Analisi di l'Associazione à livellu di u genomu
Flussu di travagliu
Vantaghji di u serviziu
●Ampia cumpetenza è registri di publicazioneCù l'esperienza accumulata in GWAS, BMKGene hà cumpletatu centinaie di prughjetti di spezie in a ricerca di pupulazione GWAS, hà aiutatu i circadori à publicà più di 100 articuli, è u fattore d'impattu cumulativu hà righjuntu 500.
● Analisi bioinformatica cumpleta: u flussu di travagliu include l'analisi di l'associazione SNP-trait, furnendu un inseme di geni candidati è a so annotazione funzionale currispondente.
●Squadra bioinformatica altamente qualificata è ciclu d'analisi cortuCù una grande sperienza in l'analisi genomica avanzata, a squadra di BMKGene furnisce analisi cumplete cù un tempu di risposta rapidu.
●Assistenza post-vendita:U nostru impegnu si stende oltre u cumpletamentu di u prugettu cù un periodu di serviziu post-vendita di 3 mesi. Durante questu tempu, offremu seguitu di u prugettu, assistenza per a risoluzione di i prublemi è sessioni di dumande è risposte per risponde à qualsiasi dumanda riguardu à i risultati.
Specifiche è esigenze di serviziu
| Tipu di sequenziamentu | Scala di pupulazione cunsigliata | Strategia di sequenziamentu | Requisiti di nucleotidi |
| Sequenziamentu di u Genomu Interu | 200 campioni | 10 volte | Cuncentrazione: ≥ 1 ng/ µL Quantità tutale ≥ 30ng Degradazione o contaminazione limitata o inesistente |
| Frammentu Amplificatu à Locu Specificu (SLAF) | Prufundità di l'etichetta: 10x Numeru di etichette: < 400 Mb: WGS hè cunsigliatu < 1 Gb: 100K tag 1 Gb > 2Gb: 300K etichette Massimu 500k tag | Cuncentrazione ≥ 5 ng/µL Quantità tutale ≥ 80 ng Nanodrop OD260/280=1.6-2.5 Gel d'agarosa: nisuna o limitata degradazione o contaminazione
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Selezzione di Materiali
Diverse varietà, sottuspezie, razze autoctone / banche di geni / famiglie miste / risorse selvatiche
Diverse varietà, sottospecie, varietà autoctone
Famiglia di mezu-fratellu/famiglia di fratelli cumpleti/risorse salvatiche
Flussu di travagliu di serviziu
Cuncepimentu di l'esperimentu
Cunsegna di campioni
Estrazione di ARN
Custruzzione di a biblioteca
Sequenziamentu
Analisi di dati
Servizii dopu a vendita
Include l'analisi seguente:
- Analisi di l'associazione à livellu di u genomu: mudellu LM, LMM, EMMAX, FASTLMM
- Annotazione funzionale di i geni candidati
Analisi di l'associazione SNP-trait - Graficu di Manhattan
Analisi di l'associazione SNP-trait - graficu QQ
Esplora i progressi facilitati da i servizii de GWAS di BMKGene attraversu una cullezzione curata di publicazioni:
Lv, L. et al. (2023) 'Approfondimenti nantu à a basa genetica di a tolleranza à l'ammoniaca in a vongole Sinonovacula constricta per mezu di un studiu d'associazione à livellu di u genomu',Acquacultura, 569, p. 739351. doi: 10.1016/J.AQUACULTURE.2023.739351.
Li, X. et al. (2022) 'L'analisi multi-omiche di 398 accessioni di miglio di coda di volpe rivelanu regioni genomiche associate à a domesticazione, i tratti metaboliti è l'effetti antiinflamatori',Pianta moleculare, 15 (8), pp. 1367-1383. doi: 10.1016/j.molp.2022.07.003.
Li, J. et al. (2022) 'Mappatura di l'Associazione à u Genomu di Fenotipi Hulless Barely in Ambiente Siccu',Frontiere in Scienza Vegetale, 13, p. 924892. doi: 10.3389/FPLS.2022.924892/BIBTEX.
Zhao, X. et al. (2021) 'GmST1, chì codifica una sulfotransferasi, cunferisce resistenza à i ceppi di virus di u mosaicu di a soia G2 è G3',Pianta, Cellula è Ambiente, 44 (8), pp 2777-2792. doi: 10.1111/PCE.14066.
