

  • Bioinformatics

    wps_doc_16

    Overview sa ekspresyon sa RNA

     

     图片41

    Differentially Expressed nga mga gene

     

    图片42

     

     

    pagtuki sa ceRNA

    图片43          Nagkalainlain nga gipahayag nga mga miRNA ug may kalabutan nga mga RNA

    图片44 

     Susihon ang mga pag-uswag sa panukiduki nga gipadali sa tibuok transcriptome sequencing nga mga serbisyo sa BMKGene pinaagi sa usa ka curated nga koleksyon sa mga publikasyon.

     

    Dai, Y. ug uban pa. (2022) 'Komprehensibo nga mga profile sa ekspresyon sa mRNAs, lncRNAs ug miRNAs sa sakit nga Kashin-Beck nga giila sa RNA-sequencing', Molecular Omics, 18(2), pp. 154-166. doi: 10.1039/D1MO00370D.

    Liu, N. nan ug uban pa. (2022) 'Full length transcriptomes analysis of cold-resistance of Apis cerana in Changbai Mountain during overwintering period.', Gene, 830, pp. 146503–146503. doi: 10.1016/J.GENE.2022.146503.

    Wang, XJ ug uban pa. (2022) 'Multi-Omics Integration-Based Prioritization sa Cometing Endogenous RNA Regulation Networks sa Small Cell Lung Cancer: Molecular Characteristics ug Drug Candidates', Frontiers sa Oncology, 12, p. 904865. doi: 10.3389/FONC.2022.904865/BIBTEX.

    Xu, P. ug uban pa. (2022) 'Integrated analysis sa lncRNA/circRNA-miRNA-mRNA expression profiles nagpadayag sa mga nobela nga panabut sa potensyal nga mga mekanismo isip tubag sa root-knot nematodes sa mani', BMC Genomics, 23(1), pp. 1–12. doi: 10.1186/S12864-022-08470-3/FIGURES/7.

    Yan, Z. ug uban pa. (2022) 'Ang whole-transcriptome RNA sequencing nagpasiugda sa mga mekanismo sa molekula nga nalangkit sa pagmentinar sa kalidad sa postharvest sa broccoli pinaagi sa red LED irradiation', Postharvest Biology and Technology, 188, p. 111878. doi: 10.1016/J.POSTHARVBIO.2022.111878.

    pagkuha og usa ka kinutlo

    Isulat ang imong mensahe dinhi ug ipadala kini kanamo

    Ipadala ang imong mensahe kanamo: