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I prudutti

Sequencing DNA/RNA - Nanopore Sequencer

Sequencing ONT hè una sola molècula in tempu reale tecnulugia sequencing segnali elettricu basatu nantu nanopori, u principiu sequencing di ogni piattaforma hè u listessu.L'ADN / RNA a doppia fila si legarà à a proteina nanoporosa incrustata in u biofilm è si stende sottu à u guidatu di a proteina di u mutore, sottu l'azzione di a differenza di tensione da i dui lati di u biofilm, i filamenti di DNA / RNA passanu à traversu a proteina di u canale nanoporu à un certu puntu. tariffa.A causa di e diffirenzii di e proprietà chimiche di e diverse basi nantu à u filamentu di DNA / RNA, quandu una sola basa o molècula di DNA passa per u canali nanoporu, pruvucarà u cambiamentu di sferenti signali elettrici.Detectendu è currispundenu à sti signali, i tipi di basa currispondenti ponu esse calculati, è a rilevazione in tempu reale di a sequenza pò esse cumpletata.


Dettagli di serviziu

Risultatu Demo

Funzioni di dettagli di serviziu

Piattaforma

Dimensione di a biblioteca

Rendimentu di dati teorichi (per cellula)

Accuratezza di una sola basa

Applicazioni

Nanoporu

8Kb, 10kb, 20kb, Ultralongu, cDNA-PCR

70-90 Gb/cell

85-92%

Chiamata SV, De novo, Sequenza integrale, Iso-Seq, Annotazione genica, Rilevazione di metilazione di DNA

Vantaghji di serviziu

● Più di 5 anni di sperienza nantu à a piattaforma di sequenza PacBio cù millaie di prughjetti chjusi cù diverse spezie.
● BMKGENE hè un cumpagnu ufficiale di Oxford Nanopore, cù a certificazione RNA/DNA di doppia piattaforma.
● Ci sò mudelli mainstream di sequencers cù un equipamentu cumpletu è un throughput di sequencing suffirenziu.
● Basatu nantu à a piattaforma Nanopore, più di 10 ricerche animali è vegetali Denovo sò stati publicati in ghjurnali di fama internaziunale.

Requisiti di mostra


Tipu di mostra

A quantità

Concentrazione (Qubit ®)

Volume

Purità

Altri

DNA genomicu

Dipende da u requisitu di dati

 ≥ 20 ng/μl

≥ 15 μl

OD260/280 = 1,7-2,2;

OD260/230≥1.5;

Piccu chjaru à 260 nm, senza contaminazioni

A cuncentrazione deve esse misurata da Qubit è Qubit/Nanopore ≤ 2

RNA totale

≥ 1,2 μg

≥100μg/μl

≥ 15 μl

OD260/280 = 1,7-2,5;

OD260/230 = 0.5-2.5; senza contaminazioni

Valeur RIN ≥7,5

 

U flussu di travagliu di serviziu

preparazione di mostra

Preparazione di mostra

Preparazione di a biblioteca

Custruzzione di biblioteca

Sequencing

Sequencing

Analisi di dati

Analisi di dati

Esempiu QC

Cunsigliu di prughjettu


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  • Valutazione di a Qualità di Dati di Campione di DNA

    Table 1. Statistiche nantu à dati puliti.

    BMKID

    rawSeqNum

    rawSumBase

    cleanSeqNum

    cleanSumBase

    cleanN50Len

    cleanN90Len

    cleanMeanLen

    cleanMaxLen

    cleanMeanQual

    DNA_BMK01

    1.218.239

    26.37

    1 121 736

    25.90

    28.014

    15.764

    23.090

    143.181

    9

    Valutazione di a qualità di dati di l'RNA Sample

    Table 1. Statistiche nantu à dati puliti.

    FileName

    ClientID

    ReadNum

    BaseNum

    N50

    Lunghezza media

    Max Length

    MeanQscore

    RNA_BMK001

    C2

    8.947.708

    4.047.230.083

    398

    452

    129.227

    Q12

    Figura 1. Leghjite a distribuzione di lunghezza

    A3

    Figura 2. Distribuzione di u puntu di qualità di dati puliti

    A4

    Figura 3. Distribuzione di partitura di lunghezza è qualità di dati puliti

    A5

    ottene una citazione

    Scrivite u vostru missaghju quì è mandate à noi

    Mandate u vostru missaghju à noi: