Sequenziamentu di Ampliconi 16S/18S/ITS-PacBio
Funzioni di serviziu
● Piattaforma di sequenziamentu: PacBio Revio
● Modu di sequenziamentu: CCS (letture HiFi)
● Amplificazione di a regione di destinazione seguita da un ligame in tandem di ampliconi prima di a preparazione di a biblioteca di campane HiFi SMRT
Vantaghji di u serviziu
●Risoluzione tassonomica più alta: Tsequenziamentu di ampliconi corti di Han,permettendu tassi di classificazione OTU più alti à u livellu di spezie.
●Chjama di basa assai precisaSequenziamentu in modu CCS PacBio (letture HiFi).
●Senza isolamentuIdentificazione rapida di a cumpusizione microbica in campioni ambientali.
●Ampiamente applicabileStudi di cumunità microbiche diverse.
●Analisi bioinformatica cumpletaL'ultimu pacchettu QIIME2 (intuizione quantitativa di l'ecologia microbiana) cù diverse analisi in termini di basa di dati, annotazione, OTU/ASV.
●Una vasta cumpetenzaCù millaie di prughjetti di sequenziamentu di ampliconi realizati ogni annu, BMKGENE porta più di una decina d'anni di sperienza, una squadra d'analisi altamente qualificata, un cuntenutu cumpletu è un eccellente supportu post-vendita.
Specifiche di serviziu
| Biblioteca | Strategia di Sequenziamentu | Dati cunsigliati |
| Amplicone | PacBio Revio | 10/30/50 K etichette (CCS) |
Requisiti di Campione
| Cuncentrazione (ng/µL) | Quantità tutale (µg) | Volume (µL) |
| ≥5 | ≥0,3 | ≥20 |
Cunsegna di Campioni Raccomandata
Congelate i campioni in azotu liquidu per 3-4 ore è cunservateli in azotu liquidu o -80 gradi per una riservazione à longu andà. Hè necessariu u trasportu di i campioni cù ghiaccio seccu.
Flussu di travagliu di serviziu
Cunsegna di campioni
Custruzzione di a biblioteca
Sequenziamentu
Analisi di dati
Servizii dopu a vendita
Include l'analisi seguente:
● Cuntrollu di a qualità di i dati grezzi
●Clustering OTU/De-noise (ASV)
●Annutazione OTU
●Analisi di a diversità alfa: parechji indici, cumpresi Shannon, Simpson è ACE.
●Analisi di a diversità beta
●Analisi intergruppu
●Analisi di currelazione: trà i fattori ambientali è a cumpusizione è a diversità di l'OUT
●Previsione di u genu funziunale 16S
Istogramma di a distribuzione tassonomica
Arburu filogeneticu di distribuzione di a cumunità
Analisi di a diversità alfa: ACE
indice
Analisi di a diversità beta: PCoA
Analisi intergruppi: ANOVA
Esplora i progressi facilitati da i servizii di sequenziamentu di ampliconi di BMKGene cù PacBio attraversu una cullezzione curata di publicazioni.
Gao, X. è Wang, H. (2023) 'Analisi comparativa di i profili è di e funzioni batteriche di u rumine durante l'adattazione à diverse fenologie (rigenerazione vs. erbosa) in e pecure merino alpine cù duie fasi di crescita in un prato alpino', Fermentation, 9(1), p. 16. doi: 10.3390/FERMENTATION9010016/S1.
Li, S. et al. (2023) 'Cattura di a materia scura microbiana in i terreni desertichi utilizendu a metagenomica basata nantu à a culturomica è l'analisi à alta risoluzione', npj Biofilms and Microbiomes 2023 9:1, 9(1), pp. 1–14. doi: 10.1038/s41522-023-00439-8.
Mu, L. et al. (2022) 'Effetti di i sali di l'acidi grassi nantu à e caratteristiche di fermentazione, a diversità batterica è a stabilità aerobica di l'insilatu mistu preparatu cù erba medica, paglia di risu è crusca di granu', Journal of the Science of Food and Agriculture, 102(4), pp. 1475–1487. doi: 10.1002/JSFA.11482.
Yang, J. et al. (2023) 'L'interazione trà i biomarcatori di stress ossidativu è a microbiota intestinale in l'effetti antioxidanti di estratti di Sonchus brachyotus DC. in u stress ossidativu intestinale induttu da oxazolone in pesci zebra adulti', Antioxidants 2023, Vol. 12, Pagina 192, 12(1), p. 192. doi: 10.3390/ANTIOX12010192.
