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[Copia] Sequenziamentu di l'ARNm eucarioticu-NGS

U sequenziamentu di l'mRNA, una tecnulugia versatile, permette a prufilatura cumpleta di tutti i trascritti di mRNA in e cellule in cundizioni specifiche. Cù e so applicazioni à larga scala, questu strumentu d'avanguardia svela profili d'espressione genica intricati, strutture geniche è meccanismi moleculari assuciati à diversi prucessi biologichi. Ampiamente aduttatu in a ricerca fundamentale, a diagnostica clinica è u sviluppu di farmaci, u sequenziamentu di l'mRNA offre insights nantu à e cumplessità di a dinamica cellulare è di a regulazione genetica, suscitendu a curiosità nantu à u so putenziale in vari campi.

Piattaforma: Illumina NovaSeq X; DNBSEQ-T7


Dettagli di u serviziu

Bioinformatica

Risultati di a Dimostrazione

Publicazioni in evidenza

Funziunalità

● Cattura di poli mRNA prima di a preparazione di a biblioteca

● Preparazione opzionale di a biblioteca di mRNA direzionale per permette l'ottenimentu di dati di sequenziamentu specifichi di u filamentu

● Analisi bioinformatica di l'espressione genica è di a struttura di i trascritti

 

Vantaghji

Una vasta cumpetenzaA nostra squadra hà trattatu più di 600 000 campioni in BMKgene, chì abbraccianu diversi tipi di campioni cum'è culture cellulari, tessuti è fluidi corporei. Purtemu una ricchezza di sperienza à ogni prughjettu è avemu cumpletatu cù successu più di 100 000 prughjetti mRNA-Seq in diversi duminii di ricerca.

Cuntrollu di qualità rigorosuImplementemu punti di cuntrollu fundamentali in tutte e tappe, da a preparazione di campioni è biblioteche à u sequenziamentu è a bioinformatica. Stu monitoraghju meticulosu garantisce a consegna di risultati di alta qualità in modu consistente, assicurenduvi chì u vostru prughjettu hè in mani affidabili.

Annotazione cumpletaAdupremu parechje basi di dati per annotà funziunalmente i Geni Espressi Differenzialmente (DEG) è realizà analisi d'arricchimentu currispondenti. Questu approcciu cumpletu furnisce infurmazioni nantu à i prucessi cellulari è moleculari chì sò à a basa di a risposta di u trascrittoma, assicurendu chì site cumpletamente infurmatu nantu à i risultati di u vostru prughjettu.

Assistenza post-venditaU nostru impegnu si stende oltre u cumpletamentu di u prugettu cù un periodu di serviziu post-vendita di 3 mesi. Durante questu tempu, offremu seguitu di u prugettu, assistenza per a risoluzione di i prublemi è sessioni di dumande è risposte per risponde à qualsiasi dumanda riguardu à i risultati.

Requisiti di Campione è Cunsegna

Biblioteca Strategia di sequenziamentu Dati cunsigliati Cuntrollu di qualità
Arricchitu cù Poly A

Illumina PE150

DNBSEQ-T7

6-10 Gb

Q30≥85%

Requisiti di u campione:

Nucleotidi:

Requisiti minimi di campione:

 

Cunc. (ng/μl)

Quantità (μg)

Purezza

Integrità

Biblioteca Standard

≥ 10

≥ 0,2

OD260/280=1.7-2.5

OD260/230=0.5-2.5

Cuntaminazione limitata o assente di proteine ​​o DNA mostrata nantu à u gel.

Per e piante: RIN≥4.0;

Per l'animali: RIN≥4.5;

5.0≥28S/18S≥1.0;

elevazione di basa limitata o inesistente

Biblioteca Direzionale

≥ 10

≥ 0,2

OD260/280=1.7-2.5

OD260/230=0.5-2.5

Cuntaminazione limitata o assente di proteine ​​o DNA mostrata nantu à u gel.

Per e piante: RIN≥4.0;

Per l'animali: RIN≥4.5;

5.0≥28S/18S≥1.0;

elevazione di basa limitata o inesistente

Piante Animale Artropodi Sangue interu Cellule

Radice, fustu o petalu: 450 mg

Foglia o Seme: 300 mg

Frutta: 1,2 g

Core o Intestinu: 300 mg

Viscera o Cervellu: 240 mg

Musculu: 450 mg

Ossa, Capelli o Pelle: 1g

Insetti: 6g

Crustacei: 300 mg

1 tubu 106 cellule

Cunsegna di Campioni Raccomandata

Contenitore: Tubu di centrifuga di 2 ml (Ùn hè micca cunsigliatu l'usu di foglia d'aluminiu)

Esempiu di etichettatura: Gruppu + replica per esempiu A1, A2, A3; B1, B2, B3... ...

Spedizioni:

1. Ghiacciu seccu: I campioni devenu esse imballati in sacchetti è intarrati in ghiaccio seccu.

2. Tubi di tavola di RNA: I campioni di RNA ponu esse secchi in un tubu di stabilizazione di l'RNA (per esempiu, RNAstable®) è spediti à temperatura ambiente.

Requisiti di Campione è Cunsegna

123v

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  • Bioinformatica

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    Eucariota flussu di travagliu di analisi di sequenziamentu di mRNA

    Bioinformatica

    ØCuntrollu di a qualità di i dati crudi

    ØAllineamentu di u genomu di riferimentu

    ØAnalisi di a struttura di a trascrizione

    ØQuantificazione di l'espressione

    ØAnalisi di l'espressione differenziale

    ØAnnotazione è arricchimentu di e funzioni

    Allineamentu di u Genomu di Riferimentu

     

    图片1

     

    Saturazione di i dati

     

    3(1)

     

     

    Correlazione di campioni è valutazione di repliche biologiche

     

    图片2

     

    Geni espressi differenzialmente (DEG)

     

    4(1)

     

     

    Annotazione funzionale di i DEG

     

    6(1)

     

     

     

    Arricchimentu funzionale di i DEG

     

    图片4

     

    Esplora i progressi facilitati da i servizii di sequenziamentu di l'ARNm eucarioticu NGS di BMKGene attraversu una cullezzione curata di publicazioni.

     

    Huang, L. et al. (2023) 'U triclosan è u triclocarban indebuliscenu a capacità olfattiva di i pesci rossi limitendu u ricunniscimentu odorante, interrompendu a trasduzione di u signale olfattivo è disturbendu l'elaborazione di l'infurmazioni olfattive', Water Research, 233, p. 119736. doi: 10.1016/J.WATRES.2023.119736.

    Jia, LJ et al. (2023) 'Aspergillus fumigatus dirotta a p11 umana per ridirizionà i fagosomi chì cuntenenu funghi versu una via non degradativa', Cell Host & Microbe, 31(3), pp. 373-388.e10. doi: 10.1016/J.CHOM.2023.02.002.

    Jin, K. et al. (2022) 'Fattori di trascrizione TCP implicati in u sviluppu di i germogli di Ma Bamboo (Dendrocalamus latiflorus Munro)', Frontiers in Plant Science, 13, p. 884443. doi: 10.3389/FPLS.2022.884443/BIBTEX.

    Wen, X. et al. (2022) 'U genomu di Chrysanthemum lavandulifolium è u mecanismu moleculare chì sottende à diversi tipi di capituli', Horticulture Research, 9. doi: 10.1093/HR/UHAB022.

    Zhang, Yujie et al. (2023) 'Un nanoreattore à cascata per migliurà a terapia sonodinamica nantu à u cancru colorectal via l'aumentu sinergicu di ROS è u bloccu di l'autofagia', Nano Today, 49, p. 101798. doi: 10.1016/J.NANTOD.2023.101798.

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