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Sequenziamentu di DNA/RNA - Sequenziatore di nanopori

U sequenziamentu ONT hè una tecnulugia di sequenziamentu di signali elettrichi in tempu reale di una sola molécula basata nantu à i nanopori, u principiu di sequenziamentu di ogni piattaforma hè u listessu. U DNA/RNA à doppia catena si lega à a proteina nanoporosa incrustata in u biofilm è si srotola sottu à u guida di a proteina motrice, sottu l'azione di a differenza di tensione da i dui lati di u biofilm, i filamenti di DNA/RNA passanu per a proteina di u canale di i nanopori à una certa velocità. A causa di e differenze di e proprietà chimiche di e diverse basi nantu à u filamentu di DNA/RNA, quandu una sola basa o una molécula di DNA passa per u canale di i nanopori, pruvucarà u cambiamentu di diversi signali elettrichi. Rilevendu è currispundendu à questi signali, i tipi di basi currispondenti ponu esse calculati, è a rilevazione in tempu reale di a sequenza pò esse cumpletata.


Dettagli di u serviziu

Risultatu di a Dimostrazione

Funzioni di i dettagli di u serviziu

Piattaforma

Dimensione di a biblioteca

Rendimentu di dati teorichi (per cellula)

Precisione à basa unica

Applicazioni

Nanopore

8Kb, 10kb, 20kb, Ultralongu, cDNA-PCR

70-90 Gb/Cellula

85-92%

Chjama SV, De novo, Sequenziamentu cumpletu, Iso-Seq, Annotazione di geni, Rilevazione di metilazione di DNA

Vantaghji di u serviziu

● Più di 5 anni di sperienza nantu à a piattaforma di sequenziamentu PacBio cù migliaia di prughjetti chjusi cù diverse spezie.
● BMKGENE hè un partenariu ufficiale di Oxford Nanopore, cù certificazione RNA/DNA à doppia piattaforma.
● Ci sò mudelli principali di sequenziatori cù equipaggiamenti cumpleti è un rendimentu di sequenziamentu sufficiente.
● Basatu annantu à a piattaforma Nanopore, più di 10 ricerche Denovo annantu à l'animali è e piante sò state publicate in riviste internaziunali di fama.

Requisiti di Campione


Tipu di campione

Quantità

Cuncentrazione (Qubit ®)

Volume

Purezza

Altri

ADN genomicu

Dipende da u Requisitu di Dati

 ≥20ng/μl

≥15μl

OD260/280=1,7-2,2;

OD260/230≥1.5;

Piccu chjaru à 260 nm, senza contaminazioni

A cuncentrazione deve esse misurata da Qubit è Qubit/Nanopore ≤ 2

ARN tutale

≥1,2 μg

≥100μg/μl

≥15μl

OD260/280=1,7-2,5;

OD260/230=0.5-2.5; nisuna contaminazione

Valore RIN ≥7.5

 

Flussu di travagliu di serviziu

preparazione di u campione

Preparazione di u campione

Preparazione di a Biblioteca

Custruzzione di a biblioteca

Sequenziamentu

Sequenziamentu

Analisi di dati

Analisi di dati

Campione di QC

Cunsegna di u prugettu


  • Precedente:
  • Dopu:

  • Valutazione di a qualità di i dati di u campione di DNA

    Tavula 1. Statistiche nantu à dati puliti.

    BMKID

    rawSeqNum

    BaseSommariaCruda

    cleanSeqNum

    cleanSumBase

    cleanN50Len

    cleanN90Len

    cleanMeanLen

    cleanMaxLen

    cleanMeanQual

    DNA_BMK01

    1.218.239

    26.37

    1.121.736

    25,90

    28.014

    15.764

    23.090

    143.181

    9

    Valutazione di a qualità di i dati di u campione di RNA

    Tavula 1. Statistiche nantu à dati puliti.

    Nome di u schedariu

    ID Cliente

    LeghjeNum

    BaseNum

    N50

    Lunghezza Media

    Lunghezza Massima

    Puntuazione media Q

    RNA_BMK001

    C2

    8.947.708

    4.047.230.083

    398

    452

    129.227

    Q12

    Figura 1. Distribuzione di lunghezza di lettura

    A3

    Figura 2. Distribuzione di u puntuatu di qualità di i dati puliti

    A4

    Figura 3. Distribuzione di a lunghezza è di u puntuatu di qualità di i dati puliti

    A5

    ottene un preventivu

    Scrivite u vostru missaghju quì è mandateci lu

    Mandate u vostru missaghju à noi: