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Sequenziamentu di Picculi RNA Esosomali-Illumina

L'esosomi sò piccule vescicule secrete da e cellule, tipicamente cù un diametru chì varieghja da 30 à 100 nanometri. Queste vescicule cuntenenu diversi RNA. Frà i tipi di RNA in l'esosomi, u più cumunu è studiatu ampiamente hè u microRNA (miRNA). U miRNA hè una classa di picculi RNA non codificanti di circa 18-25 nucleotidi di lunghezza. Medianu u silenziamentu geneticu post-trascrizionale legandosi à a regione 3′ non tradotta (3′ UTR) di l'mRNA bersagli, regulendu cusì l'espressione genica. Per esempiu, l'esosomi secrete da certe cellule tumorali cuntenenu miRNA specifichi, cum'è miR-126 è miR-92a. Questi miRNA ponu influenzà l'espressione genica in e cellule riceventi è prumove l'angiogenesi tumorale (Tomohiro Umezu, et al., Oncogene, 2012).


Dettagli di u serviziu

bioinformatica

Risultati di a Dimostrazione

Funziunalità

● L'ARN tutale esosomale hè adupratu cum'è materiale d'entrata. Durante a purificazione, e perle di miRNA sò impiegate per isolà u miRNA.

● Analisi bioinformatica centrata nantu à a predizione di miRNA è i so bersagli.

Vantaghji di u serviziu

● Analisi bioinformatica cumpleta: Permette l'identificazione di miRNA cunnisciuti è novi, l'identificazione di miRNA bersagli, è l'annotazione funzionale currispundente è l'arricchimentu cù parechje basi di dati (KEGG, GO).

● Cuntrollu di qualità rigorosu: Implementemu punti di cuntrollu fundamentali in tutte e tappe, da a preparazione di campioni è biblioteche à u sequenziamentu è a bioinformatica. Stu monitoraghju meticulosu garantisce a consegna di risultati di alta qualità in modu consistente.

● Assistenza post-vendita: U nostru impegnu si stende oltre u cumpletamentu di u prugettu cù un periodu di serviziu post-vendita di 3 mesi. Durante questu tempu, offremu seguitu di u prugettu, assistenza per a risoluzione di i prublemi è sessioni di dumande è risposte per risponde à qualsiasi dumanda riguardu à i risultati.

Requisiti di Campione è Cunsegna

Biblioteca

Piattaforma

Dati cunsigliati

QC di i dati

Isolamentu di miRNA esosomali

Illumina SE50

10M-20M letture

Q30≥85%

Requisiti di Campione

Nucleotidi:

Quantità (ng)

Volume (μL)

40

20 anni

Tissutu:

Esosoma: 100 μL; 40 μg; >10^9 particelle/mL
Serumu/plasma: 5 mL
Supernatante di cultura cellulare: 100 mL
Urina: 100 mL
Saliva: 15 mL
Scaricu nasale: 15 mL
Liquidu cerebrospinale: 15 mL
Liquidu amnioticu: 50 mL
Sperma: 5 mL
Bile: 5 mL
Ascite: 50 mL
Latte: 15 mL
Fluidu folliculare: 15 mL
Supernatante fecale: 50 mL
Supernatante di cultura microbica: 100 mL
Tessutu animale: 3 g
Tessutu vegetale: 1 g

Cunsegna di Campioni Raccomandata

Contenitore: Tubu di centrifuga di 2 mL (Ùn hè micca cunsigliatu l'usu di foglia d'aluminiu)
Etichettatura di mostra: Raggruppamentu + replicazione per esempiu A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Spedizioni:
1. Ghiacciu seccu: I campioni devenu esse imballati in sacchetti è intarrati in ghiaccio seccu.
2. Tubi RNAstabili: I campioni di RNA ponu esse secchi in un tubu di stabilizazione di l'RNA (per esempiu, RNAstable®) è spediti à temperatura ambiente.

Flussu di travagliu di serviziu

Campione di QC

Cuncepimentu di l'esperimentu

consegna di campioni

Cunsegna di campioni

Esperimentu pilotu

Estrazione di ARN

Preparazione di a Biblioteca

Custruzzione di a biblioteca

Sequenziamentu

Sequenziamentu

Analisi di dati

Analisi di dati

Servizii dopu a vendita

Servizii dopu a vendita


  • Precedente:
  • Dopu:

  • Bioinformatica

    fgerbn2

    ● Cuntrollu di a qualità di i dati grezzi
    ● Classificazione di l'sRNA
    ● Allineamentu à un genomu di riferimentu
    ● Identificazione di miRNA cunnisciuti è novi
    ● Analisi di l'espressione differenziale di miRNA
    ● Annotazione funzionale di i bersagli di miRNA

    Identificazione di miRNA: struttura è prufundità

     

     

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    Espressione differenziale di miRNA - raggruppamentu gerarchicu

     

     

    图片34

     

    Annotazione funzionale di u bersagliu di miRNA espressi in modu differenziale

     

     

    图片35

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