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PacBio-Trascriptome Full-length (Non-Reference)
A piattaforma Amplicon (16S/18S/ITS) hè sviluppata cù anni di sperienza in l'analisi di prughjetti di diversità microbica, chì cuntene analisi basi standardizzate è analisi persunalizate: l'analisi di basa copre u cuntenutu di l'analisi mainstream di a ricerca microbiana attuale, u cuntenutu di l'analisi hè riccu è cumpletu, è i risultati di l'analisi sò presentati in forma di rapporti di prughjettu;U cuntenutu di l'analisi persunalizata hè diversu.I campioni ponu esse selezziunati è i paràmetri ponu esse stabiliti in modu flessibile secondu u rapportu di analisi di basa è u scopu di ricerca, per rializà esigenze persunalizate.Sistema upirativu Windows, simplice è veloce.
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PacBio-Trascriptome Full-length (Non-Reference)
Pigliendu Pacific Biosciences (PacBio) Isoform sequencing data cum'è input, sta App hè capaci di identificà sequenze di trascrizione full-length (senza assemblea).Per cartografia di sequenze full-length contr'à u genoma di riferimentu, e trascrizioni ponu esse ottimisate da geni cunnisciuti, trascrizioni, regioni codificanti, etc. In questu casu, l'identificazione più precisa di strutture mRNA, cum'è splicing alternativu, etc.L'analisi cumuna cù i dati di sequenza di trascrittomi NGS permette una annotazione più cumpleta è una quantificazione più precisa in l'espressione à u livellu di trascrizione, chì benefiziu largamente l'espressione differenziale downstream è l'analisi funzionale.
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Toolkits
BMKCloud hè una piattaforma bioinformatica di punta chì furnisce una soluzione unica per i prugrammi genomici, chì hè largamente affidata da circadori in diverse aree cumprese mediche, agricule, ambientali, etc. BMKCloud hè impegnata à furnisce servizii integrati, affidabili è efficaci cumpresi piattaforme è strumenti di analisi bioinformatica. , risorse informatiche, basa di dati publica, corsi in linea bioinformatici, etc. BMKCloud hà parechji strumenti bioinformatici friquenti chì includenu l'annotazione di u genu, l'arnesi geneticu evolutivu, ncRNA, u cuntrollu di qualità di dati, assemblea, allineamentu, estrazione di dati, mutazioni, statistiche, generatore di figure, sequenza. analisi, etc.
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petit RNA
I picculi RNA sò tipu di RNA non codificante curtu cù una durata media di 18-30 nt, cumprese miRNA, siRNA è piRNA.Questi picculi RNA sò stati massivamenti rappurtati per esse implicati in diversi prucessi biològichi cum'è a degradazione di mRNA, l'inibizione di a traduzzione, a furmazione di heterochromatin, etc. L'analisi di sequenza di SmallRNA hè stata largamente applicata in studii nantu à u sviluppu di l'animali / piante, a malatia, u virus, etc. A piattaforma di analisi di sequenza hè custituita da analisi standard è data mining avanzata.In basa di dati RNA-seq, l'analisi standard pò ottene l'identificazione è a predizione di miRNA, a previsione di geni di destinazione di miRNA, l'analisi di l'annotazione è l'espressione.L'analisi avanzata permette a ricerca è l'estrazione di miRNA persunalizati, a generazione di diagrammi Venn, miRNA è a creazione di rete di geni di destinazione.
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NGS-WGS (Illumina/BGI)
NGS-WGS hè una piattaforma di analisi di re-sequenza di genoma intera, chì hè sviluppata nantu à a basa di una ricca sperienza in Biomarker Technologies.Questa piattaforma faciule d'utilizà permette a presentazione rapida di un flussu di travagliu di analisi integrata, semplicemente stabilisce uni pochi di parametri basi, chì si adatta à i dati di sequenza di DNA generati sia da a piattaforma Illumina sia da a piattaforma di sequenza BGI.Sta piattaforma hè implementata nantu à u servitore di l'informatica d'altu rendiment, chì permette l'analisi di dati altamente efficiente in un tempu assai limitatu.L'estrazione di dati persunalizati hè dispunibule nantu à a basa di l'analisi standard, cumpresa a ricerca di geni mutati, u disignu di primer PCR, etc.
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mRNA (riferimentu)
U transcriptome hè u ligame trà l'infurmazione genetica genomica è u proteoma di a funzione biologica.A regulazione di u livellu trascrizionale hè u modu di regulazione più impurtante è più studiatu di l'organisimi.A sequenza di u transcriptome pò sequenzià u transcriptome in ogni puntu in u tempu o in ogni cundizione, cù una risoluzione precisa à un unicu nucleotide. Pò riflette dinamicamente u livellu di trascrizzione genica, simultaneamente identificà è quantificà trascrizioni rari è normali, è furnisce l'infurmazioni strutturali di trascrizioni specifiche di mostra.
Attualmente, a tecnulugia di sequencing transcriptome hè stata largamente usata in l'agronomia, a medicina è altri campi di ricerca, cumprese a regulazione di u sviluppu di l'animali è di e piante, l'adattazione ambientale, l'interazzione immune, a localizazione di geni, l'evoluzione genetica di e spezie è a rilevazione di tumori è malatie genetiche.
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Metagenomica (NGS)
Questa piattaforma di analisi hè pensata per l'analisi di dati metagenomici di fucile nantu à a basa di anni di sperienza.Hè custituitu un flussu di travagliu integratu chì cuntene diverse analisi di metagenomica cumune cum'è trattamentu di dati, studii à livellu di spezie, studii à livellu di funzione genica, binning metagenome, ecc. , paràmetru, generazione di figura persunalizata, etc.
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LncRNA
Long non-coding RNAs (lncRNA) sò un tipu di trascrizioni cù una lunghezza più di 200 nt, chì ùn sò micca capaci di codificà e proteine.L'evidenza cumulativa suggerisce chì a maiò parte di lncRNAs sò assai probabili di esse funziunali.Tecnulugie di sequencing high-throughput è strumenti di analisi bioinformatica ci permettenu di revelà sequenze di lncRNA è infurmazioni di posizionamentu in modu più efficiente è ci portanu à scopre lncRNAs cù funzioni regulatori cruciali.BMKCloud hè fieru di furnisce à i nostri clienti una piattaforma di analisi di sequenza di lncRNA per ottene una analisi lncRNA rapida, affidabile è flessibile.
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GWAS
U studiu di l'associazione di u genoma (GWAS) hà u scopu di identificà varianti genetichi (genotipu) chì sò assuciati cù caratteristiche specifiche (fenotipu).Studi GWA investiganu i marcatori genetichi attraversanu u genoma sanu di un gran numaru di individui è predice l'associazioni genotipu-fenotipu per analisi statistiche à livellu di pupulazione.A resequenza di u genoma sanu pò scopre tutte e varianti genetiche.Accoppiendu cù dati fenotipichi, GWAS pò esse processatu per identificà SNP, QTL è geni candidati, chì sustenenu fermamente l'allevamentu mudernu di animali / piante.SLAF hè una strategia di sequenza di genoma simplificata sviluppata da sè, chì scopre marcatori distribuiti in tuttu u genoma, SNP.Questi SNP, cum'è marcatori genetichi moleculari, ponu esse processati per studii d'associazione cù caratteristiche mirate.Hè una strategia costu-efficace in l'identificazione di tratti cumplessi associati variazioni genetiche.
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Nanopore Trascrittomica a piena lunghezza
Isoforme alternative cumplesse è variabili in l'organisimi sò meccanismi genetichi impurtanti per regulà l'espressione genica è a diversità di prutezione.L'identificazione precisa di e strutture di trascrizione hè a basa per un studiu approfonditu di i mudelli di regulazione di l'espressione genica.A piattaforma di sequenza di Nanopore hà purtatu cù successu u studiu transcriptomicu à livellu isoforme.Questa piattaforma di analisi hè pensata per analizà e dati RNA-Seq generati nantu à a piattaforma Nanopore nantu à a basa di u genoma di riferimentu, chì ottene analisi qualitative è quantitative in u livellu di gene è in u livellu di trascrizioni.
